MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 32182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020833	ATT	2	6	207120	207125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332709
2502	NC_020833	AAG	2	6	207280	207285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332709
2503	NC_020833	GGT	2	6	207323	207328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332709
2504	NC_020833	CAG	2	6	207456	207461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332709
2505	NC_020833	TGA	2	6	207500	207505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332709
2506	NC_020833	AAT	2	6	207750	207755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332710
2507	NC_020833	AAT	2	6	207787	207792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332710
2508	NC_020833	CCG	2	6	207851	207856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332710
2509	NC_020833	GTG	2	6	207875	207880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332710
2510	NC_020833	TAA	2	6	207910	207915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332710
2511	NC_020833	AAG	2	6	207926	207931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332710
2512	NC_020833	CAC	2	6	207969	207974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332710
2513	NC_020833	AGA	2	6	208020	208025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332710
2514	NC_020833	TGG	2	6	208293	208298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332710
2515	NC_020833	TGT	2	6	208313	208318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332710
2516	NC_020833	CCG	2	6	208319	208324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332710
2517	NC_020833	CAT	2	6	208381	208386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332710
2518	NC_020833	AAG	2	6	208418	208423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332710
2519	NC_020833	TTC	2	6	208447	208452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332710
2520	NC_020833	CAT	2	6	208536	208541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332710
2521	NC_020833	TTA	2	6	208824	208829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332711
2522	NC_020833	CAC	2	6	208906	208911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332711
2523	NC_020833	AAG	2	6	208923	208928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332711
2524	NC_020833	TTC	2	6	209108	209113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332712
2525	NC_020833	CAA	2	6	209128	209133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332712
2526	NC_020833	TGC	2	6	209170	209175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332712
2527	NC_020833	CAT	2	6	209212	209217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332712
2528	NC_020833	CAA	2	6	209221	209226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332712
2529	NC_020833	CAT	2	6	209300	209305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332712
2530	NC_020833	GCT	2	6	209309	209314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332712
2531	NC_020833	GTT	2	6	209647	209652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332713
2532	NC_020833	GAC	2	6	209814	209819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332713
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2535	NC_020833	CAT	2	6	210217	210222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332713
2536	NC_020833	CCA	2	6	210240	210245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332713
2537	NC_020833	GTA	2	6	210247	210252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332713
2538	NC_020833	TTG	2	6	210283	210288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332713
2539	NC_020833	GGT	2	6	210421	210426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332713
2540	NC_020833	ACT	2	6	210510	210515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332713
2541	NC_020833	CAG	2	6	210542	210547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332713
2542	NC_020833	GAT	2	6	210552	210557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332713
2543	NC_020833	ATA	2	6	210600	210605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332713
2544	NC_020833	AAT	2	6	210677	210682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_020833	TGC	2	6	210826	210831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332714
2546	NC_020833	TGG	2	6	210888	210893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332714
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2549	NC_020833	GTA	2	6	211049	211054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332714
2550	NC_020833	ATC	2	6	211085	211090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332714
2551	NC_020833	GAA	2	6	211284	211289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332715
2552	NC_020833	TTC	2	6	211335	211340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332715
2553	NC_020833	TGG	2	6	211424	211429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332715
2554	NC_020833	GAA	2	6	211590	211595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332715
2555	NC_020833	CAA	2	6	211783	211788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_020833	CAC	2	6	211988	211993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332717
2557	NC_020833	CAA	2	6	212014	212019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332717
2558	NC_020833	GTT	2	6	212095	212100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332717
2559	NC_020833	CGG	2	6	212150	212155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332717
2560	NC_020833	AGC	2	6	212265	212270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332717
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2563	NC_020833	AGC	2	6	212614	212619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332718
2564	NC_020833	AGC	2	6	212623	212628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332718
2565	NC_020833	TGT	2	6	212695	212700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332718
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2567	NC_020833	ACT	2	6	212876	212881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332718
2568	NC_020833	GCT	2	6	212939	212944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332718
2569	NC_020833	CAA	2	6	212961	212966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332718
2570	NC_020833	TCA	2	6	212982	212987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332718
2571	NC_020833	CTA	2	6	213003	213008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332718
2572	NC_020833	ATT	2	6	213119	213124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332719
2573	NC_020833	AAT	2	6	213225	213230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332719
2574	NC_020833	TAT	2	6	213382	213387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332719
2575	NC_020833	AAT	2	6	213598	213603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_020833	ATA	2	6	213747	213752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332720
2577	NC_020833	ATC	2	6	213932	213937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332720
2578	NC_020833	CTG	2	6	214137	214142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332720
2579	NC_020833	GGT	2	6	214184	214189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332720
2580	NC_020833	CAA	2	6	214250	214255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332720
2581	NC_020833	TGA	2	6	214317	214322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332720
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2583	NC_020833	GCA	2	6	214753	214758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332720
2584	NC_020833	AGC	2	6	214777	214782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332720
2585	NC_020833	GGC	2	6	214795	214800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332720
2586	NC_020833	GTA	3	9	215242	215250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_020833	AGT	3	9	215251	215259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_020833	AGT	3	9	215261	215269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_020833	AGT	3	9	215271	215279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_020833	GTA	2	6	215282	215287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_020833	GTA	2	6	215292	215297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_020833	GTA	2	6	215302	215307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_020833	AGA	2	6	215367	215372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332722
2594	NC_020833	CGG	2	6	215451	215456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332722
2595	NC_020833	TTA	2	6	215458	215463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332722
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2599	NC_020833	GAT	2	6	215677	215682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332722
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2601	NC_020833	TTA	2	6	215821	215826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332722
2602	NC_020833	AGA	2	6	215865	215870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332722
2603	NC_020833	AAG	2	6	215900	215905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332722
2604	NC_020833	GTC	2	6	216028	216033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332722
2605	NC_020833	TGA	2	6	216150	216155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332722
2606	NC_020833	TGA	2	6	216249	216254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332722
2607	NC_020833	GGA	2	6	216408	216413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472332722
2608	NC_020833	CTT	2	6	216440	216445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332722
2609	NC_020833	ATA	2	6	216488	216493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332722
2610	NC_020833	AGA	2	6	216528	216533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332722
2611	NC_020833	TAC	2	6	216739	216744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332722
2612	NC_020833	TAG	2	6	216757	216762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332722
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2614	NC_020833	TCA	2	6	216789	216794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332723
2615	NC_020833	CAA	2	6	216842	216847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332723
2616	NC_020833	GAA	2	6	216884	216889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332723
2617	NC_020833	AAC	2	6	216999	217004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332723
2618	NC_020833	GTG	2	6	217022	217027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332723
2619	NC_020833	ATG	2	6	217139	217144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332723
2620	NC_020833	GAT	2	6	217147	217152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332723
2621	NC_020833	ATT	2	6	217250	217255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332723
2622	NC_020833	GAA	2	6	217364	217369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332723
2623	NC_020833	TGA	2	6	217408	217413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332723
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2626	NC_020833	GTC	2	6	217573	217578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332724
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2982	NC_020833	TAA	2	6	245209	245214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332751
2983	NC_020833	TGA	2	6	245341	245346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332751
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