MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 97840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002944	CGT	2	6	162558	162563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406257
3002	NC_002944	CCG	2	6	162566	162571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406257
3003	NC_002944	CAG	2	6	162582	162587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406257
3004	NC_002944	TCG	2	6	162595	162600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406257
3005	NC_002944	CGT	3	9	162632	162640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406257
3006	NC_002944	TAA	2	6	162641	162646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41406257
3007	NC_002944	ACC	2	6	162706	162711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406257
3008	NC_002944	TGA	2	6	163059	163064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406258
3009	NC_002944	GGC	2	6	163183	163188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406258
3010	NC_002944	CGG	2	6	163243	163248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406258
3011	NC_002944	CGA	2	6	163397	163402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406259
3012	NC_002944	TTC	2	6	163434	163439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406259
3013	NC_002944	ACC	2	6	163533	163538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406259
3014	NC_002944	ACG	2	6	163709	163714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406260
3015	NC_002944	GCT	2	6	163786	163791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406260
3016	NC_002944	CGG	2	6	163830	163835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406260
3017	NC_002944	CCG	2	6	163836	163841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406260
3018	NC_002944	TGG	2	6	163845	163850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406260
3019	NC_002944	CCG	2	6	163851	163856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406260
3020	NC_002944	CGA	2	6	163864	163869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406260
3021	NC_002944	GAT	2	6	163888	163893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406260
3022	NC_002944	CTG	2	6	163934	163939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406260
3023	NC_002944	TGA	2	6	163941	163946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406260
3024	NC_002944	TGG	2	6	164000	164005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406260
3025	NC_002944	GTG	2	6	164006	164011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406260
3026	NC_002944	CCG	2	6	164046	164051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406260
3027	NC_002944	CAG	2	6	164059	164064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406260
3028	NC_002944	GCC	3	9	164069	164077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406260
3029	NC_002944	GCG	2	6	164112	164117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406260
3030	NC_002944	GGC	2	6	164125	164130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406260
3031	NC_002944	AGC	2	6	164160	164165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406260
3032	NC_002944	AGC	2	6	164214	164219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406260
3033	NC_002944	CCG	3	9	164253	164261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406260
3034	NC_002944	TCG	2	6	164289	164294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406260
3035	NC_002944	CGA	2	6	164317	164322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406260
3036	NC_002944	TCG	2	6	164348	164353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406260
3037	NC_002944	CGG	2	6	164374	164379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406260
3038	NC_002944	CGG	2	6	164455	164460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406260
3039	NC_002944	CGA	2	6	164497	164502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406260
3040	NC_002944	CGG	2	6	164516	164521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406260
3041	NC_002944	GTG	2	6	164522	164527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406260
3042	NC_002944	CGT	2	6	164654	164659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406261
3043	NC_002944	GCA	2	6	164728	164733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406261
3044	NC_002944	TCA	2	6	164929	164934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406261
3045	NC_002944	CGT	2	6	164936	164941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406261
3046	NC_002944	GCG	2	6	164953	164958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406261
3047	NC_002944	CAC	2	6	164966	164971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406261
3048	NC_002944	CGG	2	6	164987	164992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406261
3049	NC_002944	GCC	2	6	165007	165012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406261
3050	NC_002944	CGA	2	6	165071	165076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406261
3051	NC_002944	CCG	2	6	165081	165086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406261
3052	NC_002944	CAT	2	6	165101	165106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406261
3053	NC_002944	GCG	2	6	165254	165259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406261
3054	NC_002944	TGA	2	6	165271	165276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406261
3055	NC_002944	TCG	2	6	165277	165282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406261
3056	NC_002944	TGA	2	6	165310	165315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406261
3057	NC_002944	TGC	2	6	165385	165390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406261
3058	NC_002944	GCA	2	6	165439	165444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406261
3059	NC_002944	CAT	2	6	165572	165577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406261
3060	NC_002944	GAA	2	6	165596	165601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406261
3061	NC_002944	CCG	2	6	165631	165636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406261
3062	NC_002944	CGC	2	6	165687	165692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3063	NC_002944	TTC	2	6	165788	165793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406262
3064	NC_002944	GCC	2	6	166019	166024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3065	NC_002944	CGC	2	6	166077	166082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3066	NC_002944	CCG	2	6	166086	166091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3067	NC_002944	TGG	3	9	166131	166139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406262
3068	NC_002944	CGG	2	6	166185	166190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406262
3069	NC_002944	CGG	2	6	166195	166200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406262
3070	NC_002944	GCT	3	9	166210	166218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406262
3071	NC_002944	TGG	2	6	166230	166235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406262
3072	NC_002944	GGT	2	6	166291	166296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406262
3073	NC_002944	GTG	3	9	166367	166375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406262
3074	NC_002944	GGT	2	6	166429	166434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406262
3075	NC_002944	GGT	2	6	166441	166446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406262
3076	NC_002944	CGC	2	6	166474	166479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
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3078	NC_002944	CGC	2	6	166560	166565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3079	NC_002944	GCC	2	6	166594	166599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3080	NC_002944	GAG	2	6	166691	166696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406262
3081	NC_002944	CGC	2	6	166741	166746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3082	NC_002944	TGC	2	6	166803	166808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406262
3083	NC_002944	CCG	2	6	166809	166814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3084	NC_002944	TGG	2	6	166863	166868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406262
3085	NC_002944	TGG	3	9	166878	166886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406262
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3088	NC_002944	CGC	2	6	166993	166998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3089	NC_002944	GCT	2	6	167020	167025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406262
3090	NC_002944	GGT	2	6	167032	167037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406262
3091	NC_002944	CGC	2	6	167053	167058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3092	NC_002944	CGA	2	6	167088	167093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406262
3093	NC_002944	CTG	2	6	167156	167161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406262
3094	NC_002944	CGG	4	12	167163	167174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406262
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3099	NC_002944	GGT	2	6	167520	167525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406263
3100	NC_002944	CGG	2	6	167529	167534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406263
3101	NC_002944	CAT	2	6	167541	167546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406263
3102	NC_002944	CAT	2	6	167598	167603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406263
3103	NC_002944	CGC	2	6	167666	167671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
3104	NC_002944	CCG	3	9	167680	167688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
3105	NC_002944	CCG	2	6	167707	167712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
3106	NC_002944	GCC	2	6	167721	167726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
3107	NC_002944	GCC	3	9	167748	167756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
3108	NC_002944	TTC	2	6	167774	167779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406263
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3110	NC_002944	CCG	2	6	167794	167799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
3111	NC_002944	CGC	2	6	167804	167809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
3112	NC_002944	GCG	3	9	167816	167824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406263
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3115	NC_002944	GCC	2	6	167880	167885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
3116	NC_002944	CCG	2	6	167890	167895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
3117	NC_002944	GTG	2	6	167911	167916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406263
3118	NC_002944	CAT	2	6	167937	167942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406263
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3120	NC_002944	CGA	2	6	168006	168011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406263
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3480	NC_002944	CGG	2	6	184732	184737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406275
3481	NC_002944	CTG	2	6	184757	184762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406275
3482	NC_002944	CGT	2	6	184774	184779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406275
3483	NC_002944	CCG	2	6	184815	184820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406275
3484	NC_002944	TGC	2	6	184836	184841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406275
3485	NC_002944	CGC	2	6	185003	185008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406275
3486	NC_002944	CCG	2	6	185012	185017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406275
3487	NC_002944	GCT	2	6	185023	185028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406275
3488	NC_002944	GCT	2	6	185179	185184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406275
3489	NC_002944	CCG	2	6	185260	185265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406276
3490	NC_002944	GCC	2	6	185274	185279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406276
3491	NC_002944	GCG	2	6	185288	185293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
3492	NC_002944	GGC	2	6	185328	185333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
3493	NC_002944	GCA	2	6	185347	185352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406276
3494	NC_002944	CTG	2	6	185357	185362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406276
3495	NC_002944	ATC	2	6	185424	185429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406276
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3497	NC_002944	GCC	2	6	185449	185454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406276
3498	NC_002944	GCG	2	6	185457	185462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
3499	NC_002944	GAC	2	6	185481	185486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406276
3500	NC_002944	GTC	2	6	185528	185533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406276

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