MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 32182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_020833	TAA	2	6	165763	165768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332667
2003	NC_020833	GTT	2	6	165785	165790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332667
2004	NC_020833	CTG	2	6	165888	165893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332667
2005	NC_020833	GGT	2	6	166007	166012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332667
2006	NC_020833	CTG	2	6	166026	166031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332667
2007	NC_020833	GGT	3	9	166253	166261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332667
2008	NC_020833	CAA	2	6	166333	166338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332667
2009	NC_020833	CGT	3	9	166361	166369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332667
2010	NC_020833	TTG	2	6	166451	166456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_020833	AAG	2	6	166457	166462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_020833	CGT	2	6	166514	166519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_020833	GTC	2	6	166569	166574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332668
2014	NC_020833	CGA	2	6	166597	166602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332668
2015	NC_020833	CGC	2	6	166657	166662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332668
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2021	NC_020833	CTG	2	6	167603	167608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332670
2022	NC_020833	ACT	2	6	167617	167622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332670
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2241	NC_020833	GGC	2	6	184912	184917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332690
2242	NC_020833	ATC	2	6	185000	185005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332690
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2244	NC_020833	ATC	2	6	185288	185293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332690
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2253	NC_020833	TAA	2	6	186065	186070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2254	NC_020833	ATT	2	6	186078	186083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2255	NC_020833	CTC	2	6	186131	186136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2270	NC_020833	TGA	2	6	186835	186840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332692
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2272	NC_020833	ACA	2	6	186951	186956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332692
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2306	NC_020833	AAT	2	6	189733	189738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332694
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2313	NC_020833	TGA	2	6	190742	190747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2345	NC_020833	ACA	2	6	194554	194559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332698
2346	NC_020833	GGC	2	6	194612	194617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332698
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2348	NC_020833	CAA	2	6	194671	194676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2349	NC_020833	ATT	2	6	194717	194722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332699
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2352	NC_020833	ACC	2	6	194937	194942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332699
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2354	NC_020833	GTA	2	6	194961	194966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332699
2355	NC_020833	GAA	2	6	195000	195005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332699
2356	NC_020833	AGC	2	6	195086	195091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332699
2357	NC_020833	TCT	2	6	195112	195117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332699
2358	NC_020833	TCA	2	6	195128	195133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332699
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2481	NC_020833	TTA	2	6	205811	205816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2482	NC_020833	TCA	2	6	205822	205827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2483	NC_020833	CAA	2	6	205954	205959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332708
2484	NC_020833	GAT	2	6	206024	206029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332708
2485	NC_020833	TTC	2	6	206033	206038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332708
2486	NC_020833	GCT	2	6	206141	206146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332708
2487	NC_020833	CAC	2	6	206171	206176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332708
2488	NC_020833	TAA	2	6	206209	206214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332708
2489	NC_020833	ATC	2	6	206285	206290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332708
2490	NC_020833	TTA	3	9	206444	206452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2491	NC_020833	ATT	2	6	206501	206506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332709
2492	NC_020833	ATT	2	6	206543	206548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332709
2493	NC_020833	TGA	2	6	206714	206719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332709
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2497	NC_020833	TTG	2	6	207037	207042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332709
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