MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 27908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020834	ATC	2	6	135781	135786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335381
1502	NC_020834	TAT	2	6	135960	135965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335381
1503	NC_020834	GAT	2	6	136017	136022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335381
1504	NC_020834	GAA	2	6	136154	136159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335381
1505	NC_020834	TAA	2	6	136351	136356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335382
1506	NC_020834	CAT	2	6	136360	136365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335382
1507	NC_020834	AAT	2	6	136421	136426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335382
1508	NC_020834	ACT	2	6	136578	136583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335382
1509	NC_020834	CAT	2	6	136669	136674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335382
1510	NC_020834	TCT	2	6	136836	136841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335382
1511	NC_020834	ATC	2	6	137079	137084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335382
1512	NC_020834	ACC	2	6	137121	137126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335382
1513	NC_020834	TAT	2	6	137330	137335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335383
1514	NC_020834	GCA	2	6	137505	137510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335383
1515	NC_020834	AGC	2	6	137519	137524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335383
1516	NC_020834	GGT	2	6	137526	137531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335383
1517	NC_020834	GCC	2	6	137683	137688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335383
1518	NC_020834	TGC	2	6	137765	137770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335383
1519	NC_020834	AGT	2	6	137774	137779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335383
1520	NC_020834	GAC	2	6	137910	137915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335383
1521	NC_020834	TAC	2	6	137969	137974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335383
1522	NC_020834	ATT	2	6	138041	138046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335383
1523	NC_020834	TCT	3	9	138157	138165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335383
1524	NC_020834	ATT	2	6	138344	138349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335383
1525	NC_020834	CTT	2	6	138470	138475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335383
1526	NC_020834	ATT	2	6	138495	138500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335383
1527	NC_020834	ACC	2	6	138519	138524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335383
1528	NC_020834	TTA	2	6	138612	138617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335383
1529	NC_020834	GGT	2	6	138842	138847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335384
1530	NC_020834	TGA	2	6	138868	138873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335384
1531	NC_020834	TGC	2	6	138944	138949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335384
1532	NC_020834	AAT	2	6	139118	139123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335385
1533	NC_020834	TGC	3	9	139338	139346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335386
1534	NC_020834	GCC	2	6	139591	139596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335386
1535	NC_020834	GAT	2	6	139747	139752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335386
1536	NC_020834	TGG	2	6	139815	139820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335386
1537	NC_020834	TCA	2	6	139943	139948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335386
1538	NC_020834	ATT	2	6	139977	139982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335386
1539	NC_020834	TTA	2	6	140104	140109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335387
1540	NC_020834	GTG	2	6	140233	140238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335387
1541	NC_020834	GTC	2	6	140360	140365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335387
1542	NC_020834	TGT	2	6	140615	140620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335387
1543	NC_020834	TCA	2	6	140704	140709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335387
1544	NC_020834	CGG	2	6	140733	140738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335387
1545	NC_020834	CAA	2	6	140782	140787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335387
1546	NC_020834	AAG	2	6	140816	140821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335387
1547	NC_020834	GAA	2	6	140829	140834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335387
1548	NC_020834	TTA	2	6	140902	140907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335387
1549	NC_020834	TGA	2	6	140997	141002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335387
1550	NC_020834	AGA	2	6	141051	141056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335387
1551	NC_020834	TGT	2	6	141075	141080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335387
1552	NC_020834	GGT	2	6	141274	141279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335387
1553	NC_020834	CTT	2	6	141294	141299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335387
1554	NC_020834	AAG	2	6	141353	141358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335387
1555	NC_020834	GAA	2	6	141418	141423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335387
1556	NC_020834	CGC	2	6	141517	141522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335387
1557	NC_020834	AGA	2	6	141540	141545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335387
1558	NC_020834	AGA	2	6	141549	141554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335387
1559	NC_020834	AAG	2	6	141759	141764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335388
1560	NC_020834	CAA	2	6	141779	141784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335388
1561	NC_020834	GGT	2	6	141860	141865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335388
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1567	NC_020834	AAC	2	6	142418	142423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335389
1568	NC_020834	CTT	2	6	142438	142443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335389
1569	NC_020834	CGG	2	6	142449	142454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335389
1570	NC_020834	CGA	2	6	142528	142533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335389
1571	NC_020834	CTT	2	6	142591	142596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335389
1572	NC_020834	GCT	2	6	142770	142775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335389
1573	NC_020834	TCA	2	6	142791	142796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335389
1574	NC_020834	GTA	2	6	142845	142850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335389
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1578	NC_020834	GCC	2	6	143285	143290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335389
1579	NC_020834	CTG	2	6	143390	143395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335389
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1583	NC_020834	ACA	2	6	143821	143826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335390
1584	NC_020834	CAG	2	6	143835	143840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335390
1585	NC_020834	GGT	2	6	143910	143915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335390
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1587	NC_020834	GTA	2	6	144029	144034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335390
1588	NC_020834	GGA	2	6	144177	144182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335390
1589	NC_020834	TAA	2	6	144291	144296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335390
1590	NC_020834	TGT	2	6	144479	144484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335391
1591	NC_020834	ATT	2	6	144493	144498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335391
1592	NC_020834	GCG	2	6	144681	144686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335391
1593	NC_020834	AAT	2	6	144707	144712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335391
1594	NC_020834	CAC	2	6	144769	144774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335391
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1599	NC_020834	CAC	2	6	145237	145242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335391
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1601	NC_020834	TTC	2	6	145615	145620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335392
1602	NC_020834	CAG	2	6	145671	145676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335392
1603	NC_020834	TTC	2	6	145730	145735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335392
1604	NC_020834	GTT	2	6	145779	145784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335392
1605	NC_020834	TAA	2	6	145860	145865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335392
1606	NC_020834	CCT	2	6	145869	145874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335392
1607	NC_020834	CTG	2	6	145878	145883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335392
1608	NC_020834	CAA	2	6	145884	145889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335392
1609	NC_020834	ATC	2	6	145952	145957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335392
1610	NC_020834	CAG	2	6	145965	145970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335392
1611	NC_020834	AAC	2	6	145975	145980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335392
1612	NC_020834	ACC	2	6	145981	145986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335392
1613	NC_020834	ATC	2	6	146036	146041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335392
1614	NC_020834	ATT	2	6	146059	146064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335392
1615	NC_020834	TTC	2	6	146161	146166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335392
1616	NC_020834	AAG	2	6	146260	146265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335392
1617	NC_020834	GTG	2	6	146435	146440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335392
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1619	NC_020834	TCT	2	6	146477	146482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335392
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1976	NC_020834	ATT	2	6	180938	180943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335423
1977	NC_020834	TAC	2	6	180998	181003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
1978	NC_020834	TGC	2	6	181013	181018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335423
1979	NC_020834	TTA	2	6	181024	181029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335423
1980	NC_020834	TAT	2	6	181082	181087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335423
1981	NC_020834	TGG	2	6	181127	181132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335423
1982	NC_020834	ATA	2	6	181171	181176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335423
1983	NC_020834	TAC	2	6	181196	181201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
1984	NC_020834	AGC	2	6	181237	181242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335423
1985	NC_020834	GTT	2	6	181276	181281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335423
1986	NC_020834	TCA	2	6	181369	181374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
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1988	NC_020834	ATC	2	6	181527	181532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
1989	NC_020834	CTT	2	6	181604	181609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335423
1990	NC_020834	TGC	2	6	181632	181637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335423
1991	NC_020834	AGT	2	6	181722	181727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335423
1992	NC_020834	CCA	2	6	181969	181974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335423
1993	NC_020834	GCC	2	6	182005	182010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335423
1994	NC_020834	TCA	2	6	182063	182068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
1995	NC_020834	TTA	2	6	182251	182256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335424
1996	NC_020834	ATA	2	6	182286	182291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
1997	NC_020834	ATA	3	9	182306	182314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
1998	NC_020834	AAT	2	6	182339	182344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
1999	NC_020834	CAG	2	6	182461	182466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335424
2000	NC_020834	TAA	2	6	182533	182538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424

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