MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 97840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002944	TGG	2	6	257461	257466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406333
5002	NC_002944	GCA	2	6	257470	257475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406333
5003	NC_002944	GCC	2	6	257495	257500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406333
5004	NC_002944	CAG	2	6	257579	257584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406333
5005	NC_002944	TGG	2	6	257625	257630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406333
5006	NC_002944	CGC	2	6	257659	257664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406333
5007	NC_002944	GCA	2	6	257689	257694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406333
5008	NC_002944	GCC	2	6	257721	257726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406333
5009	NC_002944	TCA	2	6	257728	257733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406333
5010	NC_002944	GCC	3	9	257828	257836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406333
5011	NC_002944	TGA	2	6	258016	258021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406333
5012	NC_002944	ACG	2	6	258104	258109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406334
5013	NC_002944	CGA	2	6	258249	258254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406334
5014	NC_002944	GCC	2	6	258272	258277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406334
5015	NC_002944	CCG	2	6	258289	258294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406334
5016	NC_002944	CGA	2	6	258321	258326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406334
5017	NC_002944	CGA	2	6	258399	258404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406334
5018	NC_002944	GCC	2	6	258415	258420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406334
5019	NC_002944	GAC	2	6	258424	258429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406334
5020	NC_002944	GCG	2	6	258532	258537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406335
5021	NC_002944	CGA	2	6	258640	258645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406335
5022	NC_002944	GCC	2	6	258704	258709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406335
5023	NC_002944	CGG	2	6	258737	258742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406335
5024	NC_002944	GCC	2	6	258754	258759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406335
5025	NC_002944	CAC	2	6	258788	258793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406335
5026	NC_002944	TCG	2	6	258798	258803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406335
5027	NC_002944	CCA	2	6	258841	258846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406335
5028	NC_002944	CCG	2	6	258937	258942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406335
5029	NC_002944	TTG	2	6	258954	258959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406335
5030	NC_002944	CGG	2	6	259429	259434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406336
5031	NC_002944	CGG	3	9	259455	259463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406336
5032	NC_002944	CGC	2	6	259465	259470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406336
5033	NC_002944	TGC	2	6	259476	259481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406336
5034	NC_002944	CAC	2	6	259552	259557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406336
5035	NC_002944	GCC	2	6	259619	259624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406336
5036	NC_002944	CGC	2	6	259636	259641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406336
5037	NC_002944	GCG	2	6	259737	259742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406336
5038	NC_002944	GCC	2	6	259748	259753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406336
5039	NC_002944	CTC	2	6	259756	259761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406336
5040	NC_002944	CGC	3	9	259896	259904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406336
5041	NC_002944	GAC	2	6	259922	259927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406336
5042	NC_002944	CAC	2	6	260023	260028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406336
5043	NC_002944	CGT	3	9	260034	260042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406336
5044	NC_002944	TCA	2	6	260141	260146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406336
5045	NC_002944	CTC	2	6	260182	260187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406336
5046	NC_002944	CGC	2	6	260191	260196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406336
5047	NC_002944	GCC	2	6	260366	260371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406337
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5049	NC_002944	CCG	2	6	260385	260390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406337
5050	NC_002944	CAG	2	6	260437	260442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406337
5051	NC_002944	CAA	2	6	260470	260475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406337
5052	NC_002944	CGA	2	6	260487	260492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406337
5053	NC_002944	CTG	2	6	260515	260520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406337
5054	NC_002944	GTC	2	6	260530	260535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406337
5055	NC_002944	GAT	2	6	260542	260547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406337
5056	NC_002944	GAA	2	6	260557	260562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406337
5057	NC_002944	AGC	2	6	260585	260590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406337
5058	NC_002944	ATC	2	6	260717	260722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406337
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5060	NC_002944	TGT	2	6	260745	260750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406337
5061	NC_002944	ATC	2	6	260762	260767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406337
5062	NC_002944	GCC	2	6	260769	260774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406337
5063	NC_002944	GCG	2	6	260802	260807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406337
5064	NC_002944	CGA	2	6	260838	260843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406337
5065	NC_002944	GAT	2	6	260887	260892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406337
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5069	NC_002944	CGG	2	6	261074	261079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406337
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5072	NC_002944	GAA	2	6	261246	261251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406338
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5074	NC_002944	CAG	2	6	261306	261311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406338
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5080	NC_002944	TCG	2	6	261490	261495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406338
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5090	NC_002944	TCG	2	6	262012	262017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406338
5091	NC_002944	GCG	2	6	262020	262025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406338
5092	NC_002944	GAC	3	9	262032	262040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406338
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5099	NC_002944	TCG	2	6	262317	262322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406339
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5101	NC_002944	TCG	2	6	262446	262451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406339
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5103	NC_002944	GCA	2	6	262624	262629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406339
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5105	NC_002944	GCC	2	6	262751	262756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406339
5106	NC_002944	CTT	2	6	262775	262780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406339
5107	NC_002944	GGC	2	6	262970	262975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406340
5108	NC_002944	CTC	2	6	263114	263119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406340
5109	NC_002944	CGT	2	6	263197	263202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406340
5110	NC_002944	CCT	2	6	263221	263226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406340
5111	NC_002944	AGC	2	6	263229	263234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406340
5112	NC_002944	GCT	2	6	263272	263277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406340
5113	NC_002944	TCG	2	6	263301	263306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406340
5114	NC_002944	CGT	3	9	263308	263316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406340
5115	NC_002944	CAT	2	6	263324	263329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406340
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5117	NC_002944	TCA	2	6	263364	263369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406340
5118	NC_002944	CGT	2	6	263420	263425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406341
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5120	NC_002944	CGC	2	6	263608	263613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406341
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5241	NC_002944	CGG	2	6	268443	268448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406344
5242	NC_002944	GCC	2	6	268460	268465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406344
5243	NC_002944	GCC	2	6	268513	268518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406344
5244	NC_002944	GTG	2	6	268526	268531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406344
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5253	NC_002944	CGT	2	6	268836	268841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406344
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5360	NC_002944	TCG	2	6	275448	275453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406352
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5476	NC_002944	TGC	2	6	281443	281448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406360
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5478	NC_002944	CGC	2	6	281495	281500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406360
5479	NC_002944	GTG	2	6	281538	281543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406360
5480	NC_002944	ACG	2	6	281551	281556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406360
5481	NC_002944	GGC	2	6	281608	281613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406360
5482	NC_002944	GCC	2	6	281625	281630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406360
5483	NC_002944	CAT	2	6	281720	281725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406360
5484	NC_002944	CGG	2	6	281761	281766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406360
5485	NC_002944	CGG	2	6	281792	281797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406360
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5491	NC_002944	GCC	2	6	282048	282053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406360
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