MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 32182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020833	CCG	3	9	246548	246556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332752
3002	NC_020833	TCA	2	6	246644	246649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332752
3003	NC_020833	ATA	2	6	246650	246655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332752
3004	NC_020833	CTT	2	6	246705	246710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332752
3005	NC_020833	CAA	2	6	246747	246752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332752
3006	NC_020833	TGC	2	6	246787	246792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332752
3007	NC_020833	AGC	2	6	246933	246938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332752
3008	NC_020833	TGA	2	6	246948	246953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332752
3009	NC_020833	TTG	2	6	246999	247004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332752
3010	NC_020833	GCT	2	6	247015	247020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332752
3011	NC_020833	CTG	2	6	247083	247088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332752
3012	NC_020833	AAT	2	6	247141	247146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332752
3013	NC_020833	GGT	2	6	247152	247157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332752
3014	NC_020833	GCC	2	6	247264	247269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332752
3015	NC_020833	GTT	2	6	247338	247343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332752
3016	NC_020833	TTG	2	6	247437	247442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_020833	GGT	2	6	247633	247638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332753
3018	NC_020833	ATT	2	6	247644	247649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332753
3019	NC_020833	AGC	2	6	247794	247799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332753
3020	NC_020833	GAT	2	6	247812	247817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332753
3021	NC_020833	CAG	2	6	247836	247841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332753
3022	NC_020833	ATT	2	6	247852	247857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332753
3023	NC_020833	TTA	2	6	247922	247927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332753
3024	NC_020833	TTA	2	6	247960	247965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332753
3025	NC_020833	TGT	2	6	248063	248068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332753
3026	NC_020833	ATT	2	6	248158	248163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332753
3027	NC_020833	CTG	2	6	248170	248175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332753
3028	NC_020833	CCG	2	6	248268	248273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332753
3029	NC_020833	ATG	2	6	248329	248334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332753
3030	NC_020833	ATT	2	6	248361	248366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332753
3031	NC_020833	CCA	2	6	248396	248401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332753
3032	NC_020833	TAT	2	6	248422	248427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332753
3033	NC_020833	TGA	2	6	248441	248446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332753
3034	NC_020833	AAC	2	6	248552	248557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332753
3035	NC_020833	TGT	2	6	248569	248574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332754
3036	NC_020833	TGC	2	6	248614	248619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332754
3037	NC_020833	ATT	2	6	248718	248723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332754
3038	NC_020833	AAG	2	6	248766	248771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332754
3039	NC_020833	CCG	2	6	248841	248846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332754
3040	NC_020833	CGG	2	6	248916	248921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332754
3041	NC_020833	TGG	2	6	248922	248927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332754
3042	NC_020833	ATT	2	6	249025	249030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332754
3043	NC_020833	ATG	2	6	249188	249193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332754
3044	NC_020833	TGA	2	6	249295	249300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332754
3045	NC_020833	CTG	2	6	249321	249326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332754
3046	NC_020833	TGA	3	9	249424	249432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332755
3047	NC_020833	GTG	2	6	249549	249554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332755
3048	NC_020833	ATC	2	6	249675	249680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332755
3049	NC_020833	AGC	2	6	249706	249711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332755
3050	NC_020833	GCC	2	6	249735	249740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332755
3051	NC_020833	TGG	2	6	249775	249780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332755
3052	NC_020833	ACA	2	6	249807	249812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332755
3053	NC_020833	CGG	2	6	249947	249952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332755
3054	NC_020833	CAA	2	6	249972	249977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332755
3055	NC_020833	CAC	3	9	250019	250027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332755
3056	NC_020833	TGG	2	6	250054	250059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332755
3057	NC_020833	TGA	2	6	250418	250423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332755
3058	NC_020833	ATT	2	6	250641	250646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332755
3059	NC_020833	GAG	2	6	250654	250659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472332755
3060	NC_020833	TGA	2	6	250735	250740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332756
3061	NC_020833	CGG	2	6	250851	250856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332756
3062	NC_020833	TGA	2	6	250996	251001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332756
3063	NC_020833	ATT	2	6	251089	251094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332756
3064	NC_020833	ACA	2	6	251116	251121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332756
3065	NC_020833	TGC	2	6	251146	251151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332756
3066	NC_020833	TGA	2	6	251187	251192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332756
3067	NC_020833	TAT	2	6	251264	251269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332756
3068	NC_020833	GAT	2	6	251297	251302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332756
3069	NC_020833	GGT	2	6	251400	251405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332757
3070	NC_020833	CTT	2	6	251470	251475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332757
3071	NC_020833	GGC	2	6	251495	251500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332757
3072	NC_020833	CTG	2	6	251505	251510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332757
3073	NC_020833	TGA	2	6	251633	251638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332757
3074	NC_020833	AAT	2	6	251723	251728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332757
3075	NC_020833	AGA	2	6	251762	251767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332757
3076	NC_020833	ATC	2	6	251923	251928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332757
3077	NC_020833	GTG	2	6	251963	251968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332758
3078	NC_020833	CAG	2	6	252285	252290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332758
3079	NC_020833	TGA	2	6	252324	252329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332758
3080	NC_020833	TAC	2	6	252336	252341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332758
3081	NC_020833	TTC	2	6	252430	252435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332758
3082	NC_020833	TGT	2	6	252480	252485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_020833	CGA	2	6	252552	252557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332759
3084	NC_020833	CGG	2	6	252689	252694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332759
3085	NC_020833	TTG	2	6	252738	252743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332759
3086	NC_020833	TAG	2	6	253002	253007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332759
3087	NC_020833	GTG	3	9	253259	253267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332759
3088	NC_020833	GCC	2	6	253358	253363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332759
3089	NC_020833	CTT	2	6	253393	253398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332759
3090	NC_020833	CAT	2	6	253480	253485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332759
3091	NC_020833	AGT	2	6	253549	253554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332759
3092	NC_020833	AAC	2	6	253624	253629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332759
3093	NC_020833	AAC	2	6	253692	253697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332759
3094	NC_020833	TAA	2	6	253844	253849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332759
3095	NC_020833	AAT	2	6	253939	253944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_020833	AAG	2	6	254012	254017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_020833	TGG	2	6	254073	254078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332760
3098	NC_020833	CAT	2	6	254135	254140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332760
3099	NC_020833	ACC	2	6	254396	254401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332760
3100	NC_020833	CAA	2	6	254492	254497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332760
3101	NC_020833	CAA	2	6	254517	254522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332760
3102	NC_020833	TCA	2	6	254707	254712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332760
3103	NC_020833	AAT	2	6	254762	254767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332760
3104	NC_020833	GAA	2	6	254839	254844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332760
3105	NC_020833	TTG	2	6	255020	255025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332760
3106	NC_020833	AAC	2	6	255055	255060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332760
3107	NC_020833	ACA	2	6	255064	255069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332760
3108	NC_020833	AAT	2	6	255162	255167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332760
3109	NC_020833	TAA	2	6	255316	255321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332761
3110	NC_020833	GCA	2	6	255381	255386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332761
3111	NC_020833	TTA	2	6	255404	255409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332761
3112	NC_020833	TTG	2	6	255457	255462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332761
3113	NC_020833	GTT	2	6	255510	255515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332761
3114	NC_020833	GTT	2	6	255644	255649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332761
3115	NC_020833	GTG	2	6	255683	255688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332761
3116	NC_020833	TTG	2	6	255700	255705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332761
3117	NC_020833	GGC	2	6	255741	255746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332761
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3119	NC_020833	GTG	2	6	255849	255854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332761
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3485	NC_020833	CTG	2	6	285056	285061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332783
3486	NC_020833	CGT	2	6	285144	285149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332783
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