MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 32182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020833	TAA	2	6	286091	286096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_020833	TCT	2	6	286185	286190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332784
3503	NC_020833	GTT	2	6	286274	286279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332784
3504	NC_020833	CTT	2	6	286371	286376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332784
3505	NC_020833	GGT	2	6	286588	286593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332784
3506	NC_020833	CGG	2	6	286650	286655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332784
3507	NC_020833	TTC	2	6	286660	286665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332784
3508	NC_020833	TAA	2	6	286726	286731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332784
3509	NC_020833	CAT	2	6	286792	286797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332784
3510	NC_020833	GAA	2	6	286801	286806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332784
3511	NC_020833	GGC	2	6	286887	286892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332784
3512	NC_020833	TGC	2	6	286945	286950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332784
3513	NC_020833	CGC	2	6	287247	287252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332784
3514	NC_020833	CAC	2	6	287263	287268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332784
3515	NC_020833	ATT	2	6	287452	287457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332784
3516	NC_020833	AAT	2	6	287494	287499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332784
3517	NC_020833	GAG	2	6	287546	287551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472332784
3518	NC_020833	TTG	2	6	287893	287898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332784
3519	NC_020833	AGC	2	6	288060	288065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332785
3520	NC_020833	ATC	2	6	288077	288082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332785
3521	NC_020833	GAA	2	6	288277	288282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332785
3522	NC_020833	AAG	2	6	288667	288672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332786
3523	NC_020833	CGG	2	6	288755	288760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332786
3524	NC_020833	GGT	2	6	288798	288803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332786
3525	NC_020833	TTC	2	6	288887	288892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332786
3526	NC_020833	GAT	2	6	288915	288920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332786
3527	NC_020833	AGC	2	6	289097	289102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_020833	TGT	2	6	289170	289175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332787
3529	NC_020833	ATG	2	6	289229	289234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332787
3530	NC_020833	AAT	2	6	289325	289330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332787
3531	NC_020833	TAA	2	6	289601	289606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332788
3532	NC_020833	GGT	2	6	289608	289613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332788
3533	NC_020833	GTT	2	6	289702	289707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332788
3534	NC_020833	GTA	2	6	289709	289714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332788
3535	NC_020833	AAT	2	6	289869	289874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332788
3536	NC_020833	CTT	2	6	289897	289902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332788
3537	NC_020833	CTG	2	6	289915	289920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332788
3538	NC_020833	CTT	2	6	290182	290187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332788
3539	NC_020833	TGT	2	6	290243	290248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332788
3540	NC_020833	AGT	2	6	290374	290379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_020833	TAA	3	9	290391	290399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_020833	ACT	2	6	290438	290443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_020833	ATT	2	6	290541	290546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332789
3544	NC_020833	CAA	2	6	290594	290599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332789
3545	NC_020833	CTT	3	9	290699	290707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332789
3546	NC_020833	CTA	2	6	290708	290713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332789
3547	NC_020833	TCG	2	6	290785	290790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332789
3548	NC_020833	TAA	2	6	290895	290900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332789
3549	NC_020833	CCA	2	6	290923	290928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332789
3550	NC_020833	TGC	2	6	291074	291079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332790
3551	NC_020833	CAT	2	6	291266	291271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332790
3552	NC_020833	GCA	2	6	291276	291281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332790
3553	NC_020833	CAG	2	6	291304	291309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332790
3554	NC_020833	ACA	2	6	291318	291323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332790
3555	NC_020833	GAT	2	6	291451	291456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332790
3556	NC_020833	CAC	2	6	291467	291472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332790
3557	NC_020833	TAC	2	6	291496	291501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332790
3558	NC_020833	AGC	2	6	291509	291514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332790
3559	NC_020833	ACG	2	6	291527	291532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332790
3560	NC_020833	ATC	2	6	291605	291610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332790
3561	NC_020833	GCT	2	6	291723	291728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332790
3562	NC_020833	ATC	2	6	291741	291746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332790
3563	NC_020833	CCA	2	6	291771	291776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332790
3564	NC_020833	CTT	2	6	291832	291837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332790
3565	NC_020833	TTG	2	6	291953	291958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_020833	AAT	2	6	291959	291964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_020833	AAG	2	6	292170	292175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332791
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3569	NC_020833	ATC	2	6	292620	292625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332791
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3571	NC_020833	GTT	2	6	292921	292926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332791
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3573	NC_020833	CCA	2	6	293108	293113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332791
3574	NC_020833	CAG	2	6	293132	293137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332791
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3580	NC_020833	TTA	2	6	293428	293433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332791
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3582	NC_020833	ATT	2	6	293606	293611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_020833	ACG	2	6	293686	293691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_020833	TGT	2	6	293695	293700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_020833	CGT	2	6	293727	293732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_020833	TTG	2	6	293778	293783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_020833	CAG	2	6	293905	293910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_020833	GGC	2	6	293969	293974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_020833	ACT	2	6	294083	294088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_020833	GCA	2	6	294282	294287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_020833	AGA	2	6	294424	294429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_020833	CAG	2	6	294450	294455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_020833	GTT	2	6	294519	294524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_020833	GGA	2	6	294641	294646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_020833	GAA	2	6	294902	294907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_020833	TGC	2	6	294978	294983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_020833	GTC	2	6	294990	294995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_020833	TTG	2	6	295051	295056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_020833	GGA	2	6	295103	295108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_020833	TCA	2	6	295128	295133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_020833	GCG	2	6	295184	295189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_020833	CCT	2	6	295464	295469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_020833	TGT	2	6	295635	295640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_020833	CGG	2	6	295677	295682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_020833	GAT	2	6	295721	295726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_020833	TCT	2	6	295735	295740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_020833	GAA	2	6	296004	296009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_020833	GAA	2	6	296093	296098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_020833	CTA	2	6	296100	296105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_020833	TAG	2	6	296196	296201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_020833	AAC	2	6	296322	296327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_020833	TCC	2	6	296374	296379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_020833	GGA	2	6	296683	296688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_020833	AAC	2	6	296937	296942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_020833	AGC	2	6	297027	297032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3617	NC_020833	TAA	2	6	297364	297369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_020833	TGA	2	6	297476	297481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_020833	TTA	2	6	297545	297550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_020833	GGT	2	6	297575	297580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_020833	TTA	2	6	297733	297738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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