MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 32182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020833	TGT	2	6	123519	123524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332626
1502	NC_020833	AAG	2	6	123605	123610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332626
1503	NC_020833	AGT	2	6	123667	123672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332626
1504	NC_020833	GCA	2	6	123796	123801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332626
1505	NC_020833	TAT	2	6	123845	123850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332626
1506	NC_020833	TGG	2	6	123981	123986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332626
1507	NC_020833	ATC	2	6	124036	124041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332626
1508	NC_020833	TTG	2	6	124101	124106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332626
1509	NC_020833	CAT	2	6	124354	124359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332627
1510	NC_020833	ATG	2	6	124368	124373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332627
1511	NC_020833	TGA	2	6	124522	124527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332627
1512	NC_020833	ATG	2	6	124552	124557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332627
1513	NC_020833	GCG	2	6	124596	124601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332627
1514	NC_020833	TTC	2	6	124694	124699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332627
1515	NC_020833	ATT	2	6	124716	124721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332627
1516	NC_020833	ATT	2	6	124731	124736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332627
1517	NC_020833	ATT	2	6	124820	124825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332627
1518	NC_020833	AGA	2	6	125164	125169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332627
1519	NC_020833	GAA	2	6	125486	125491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332628
1520	NC_020833	AGA	2	6	125497	125502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332628
1521	NC_020833	GTG	2	6	125603	125608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332628
1522	NC_020833	TGA	2	6	125632	125637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332628
1523	NC_020833	TAT	2	6	125805	125810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332628
1524	NC_020833	TAA	2	6	125881	125886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332629
1525	NC_020833	GAA	2	6	125913	125918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332629
1526	NC_020833	GAT	2	6	125967	125972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332629
1527	NC_020833	GGT	2	6	126059	126064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332629
1528	NC_020833	GCA	2	6	126107	126112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332629
1529	NC_020833	AAG	2	6	126160	126165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332629
1530	NC_020833	TAA	2	6	126500	126505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332629
1531	NC_020833	CAA	2	6	126507	126512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332629
1532	NC_020833	ATT	2	6	126513	126518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332629
1533	NC_020833	ACG	2	6	126563	126568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332630
1534	NC_020833	GCC	2	6	126632	126637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332630
1535	NC_020833	CGT	2	6	126869	126874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332630
1536	NC_020833	GTG	2	6	126974	126979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332630
1537	NC_020833	TGA	2	6	126997	127002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332630
1538	NC_020833	GTG	2	6	127014	127019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332630
1539	NC_020833	ATT	2	6	127231	127236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332630
1540	NC_020833	GAA	2	6	127310	127315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332630
1541	NC_020833	GCC	2	6	127389	127394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332630
1542	NC_020833	TTC	2	6	127501	127506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332630
1543	NC_020833	ATT	2	6	127567	127572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020833	TCT	2	6	127628	127633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_020833	GTT	2	6	127659	127664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020833	ATT	2	6	127669	127674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020833	TGC	2	6	127765	127770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332631
1548	NC_020833	GTA	2	6	127931	127936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332631
1549	NC_020833	ATT	2	6	127984	127989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332631
1550	NC_020833	TGT	2	6	128161	128166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332631
1551	NC_020833	CAA	2	6	128176	128181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332631
1552	NC_020833	TAA	2	6	128350	128355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332631
1553	NC_020833	GAA	2	6	128573	128578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332631
1554	NC_020833	CAA	2	6	128785	128790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332631
1555	NC_020833	CAT	2	6	128972	128977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332632
1556	NC_020833	AAT	2	6	129012	129017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332632
1557	NC_020833	GCA	2	6	129118	129123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332632
1558	NC_020833	TGA	2	6	129186	129191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332632
1559	NC_020833	AGC	2	6	129222	129227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332632
1560	NC_020833	ATA	2	6	129297	129302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332632
1561	NC_020833	TGA	2	6	129306	129311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332632
1562	NC_020833	ATA	2	6	129339	129344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332632
1563	NC_020833	TAA	2	6	129404	129409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332632
1564	NC_020833	TTA	2	6	129507	129512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020833	TGA	2	6	129535	129540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332633
1566	NC_020833	CCA	2	6	129647	129652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332633
1567	NC_020833	AGA	2	6	129662	129667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020833	TTC	2	6	129883	129888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332634
1569	NC_020833	GCA	2	6	130129	130134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332634
1570	NC_020833	TTG	2	6	130200	130205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332634
1571	NC_020833	CAC	2	6	130289	130294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332634
1572	NC_020833	TCT	2	6	130306	130311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332634
1573	NC_020833	GAT	2	6	130412	130417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332634
1574	NC_020833	CCT	2	6	130441	130446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472332634
1575	NC_020833	TCA	2	6	130549	130554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332634
1576	NC_020833	ACC	2	6	130608	130613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332634
1577	NC_020833	TTG	2	6	130626	130631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332634
1578	NC_020833	TTC	2	6	130695	130700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332634
1579	NC_020833	TAA	2	6	130710	130715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332634
1580	NC_020833	GTT	2	6	130740	130745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332634
1581	NC_020833	TCT	2	6	130851	130856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_020833	TAA	2	6	130966	130971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332635
1583	NC_020833	AAT	2	6	130983	130988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332635
1584	NC_020833	AAT	3	9	131277	131285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332635
1585	NC_020833	TTG	2	6	131372	131377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332635
1586	NC_020833	GAA	2	6	131511	131516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332635
1587	NC_020833	TCA	2	6	131524	131529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332635
1588	NC_020833	CCA	2	6	131574	131579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332635
1589	NC_020833	GCT	2	6	131616	131621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332635
1590	NC_020833	ATT	2	6	131651	131656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332635
1591	NC_020833	TGC	2	6	131693	131698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332635
1592	NC_020833	ACC	2	6	131703	131708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332635
1593	NC_020833	ATT	2	6	131715	131720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332635
1594	NC_020833	TGG	2	6	131755	131760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332635
1595	NC_020833	TTC	2	6	131762	131767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332635
1596	NC_020833	ATA	2	6	131832	131837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332635
1597	NC_020833	TAA	2	6	131879	131884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332635
1598	NC_020833	GTT	2	6	131943	131948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332635
1599	NC_020833	ATT	2	6	131973	131978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020833	CTT	2	6	132098	132103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332636
1601	NC_020833	TGA	2	6	132171	132176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332636
1602	NC_020833	GTT	3	9	132287	132295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332636
1603	NC_020833	ATA	2	6	132382	132387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332636
1604	NC_020833	AGT	2	6	132754	132759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332637
1605	NC_020833	GTT	2	6	132899	132904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332637
1606	NC_020833	TTG	2	6	133002	133007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332637
1607	NC_020833	GCT	2	6	133089	133094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332637
1608	NC_020833	GTT	2	6	133145	133150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332637
1609	NC_020833	CCA	2	6	133248	133253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332637
1610	NC_020833	GTT	2	6	133256	133261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332637
1611	NC_020833	TCT	3	9	133295	133303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332637
1612	NC_020833	TCT	2	6	133405	133410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332637
1613	NC_020833	TTG	2	6	133437	133442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332637
1614	NC_020833	TAA	2	6	133488	133493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332637
1615	NC_020833	GCA	2	6	133507	133512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332637
1616	NC_020833	GTT	2	6	133580	133585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332637
1617	NC_020833	CTG	2	6	133602	133607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332637
1618	NC_020833	ATC	2	6	133818	133823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332637
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1620	NC_020833	GTT	2	6	133877	133882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332637
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1985	NC_020833	GTT	2	6	164988	164993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332665
1986	NC_020833	AGC	2	6	165107	165112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332665
1987	NC_020833	GAG	2	6	165219	165224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472332665
1988	NC_020833	CAA	2	6	165239	165244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332666
1989	NC_020833	CAC	2	6	165270	165275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332666
1990	NC_020833	GAA	2	6	165374	165379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332666
1991	NC_020833	GTA	2	6	165413	165418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332666
1992	NC_020833	GTG	2	6	165441	165446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332666
1993	NC_020833	GTC	2	6	165456	165461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332666
1994	NC_020833	AAG	2	6	165495	165500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332666
1995	NC_020833	GTC	3	9	165591	165599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332667
1996	NC_020833	GTT	2	6	165602	165607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332667
1997	NC_020833	GCA	2	6	165647	165652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332667
1998	NC_020833	TGG	2	6	165676	165681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332667
1999	NC_020833	AAC	2	6	165686	165691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332667
2000	NC_020833	TGG	2	6	165718	165723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332667

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