MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 97840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_002944	CGG	2	6	310562	310567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406391
6003	NC_002944	CCG	2	6	310647	310652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406391
6004	NC_002944	CGC	2	6	310681	310686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406391
6005	NC_002944	TGG	2	6	310740	310745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406391
6006	NC_002944	CGC	2	6	310747	310752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406391
6007	NC_002944	GCA	2	6	310768	310773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406391
6008	NC_002944	CGG	2	6	310807	310812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406391
6009	NC_002944	AGG	2	6	310841	310846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406392
6010	NC_002944	CGC	2	6	310848	310853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406392
6011	NC_002944	TCG	2	6	310944	310949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406392
6012	NC_002944	CGG	2	6	310986	310991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406392
6013	NC_002944	CAC	2	6	310999	311004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406392
6014	NC_002944	GCG	2	6	311018	311023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406392
6015	NC_002944	CGG	2	6	311058	311063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406392
6016	NC_002944	TGC	2	6	311079	311084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406392
6017	NC_002944	CAC	3	9	311092	311100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406392
6018	NC_002944	TCG	2	6	311150	311155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406392
6019	NC_002944	CGC	2	6	311193	311198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406392
6020	NC_002944	TCG	2	6	311219	311224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406392
6021	NC_002944	AGA	2	6	311241	311246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406392
6022	NC_002944	CTC	2	6	311293	311298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406392
6023	NC_002944	CAG	2	6	311323	311328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406392
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6025	NC_002944	GGC	2	6	311362	311367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406392
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6029	NC_002944	CGG	2	6	311464	311469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406392
6030	NC_002944	CGC	2	6	311481	311486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406392
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6032	NC_002944	CTG	2	6	311701	311706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406392
6033	NC_002944	GCC	2	6	311725	311730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406392
6034	NC_002944	GTG	2	6	311740	311745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406392
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6040	NC_002944	CGG	2	6	311931	311936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406392
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6051	NC_002944	CGT	2	6	312486	312491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406392
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6053	NC_002944	AGC	2	6	312563	312568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406392
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6056	NC_002944	GCT	2	6	312696	312701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406392
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6104	NC_002944	GCT	2	6	315137	315142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406393
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6107	NC_002944	GCC	2	6	315202	315207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406393
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6110	NC_002944	CGA	3	9	315281	315289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406393
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6482	NC_002944	CGA	2	6	334223	334228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161611210
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