MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 97840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002944	GAT	2	6	24880	24885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406121
502	NC_002944	GTT	2	6	24946	24951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406121
503	NC_002944	GTG	2	6	24956	24961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406121
504	NC_002944	TGG	2	6	24966	24971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406121
505	NC_002944	CAG	2	6	24985	24990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406121
506	NC_002944	GAT	2	6	25078	25083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406121
507	NC_002944	CGT	2	6	25122	25127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406121
508	NC_002944	GTG	2	6	25145	25150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406121
509	NC_002944	GCC	2	6	25165	25170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
510	NC_002944	CCG	2	6	25181	25186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
511	NC_002944	GCC	2	6	25189	25194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
512	NC_002944	CGG	2	6	25212	25217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406121
513	NC_002944	GCT	2	6	25251	25256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406121
514	NC_002944	CGG	2	6	25266	25271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406121
515	NC_002944	GCC	3	9	25312	25320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
516	NC_002944	CGG	2	6	25371	25376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406121
517	NC_002944	GGC	2	6	25389	25394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406121
518	NC_002944	GCC	3	9	25429	25437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
519	NC_002944	GCT	2	6	25458	25463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406121
520	NC_002944	GCC	2	6	25477	25482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
521	NC_002944	CCG	2	6	25523	25528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
522	NC_002944	GCC	2	6	25540	25545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
523	NC_002944	GCC	2	6	25555	25560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
524	NC_002944	GCC	2	6	25573	25578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
525	NC_002944	CGG	2	6	25621	25626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406121
526	NC_002944	GCC	2	6	25660	25665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
527	NC_002944	TGC	2	6	25706	25711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406121
528	NC_002944	GCC	2	6	25723	25728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
529	NC_002944	GCC	2	6	25747	25752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
530	NC_002944	CCG	2	6	25769	25774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
531	NC_002944	GCG	3	9	25791	25799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406121
532	NC_002944	GCC	2	6	25804	25809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
533	NC_002944	GCC	2	6	25822	25827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
534	NC_002944	CTG	2	6	25858	25863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406121
535	NC_002944	GCC	2	6	25894	25899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406121
536	NC_002944	TCG	2	6	25967	25972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406121
537	NC_002944	TCG	2	6	25979	25984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406121
538	NC_002944	CTC	2	6	26043	26048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406121
539	NC_002944	TTC	2	6	26050	26055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406121
540	NC_002944	GTC	2	6	26089	26094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406121
541	NC_002944	CAC	2	6	26130	26135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406121
542	NC_002944	CGA	2	6	26164	26169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406121
543	NC_002944	ACC	2	6	26186	26191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406121
544	NC_002944	ATG	2	6	26309	26314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406121
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546	NC_002944	GGT	2	6	26958	26963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406122
547	NC_002944	CGG	2	6	27012	27017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406122
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550	NC_002944	GCG	2	6	27095	27100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406122
551	NC_002944	CCG	2	6	27202	27207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406122
552	NC_002944	CGC	2	6	27208	27213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406122
553	NC_002944	GCG	2	6	27270	27275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406122
554	NC_002944	TGT	2	6	27315	27320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406122
555	NC_002944	GAC	2	6	27334	27339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406122
556	NC_002944	CGG	2	6	27369	27374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406122
557	NC_002944	ATG	2	6	27436	27441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406122
558	NC_002944	AGC	2	6	27475	27480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406122
559	NC_002944	CCT	2	6	27652	27657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406123
560	NC_002944	CCA	2	6	27663	27668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406123
561	NC_002944	GAT	2	6	27684	27689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406123
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563	NC_002944	CGA	2	6	27761	27766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406123
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573	NC_002944	TGC	2	6	28260	28265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406124
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583	NC_002944	GAT	2	6	28678	28683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406124
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591	NC_002944	TCG	2	6	29298	29303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406124
592	NC_002944	TCA	2	6	29334	29339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406124
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596	NC_002944	CGT	2	6	29412	29417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406124
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602	NC_002944	GAA	2	6	29999	30004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406125
603	NC_002944	TGG	2	6	30016	30021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406125
604	NC_002944	TCA	2	6	30088	30093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406125
605	NC_002944	ACG	2	6	30106	30111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406125
606	NC_002944	GGC	2	6	30128	30133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406125
607	NC_002944	GCC	2	6	30279	30284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406125
608	NC_002944	CCA	2	6	30304	30309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406125
609	NC_002944	GCC	2	6	30417	30422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406125
610	NC_002944	CGA	2	6	30467	30472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406125
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612	NC_002944	TAC	2	6	30636	30641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406125
613	NC_002944	CGG	2	6	30650	30655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406125
614	NC_002944	CGG	2	6	30908	30913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406125
615	NC_002944	CCT	2	6	30945	30950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406125
616	NC_002944	CCG	2	6	31029	31034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406125
617	NC_002944	CCG	2	6	31041	31046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406125
618	NC_002944	GCC	3	9	31052	31060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406125
619	NC_002944	CGA	2	6	31157	31162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406125
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621	NC_002944	CCA	2	6	31308	31313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406125
622	NC_002944	CGA	2	6	31349	31354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406125
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624	NC_002944	CGG	3	9	31421	31429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406125
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