MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 97840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_002944	CGG	2	6	140014	140019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406230
2502	NC_002944	CAG	2	6	140057	140062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406230
2503	NC_002944	GTC	3	9	140087	140095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406230
2504	NC_002944	GCG	2	6	140096	140101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406230
2505	NC_002944	GCC	2	6	140109	140114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406230
2506	NC_002944	CAG	2	6	140132	140137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406230
2507	NC_002944	CGG	2	6	140152	140157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406230
2508	NC_002944	GCC	2	6	140169	140174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406230
2509	NC_002944	GAT	2	6	140189	140194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406230
2510	NC_002944	CCG	2	6	140206	140211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406230
2511	NC_002944	CGG	2	6	140235	140240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406230
2512	NC_002944	CGG	2	6	140287	140292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406230
2513	NC_002944	ACC	2	6	140310	140315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406230
2514	NC_002944	CAA	2	6	140351	140356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406230
2515	NC_002944	GCG	2	6	140391	140396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406230
2516	NC_002944	TGA	2	6	140413	140418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406230
2517	NC_002944	CAG	2	6	140447	140452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406230
2518	NC_002944	CGG	2	6	140479	140484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406230
2519	NC_002944	GCC	2	6	140527	140532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406230
2520	NC_002944	CGT	2	6	140617	140622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406231
2521	NC_002944	CAG	2	6	140705	140710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406231
2522	NC_002944	CGC	2	6	140809	140814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406231
2523	NC_002944	TGT	2	6	140833	140838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406231
2524	NC_002944	TGG	2	6	140869	140874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406231
2525	NC_002944	GCA	2	6	140887	140892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406231
2526	NC_002944	CAG	2	6	140936	140941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406231
2527	NC_002944	CGC	2	6	140968	140973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406231
2528	NC_002944	CAG	2	6	140984	140989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406231
2529	NC_002944	CAG	2	6	141014	141019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406231
2530	NC_002944	ATG	2	6	141036	141041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406231
2531	NC_002944	CCA	2	6	141079	141084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406231
2532	NC_002944	ATC	2	6	141117	141122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406231
2533	NC_002944	GCC	2	6	141241	141246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406231
2534	NC_002944	CTG	2	6	141248	141253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406231
2535	NC_002944	GGC	2	6	141277	141282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406231
2536	NC_002944	GCC	2	6	141287	141292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406231
2537	NC_002944	CAG	3	9	141386	141394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406231
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2539	NC_002944	CAT	2	6	141512	141517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406231
2540	NC_002944	CCA	2	6	141544	141549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406231
2541	NC_002944	CGC	2	6	141574	141579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406231
2542	NC_002944	TGC	2	6	141640	141645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406231
2543	NC_002944	GCA	2	6	141655	141660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406231
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2550	NC_002944	ATG	2	6	141924	141929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406231
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2552	NC_002944	GGC	3	9	141985	141993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406231
2553	NC_002944	GGC	2	6	142287	142292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406232
2554	NC_002944	GCT	2	6	142306	142311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406232
2555	NC_002944	GGT	2	6	142355	142360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406232
2556	NC_002944	TCC	2	6	142455	142460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406232
2557	NC_002944	GTC	2	6	142472	142477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406232
2558	NC_002944	CAC	2	6	142509	142514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406232
2559	NC_002944	CGC	2	6	142541	142546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406232
2560	NC_002944	AGC	2	6	142626	142631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406232
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2562	NC_002944	TCT	2	6	142645	142650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406232
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2564	NC_002944	GTC	2	6	142718	142723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406232
2565	NC_002944	GGC	2	6	142724	142729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406232
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2569	NC_002944	GAC	2	6	143165	143170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406233
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2572	NC_002944	CGT	2	6	143311	143316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406233
2573	NC_002944	CAG	2	6	143339	143344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406233
2574	NC_002944	GCA	2	6	143385	143390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406233
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2577	NC_002944	ACG	2	6	143484	143489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406233
2578	NC_002944	CTT	2	6	143491	143496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406233
2579	NC_002944	GAC	2	6	143522	143527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406233
2580	NC_002944	TGC	3	9	143535	143543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406233
2581	NC_002944	CAT	2	6	143548	143553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406233
2582	NC_002944	CGA	2	6	143563	143568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406233
2583	NC_002944	TCA	2	6	143625	143630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406233
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2585	NC_002944	CGA	2	6	143785	143790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406233
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2587	NC_002944	CGC	2	6	144230	144235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406234
2588	NC_002944	ACC	2	6	144280	144285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406234
2589	NC_002944	GGT	3	9	144299	144307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406234
2590	NC_002944	CCG	2	6	144319	144324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406234
2591	NC_002944	GCG	3	9	144358	144366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406234
2592	NC_002944	ACG	3	9	144385	144393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406234
2593	NC_002944	ACA	2	6	144421	144426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406234
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2598	NC_002944	GCC	2	6	144545	144550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406235
2599	NC_002944	TCC	2	6	144559	144564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406235
2600	NC_002944	CTC	2	6	144567	144572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406235
2601	NC_002944	GCG	2	6	144579	144584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406235
2602	NC_002944	GCG	2	6	144588	144593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406235
2603	NC_002944	CTG	2	6	144606	144611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406235
2604	NC_002944	CAG	2	6	144628	144633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406235
2605	NC_002944	GCG	2	6	144653	144658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406235
2606	NC_002944	CGG	2	6	144716	144721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406235
2607	NC_002944	CAC	2	6	144732	144737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406235
2608	NC_002944	CCG	2	6	144739	144744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406235
2609	NC_002944	CCA	2	6	144769	144774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406236
2610	NC_002944	GTC	2	6	144785	144790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406236
2611	NC_002944	TCG	2	6	144798	144803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406236
2612	NC_002944	GGC	2	6	144824	144829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406236
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2615	NC_002944	GGT	2	6	144941	144946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406236
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2618	NC_002944	CGG	3	9	145141	145149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406236
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2620	NC_002944	CGT	2	6	145193	145198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406236
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2741	NC_002944	GGT	2	6	150457	150462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406243
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2979	NC_002944	GCC	2	6	161509	161514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406257
2980	NC_002944	GGT	2	6	161531	161536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406257
2981	NC_002944	GCA	2	6	161552	161557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406257
2982	NC_002944	GGC	3	9	161576	161584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406257
2983	NC_002944	GTA	2	6	161640	161645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406257
2984	NC_002944	GAG	2	6	161653	161658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406257
2985	NC_002944	CGG	2	6	161804	161809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406257
2986	NC_002944	GGC	2	6	161838	161843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406257
2987	NC_002944	GAT	2	6	161889	161894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406257
2988	NC_002944	CTC	2	6	161922	161927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406257
2989	NC_002944	ATC	2	6	161929	161934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406257
2990	NC_002944	CCT	2	6	161972	161977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406257
2991	NC_002944	CCA	2	6	161990	161995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406257
2992	NC_002944	GCC	2	6	162001	162006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406257
2993	NC_002944	GTT	2	6	162008	162013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406257
2994	NC_002944	TTG	2	6	162187	162192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406257
2995	NC_002944	CAG	2	6	162228	162233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406257
2996	NC_002944	CCA	2	6	162272	162277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406257
2997	NC_002944	GAT	2	6	162375	162380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406257
2998	NC_002944	CGC	2	6	162410	162415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406257
2999	NC_002944	AGC	2	6	162460	162465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406257
3000	NC_002944	GCC	2	6	162507	162512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406257

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