MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 97840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002944	GCG	2	6	78298	78303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406169
1502	NC_002944	CAA	2	6	78449	78454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406169
1503	NC_002944	GCG	2	6	78494	78499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406169
1504	NC_002944	CGG	2	6	78545	78550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406169
1505	NC_002944	CTT	2	6	78914	78919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406169
1506	NC_002944	TCT	2	6	78958	78963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406169
1507	NC_002944	TGT	2	6	79000	79005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406169
1508	NC_002944	CGG	2	6	79006	79011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406169
1509	NC_002944	CGA	2	6	79055	79060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406169
1510	NC_002944	GCG	2	6	79079	79084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406169
1511	NC_002944	CGA	2	6	79118	79123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406169
1512	NC_002944	GAT	2	6	79139	79144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406169
1513	NC_002944	TGG	3	9	79195	79203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406169
1514	NC_002944	GTC	2	6	79223	79228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406169
1515	NC_002944	CGT	2	6	79313	79318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406169
1516	NC_002944	AGC	2	6	79348	79353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406169
1517	NC_002944	AAG	2	6	79362	79367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406169
1518	NC_002944	CTG	2	6	79428	79433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406169
1519	NC_002944	CGG	2	6	79728	79733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406170
1520	NC_002944	TGT	2	6	79855	79860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406170
1521	NC_002944	GCA	2	6	79944	79949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406170
1522	NC_002944	GCA	3	9	79977	79985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406170
1523	NC_002944	CTG	2	6	80009	80014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406170
1524	NC_002944	TGG	2	6	80049	80054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406170
1525	NC_002944	GTC	2	6	80071	80076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406170
1526	NC_002944	CAC	2	6	80199	80204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406170
1527	NC_002944	CGG	2	6	80244	80249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406170
1528	NC_002944	CGA	2	6	80265	80270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406170
1529	NC_002944	CGG	2	6	80280	80285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406170
1530	NC_002944	GCC	2	6	80297	80302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406170
1531	NC_002944	CGA	2	6	80324	80329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406170
1532	NC_002944	AGC	3	9	80378	80386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406170
1533	NC_002944	CCA	2	6	80421	80426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406170
1534	NC_002944	TCA	2	6	80561	80566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406170
1535	NC_002944	AGT	2	6	80579	80584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406170
1536	NC_002944	CGG	2	6	80785	80790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406171
1537	NC_002944	CGT	2	6	80848	80853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406171
1538	NC_002944	ACG	2	6	80869	80874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406171
1539	NC_002944	GGC	2	6	81021	81026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406171
1540	NC_002944	TGG	2	6	81030	81035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406171
1541	NC_002944	ACC	2	6	81051	81056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406171
1542	NC_002944	GTC	2	6	81068	81073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406171
1543	NC_002944	CGA	2	6	81097	81102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406171
1544	NC_002944	GCA	2	6	81141	81146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406171
1545	NC_002944	CGG	2	6	81217	81222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406171
1546	NC_002944	TCG	2	6	81369	81374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406171
1547	NC_002944	CCG	2	6	81419	81424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406171
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1549	NC_002944	GGT	2	6	81749	81754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406172
1550	NC_002944	GCC	2	6	81756	81761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406172
1551	NC_002944	TTC	2	6	81774	81779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406172
1552	NC_002944	TCG	2	6	81817	81822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406172
1553	NC_002944	ACC	2	6	81859	81864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406172
1554	NC_002944	CGA	2	6	81902	81907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406172
1555	NC_002944	GCC	2	6	81960	81965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406172
1556	NC_002944	CGA	2	6	82001	82006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406172
1557	NC_002944	CTG	2	6	82008	82013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406172
1558	NC_002944	CCG	2	6	82097	82102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406172
1559	NC_002944	CGC	3	9	82103	82111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406172
1560	NC_002944	GCC	2	6	82119	82124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406172
1561	NC_002944	ATC	2	6	82131	82136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406172
1562	NC_002944	TGG	3	9	83688	83696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406173
1563	NC_002944	TCG	2	6	83709	83714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406173
1564	NC_002944	GGT	2	6	83725	83730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406173
1565	NC_002944	CCG	2	6	83792	83797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406173
1566	NC_002944	GAC	2	6	83842	83847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406173
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1568	NC_002944	CAC	2	6	83899	83904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406173
1569	NC_002944	CAG	2	6	84023	84028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406173
1570	NC_002944	GAG	2	6	84250	84255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406174
1571	NC_002944	ACG	2	6	84404	84409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1572	NC_002944	TCG	2	6	84590	84595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1573	NC_002944	GCC	2	6	84606	84611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406174
1574	NC_002944	CCG	2	6	84653	84658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406174
1575	NC_002944	TCG	3	9	84665	84673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406174
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1579	NC_002944	GTG	2	6	84811	84816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406174
1580	NC_002944	GCT	2	6	84819	84824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1581	NC_002944	CAT	2	6	84837	84842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406174
1582	NC_002944	CGG	2	6	84890	84895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406174
1583	NC_002944	AGG	2	6	84932	84937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406174
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1585	NC_002944	TAC	2	6	84970	84975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406174
1586	NC_002944	GGT	2	6	84999	85004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406174
1587	NC_002944	TCG	2	6	85025	85030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1588	NC_002944	GTG	3	9	85108	85116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406174
1589	NC_002944	GCC	2	6	85117	85122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406174
1590	NC_002944	TCG	2	6	85277	85282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1591	NC_002944	CTA	2	6	85326	85331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406174
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1593	NC_002944	CTG	2	6	85411	85416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1594	NC_002944	GCC	2	6	85539	85544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406174
1595	NC_002944	GCA	2	6	85598	85603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1596	NC_002944	AAG	2	6	85639	85644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406174
1597	NC_002944	CTG	2	6	85675	85680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1598	NC_002944	CGC	2	6	85716	85721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406174
1599	NC_002944	GAC	2	6	85723	85728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406174
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1601	NC_002944	CGG	2	6	85751	85756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406174
1602	NC_002944	CGA	2	6	85794	85799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1603	NC_002944	CTG	2	6	85860	85865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1604	NC_002944	CTG	2	6	85972	85977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1605	NC_002944	ACG	2	6	86023	86028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1606	NC_002944	GCC	2	6	86145	86150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406174
1607	NC_002944	GCC	2	6	86215	86220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406174
1608	NC_002944	TCA	3	9	86225	86233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406174
1609	NC_002944	AGG	2	6	86300	86305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406174
1610	NC_002944	CGG	2	6	86346	86351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406174
1611	NC_002944	TGA	2	6	86399	86404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406174
1612	NC_002944	CGG	2	6	86408	86413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406174
1613	NC_002944	TCA	3	9	86435	86443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406174
1614	NC_002944	CGC	2	6	86469	86474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406174
1615	NC_002944	TCG	2	6	86483	86488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1616	NC_002944	GCC	2	6	86512	86517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406174
1617	NC_002944	GCA	2	6	86541	86546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1618	NC_002944	TGC	2	6	86597	86602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406174
1619	NC_002944	GAG	3	9	86647	86655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406174
1620	NC_002944	GGT	2	6	86709	86714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406174
1621	NC_002944	CCG	2	6	86717	86722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406174
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1871	NC_002944	CCG	2	6	101598	101603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406192
1872	NC_002944	TGG	2	6	101613	101618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406192
1873	NC_002944	GCT	2	6	101724	101729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406192
1874	NC_002944	GCT	2	6	101802	101807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406192
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1986	NC_002944	AGC	2	6	113627	113632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406203
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1988	NC_002944	CGT	2	6	113757	113762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406203
1989	NC_002944	TGG	2	6	113798	113803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406203
1990	NC_002944	GGC	2	6	113808	113813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406203
1991	NC_002944	GTC	2	6	113836	113841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406203
1992	NC_002944	CTG	2	6	113851	113856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406203
1993	NC_002944	GGC	3	9	113911	113919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406203
1994	NC_002944	GCG	2	6	113930	113935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406203
1995	NC_002944	TCG	2	6	114029	114034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406203
1996	NC_002944	TGG	2	6	114045	114050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406203
1997	NC_002944	GCG	2	6	114059	114064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406203
1998	NC_002944	CGG	2	6	114114	114119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406203
1999	NC_002944	GTG	2	6	114178	114183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406203
2000	NC_002944	GCA	2	6	114255	114260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406203

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