MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 97840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002944	CGC	2	6	211085	211090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406304
4002	NC_002944	GCT	2	6	211112	211117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406304
4003	NC_002944	GCA	3	9	211127	211135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406304
4004	NC_002944	GGC	2	6	211179	211184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406304
4005	NC_002944	CGG	2	6	211198	211203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406304
4006	NC_002944	GGC	2	6	211205	211210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406304
4007	NC_002944	GGC	3	9	211229	211237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406304
4008	NC_002944	GCG	2	6	211254	211259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406304
4009	NC_002944	AAG	2	6	211260	211265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406304
4010	NC_002944	GTT	2	6	211345	211350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406305
4011	NC_002944	CCG	2	6	211351	211356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406305
4012	NC_002944	GCG	2	6	211418	211423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406305
4013	NC_002944	CCG	2	6	211494	211499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406305
4014	NC_002944	TCA	2	6	211553	211558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406305
4015	NC_002944	ACG	2	6	211598	211603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406305
4016	NC_002944	CCA	2	6	211664	211669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406305
4017	NC_002944	ATC	2	6	211750	211755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406305
4018	NC_002944	ACC	2	6	211787	211792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406305
4019	NC_002944	GAA	2	6	211794	211799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406305
4020	NC_002944	CAA	2	6	211809	211814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406305
4021	NC_002944	GGC	2	6	211830	211835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406305
4022	NC_002944	GGC	2	6	211838	211843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406305
4023	NC_002944	GCC	2	6	211848	211853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406305
4024	NC_002944	AGC	2	6	211868	211873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406305
4025	NC_002944	CTG	2	6	211906	211911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406305
4026	NC_002944	AGG	2	6	211922	211927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406305
4027	NC_002944	CGG	2	6	211963	211968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406305
4028	NC_002944	GCG	3	9	211973	211981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406305
4029	NC_002944	GGA	2	6	211992	211997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406305
4030	NC_002944	CGA	5	15	212173	212187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406306
4031	NC_002944	CGG	2	6	212233	212238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406306
4032	NC_002944	GTG	2	6	212249	212254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406306
4033	NC_002944	GCC	2	6	212262	212267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406306
4034	NC_002944	CGC	2	6	212268	212273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406306
4035	NC_002944	GGT	2	6	212287	212292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406306
4036	NC_002944	CGC	2	6	212490	212495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406306
4037	NC_002944	TCA	2	6	212499	212504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406306
4038	NC_002944	ACA	2	6	212541	212546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406306
4039	NC_002944	GCT	2	6	212590	212595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406306
4040	NC_002944	GCC	2	6	212630	212635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406306
4041	NC_002944	GAG	2	6	212771	212776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406306
4042	NC_002944	GTG	2	6	212777	212782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406306
4043	NC_002944	TGC	2	6	212814	212819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406306
4044	NC_002944	GCC	3	9	212870	212878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406306
4045	NC_002944	CCG	2	6	212889	212894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406306
4046	NC_002944	CAA	2	6	212896	212901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406306
4047	NC_002944	CGA	2	6	212902	212907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406306
4048	NC_002944	TGG	2	6	212933	212938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406306
4049	NC_002944	CGC	2	6	213053	213058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406307
4050	NC_002944	GTG	2	6	213129	213134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406307
4051	NC_002944	TGG	2	6	213238	213243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406307
4052	NC_002944	CGT	2	6	213286	213291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406307
4053	NC_002944	GCG	2	6	213325	213330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406307
4054	NC_002944	CGT	2	6	213370	213375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406307
4055	NC_002944	CCG	2	6	213376	213381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406307
4056	NC_002944	TCC	2	6	213387	213392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406307
4057	NC_002944	CCG	2	6	213426	213431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406307
4058	NC_002944	CGG	2	6	213488	213493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406307
4059	NC_002944	GGT	2	6	213626	213631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406307
4060	NC_002944	CGG	2	6	213643	213648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406307
4061	NC_002944	AGC	2	6	213705	213710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406307
4062	NC_002944	CGG	2	6	213740	213745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406307
4063	NC_002944	CGT	2	6	213748	213753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406307
4064	NC_002944	ATC	2	6	213765	213770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406307
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4066	NC_002944	GCG	2	6	213958	213963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406307
4067	NC_002944	AGT	2	6	213964	213969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406307
4068	NC_002944	TGC	2	6	213973	213978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406307
4069	NC_002944	GTG	2	6	213986	213991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406307
4070	NC_002944	GCG	2	6	213999	214004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406307
4071	NC_002944	TCG	2	6	214047	214052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406307
4072	NC_002944	TGA	2	6	214072	214077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406307
4073	NC_002944	CAC	2	6	214100	214105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406307
4074	NC_002944	CGG	2	6	214112	214117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406307
4075	NC_002944	GCG	3	9	214144	214152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406307
4076	NC_002944	GTC	2	6	214217	214222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406307
4077	NC_002944	GGC	2	6	214245	214250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406307
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4079	NC_002944	CGA	2	6	214309	214314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406307
4080	NC_002944	CCG	2	6	214350	214355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406307
4081	NC_002944	GCG	2	6	214374	214379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406307
4082	NC_002944	TCG	2	6	214441	214446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406307
4083	NC_002944	CTG	2	6	214493	214498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406307
4084	NC_002944	GCT	2	6	214543	214548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406307
4085	NC_002944	GCG	4	12	214578	214589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406307
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4088	NC_002944	AGC	2	6	214653	214658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406307
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4090	NC_002944	CCG	2	6	214854	214859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406308
4091	NC_002944	CGC	2	6	214879	214884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406308
4092	NC_002944	GGC	2	6	215053	215058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406308
4093	NC_002944	CGT	2	6	215067	215072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406308
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4101	NC_002944	TCA	2	6	215676	215681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406308
4102	NC_002944	GTG	2	6	215701	215706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406308
4103	NC_002944	TTG	2	6	215717	215722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406308
4104	NC_002944	GCG	2	6	215777	215782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406308
4105	NC_002944	TCG	3	9	216104	216112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406309
4106	NC_002944	TTC	2	6	216121	216126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406309
4107	NC_002944	GTG	2	6	216178	216183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406309
4108	NC_002944	CGC	2	6	216187	216192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406309
4109	NC_002944	CGG	2	6	216201	216206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406309
4110	NC_002944	TAA	2	6	216282	216287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	41406309
4111	NC_002944	TTC	2	6	216406	216411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406309
4112	NC_002944	GCC	2	6	216460	216465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406309
4113	NC_002944	CCG	2	6	216476	216481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406309
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4115	NC_002944	GCC	2	6	216706	216711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406309
4116	NC_002944	GGT	2	6	216792	216797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406309
4117	NC_002944	TGC	2	6	216878	216883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406309
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4119	NC_002944	GAC	3	9	217036	217044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406309
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4121	NC_002944	CTG	2	6	217084	217089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406309
4122	NC_002944	GCC	2	6	217090	217095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406309
4123	NC_002944	CGG	2	6	217143	217148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406309
4124	NC_002944	CGC	2	6	217226	217231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406309
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4126	NC_002944	CTG	2	6	217356	217361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406310
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4242	NC_002944	TGC	2	6	221774	221779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
4243	NC_002944	CGT	2	6	221814	221819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
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4482	NC_002944	GAG	2	6	234472	234477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406319
4483	NC_002944	CGA	2	6	234486	234491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406319
4484	NC_002944	CGG	2	6	234495	234500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406319
4485	NC_002944	CCA	2	6	234531	234536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406319
4486	NC_002944	GCC	2	6	234615	234620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406319
4487	NC_002944	ACA	2	6	234695	234700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406319
4488	NC_002944	CTG	2	6	234724	234729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406319
4489	NC_002944	CGA	2	6	234738	234743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406319
4490	NC_002944	GCC	2	6	234763	234768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406319
4491	NC_002944	GTG	2	6	234937	234942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406319
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4498	NC_002944	GCG	2	6	235168	235173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406319
4499	NC_002944	GCT	2	6	235176	235181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406319
4500	NC_002944	GCA	2	6	235218	235223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406319

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