MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 27908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020834	CTT	2	6	265314	265319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335516
3002	NC_020834	TTC	2	6	265327	265332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335516
3003	NC_020834	ATT	2	6	265355	265360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335516
3004	NC_020834	CCA	2	6	265409	265414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335516
3005	NC_020834	GTA	2	6	265523	265528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335516
3006	NC_020834	CTT	2	6	265571	265576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335516
3007	NC_020834	CTT	2	6	265674	265679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335516
3008	NC_020834	TCT	2	6	265721	265726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335516
3009	NC_020834	TGT	2	6	265772	265777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335516
3010	NC_020834	TTA	2	6	265964	265969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335516
3011	NC_020834	TTC	3	9	265981	265989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335516
3012	NC_020834	TCA	2	6	266084	266089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335516
3013	NC_020834	TCT	2	6	266090	266095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335516
3014	NC_020834	AAT	2	6	266149	266154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335516
3015	NC_020834	AAT	2	6	266281	266286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335516
3016	NC_020834	CTT	2	6	266304	266309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335516
3017	NC_020834	AGA	2	6	266323	266328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335516
3018	NC_020834	TAA	2	6	266377	266382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335516
3019	NC_020834	TTC	2	6	266393	266398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335516
3020	NC_020834	ACT	2	6	266518	266523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335516
3021	NC_020834	ATT	2	6	266536	266541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335516
3022	NC_020834	TAT	3	9	266628	266636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335516
3023	NC_020834	CAC	2	6	266664	266669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335516
3024	NC_020834	TCC	2	6	266752	266757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472335516
3025	NC_020834	TCA	2	6	267074	267079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335517
3026	NC_020834	TCA	2	6	267191	267196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335517
3027	NC_020834	CGC	2	6	267230	267235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335517
3028	NC_020834	TTA	2	6	267290	267295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335517
3029	NC_020834	TTC	2	6	267319	267324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335517
3030	NC_020834	TCA	2	6	267390	267395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335517
3031	NC_020834	TTC	2	6	267510	267515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335517
3032	NC_020834	ATT	2	6	267560	267565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335517
3033	NC_020834	TTC	2	6	268169	268174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335519
3034	NC_020834	ATG	2	6	268210	268215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335519
3035	NC_020834	TGA	2	6	268635	268640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335520
3036	NC_020834	TGA	2	6	268773	268778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335520
3037	NC_020834	ACT	2	6	268904	268909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335520
3038	NC_020834	AAC	2	6	269162	269167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335520
3039	NC_020834	GTA	2	6	269233	269238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335520
3040	NC_020834	TTA	2	6	269249	269254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335520
3041	NC_020834	AGA	2	6	269334	269339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335520
3042	NC_020834	ATT	2	6	269407	269412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335520
3043	NC_020834	TGA	2	6	269505	269510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335520
3044	NC_020834	CAG	2	6	269638	269643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335520
3045	NC_020834	ACA	2	6	269658	269663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335520
3046	NC_020834	ATT	2	6	269677	269682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335520
3047	NC_020834	GAT	2	6	269707	269712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335520
3048	NC_020834	AAT	2	6	269734	269739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335520
3049	NC_020834	TAC	2	6	269884	269889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335520
3050	NC_020834	TTC	2	6	270051	270056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335520
3051	NC_020834	GAA	2	6	270281	270286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335521
3052	NC_020834	GCT	2	6	270343	270348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335521
3053	NC_020834	TCA	2	6	270447	270452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335521
3054	NC_020834	AAC	2	6	270552	270557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335521
3055	NC_020834	ATC	2	6	270679	270684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335521
3056	NC_020834	ATG	2	6	270743	270748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335521
3057	NC_020834	ATG	2	6	270765	270770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335521
3058	NC_020834	AAC	2	6	270894	270899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335521
3059	NC_020834	TGA	2	6	270968	270973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335522
3060	NC_020834	ATT	2	6	270975	270980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335522
3061	NC_020834	TTG	2	6	271060	271065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335522
3062	NC_020834	GTC	2	6	271074	271079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335522
3063	NC_020834	AGA	2	6	271085	271090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335522
3064	NC_020834	GAT	2	6	271182	271187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335522
3065	NC_020834	ACA	2	6	271201	271206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335522
3066	NC_020834	CCG	2	6	271225	271230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335522
3067	NC_020834	TGA	2	6	271249	271254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335522
3068	NC_020834	GTT	2	6	271362	271367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335522
3069	NC_020834	ATG	2	6	271455	271460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335522
3070	NC_020834	TAA	2	6	271469	271474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335522
3071	NC_020834	ATG	2	6	271497	271502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335522
3072	NC_020834	AGG	2	6	271519	271524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335522
3073	NC_020834	ATG	2	6	271558	271563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335522
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3076	NC_020834	AAT	2	6	271774	271779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335522
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3078	NC_020834	TTA	2	6	271953	271958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335523
3079	NC_020834	AGA	2	6	271967	271972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335523
3080	NC_020834	CAA	2	6	272037	272042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335523
3081	NC_020834	GGT	2	6	272055	272060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335523
3082	NC_020834	TGA	2	6	272114	272119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335523
3083	NC_020834	TGT	2	6	272135	272140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335523
3084	NC_020834	CAG	2	6	272218	272223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335523
3085	NC_020834	TCA	2	6	272249	272254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335523
3086	NC_020834	TAT	2	6	272312	272317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335523
3087	NC_020834	CAA	2	6	272463	272468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335523
3088	NC_020834	TGC	2	6	272534	272539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335523
3089	NC_020834	GAA	2	6	272780	272785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335523
3090	NC_020834	TAT	2	6	272838	272843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335523
3091	NC_020834	TCT	2	6	273097	273102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335524
3092	NC_020834	TCA	2	6	273183	273188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335524
3093	NC_020834	TAG	2	6	273414	273419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335525
3094	NC_020834	TGT	2	6	273472	273477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335525
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3098	NC_020834	TGT	2	6	273822	273827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335525
3099	NC_020834	GTA	2	6	273836	273841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335525
3100	NC_020834	GTC	2	6	274076	274081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335525
3101	NC_020834	TTC	2	6	274472	274477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335525
3102	NC_020834	TTC	2	6	274745	274750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335525
3103	NC_020834	TTA	2	6	274759	274764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335525
3104	NC_020834	GTT	2	6	275049	275054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335526
3105	NC_020834	CAC	2	6	275316	275321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335526
3106	NC_020834	TGA	2	6	275324	275329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335526
3107	NC_020834	CAA	2	6	275387	275392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335526
3108	NC_020834	CAT	2	6	275410	275415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335526
3109	NC_020834	TTG	2	6	275500	275505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335526
3110	NC_020834	CAT	3	9	275652	275660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335526
3111	NC_020834	ATT	2	6	275845	275850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335526
3112	NC_020834	ATG	2	6	275893	275898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335527
3113	NC_020834	TGT	2	6	276136	276141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335527
3114	NC_020834	TCA	2	6	276230	276235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335527
3115	NC_020834	GTG	2	6	276251	276256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335527
3116	NC_020834	TAA	2	6	276387	276392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335527
3117	NC_020834	TGG	2	6	276423	276428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335527
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3119	NC_020834	GAA	2	6	276498	276503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335527
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3346	NC_020834	ATA	2	6	296786	296791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335544
3347	NC_020834	CTT	2	6	297182	297187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335545
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3349	NC_020834	AAG	2	6	297223	297228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335545
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3352	NC_020834	CCA	2	6	297406	297411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335545
3353	NC_020834	TCA	2	6	297502	297507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335545
3354	NC_020834	ATT	2	6	297522	297527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335545
3355	NC_020834	GCT	2	6	297616	297621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335545
3356	NC_020834	GAT	2	6	297777	297782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335545
3357	NC_020834	CAT	2	6	297812	297817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335545
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3362	NC_020834	CAT	2	6	298681	298686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335546
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3474	NC_020834	GTC	2	6	310216	310221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335555
3475	NC_020834	AAT	2	6	310241	310246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335555
3476	NC_020834	GAT	2	6	310305	310310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335555
3477	NC_020834	TAC	2	6	310339	310344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335555
3478	NC_020834	CCA	2	6	310500	310505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335555
3479	NC_020834	TTG	2	6	310519	310524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335555
3480	NC_020834	CAT	2	6	310552	310557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335555
3481	NC_020834	TGC	3	9	310627	310635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335555
3482	NC_020834	ATC	2	6	310663	310668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335555
3483	NC_020834	CGA	2	6	311207	311212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335556
3484	NC_020834	GGC	3	9	311217	311225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335556
3485	NC_020834	AGG	2	6	311256	311261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335556
3486	NC_020834	AGC	2	6	311422	311427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335556
3487	NC_020834	AAT	2	6	311500	311505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335556
3488	NC_020834	AAT	2	6	311548	311553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335556
3489	NC_020834	GCA	2	6	311581	311586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335556
3490	NC_020834	CTG	2	6	311605	311610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335556
3491	NC_020834	AAT	2	6	311623	311628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335556
3492	NC_020834	CGG	2	6	311688	311693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335556
3493	NC_020834	TAA	2	6	311781	311786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335556
3494	NC_020834	ATG	2	6	311813	311818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335556
3495	NC_020834	ACT	2	6	311981	311986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335556
3496	NC_020834	GTG	2	6	312071	312076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335556
3497	NC_020834	GTG	2	6	312104	312109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335556
3498	NC_020834	ATA	2	6	312203	312208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335556
3499	NC_020834	ATG	2	6	312236	312241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335556
3500	NC_020834	TGA	2	6	312291	312296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335556

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