MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 32182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020833	CAA	2	6	330030	330035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332835
4002	NC_020833	ATT	2	6	330225	330230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332834
4003	NC_020833	GCG	2	6	330261	330266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332834
4004	NC_020833	GGT	2	6	330305	330310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332834
4005	NC_020833	CAA	2	6	330510	330515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332834
4006	NC_020833	ATG	3	9	330526	330534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332834
4007	NC_020833	ATT	2	6	330609	330614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332834
4008	NC_020833	ATT	2	6	330662	330667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332834
4009	NC_020833	AAC	2	6	330763	330768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332834
4010	NC_020833	GTA	2	6	330783	330788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332834
4011	NC_020833	TTA	2	6	330795	330800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332834
4012	NC_020833	CCG	2	6	330850	330855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332834
4013	NC_020833	ATG	2	6	330905	330910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332834
4014	NC_020833	TAA	2	6	331075	331080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332836
4015	NC_020833	CAC	2	6	331087	331092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332836
4016	NC_020833	TGA	2	6	331105	331110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332836
4017	NC_020833	AAC	2	6	331121	331126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332836
4018	NC_020833	AAC	2	6	331367	331372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_020833	ATT	2	6	331397	331402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332837
4020	NC_020833	CCG	2	6	331423	331428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332837
4021	NC_020833	CCG	2	6	331640	331645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332837
4022	NC_020833	GGC	2	6	331687	331692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332837
4023	NC_020833	GGC	2	6	331726	331731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332837
4024	NC_020833	ATT	2	6	331777	331782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332837
4025	NC_020833	GCA	2	6	331802	331807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332837
4026	NC_020833	TAG	2	6	331891	331896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332837
4027	NC_020833	TAA	2	6	332125	332130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332837
4028	NC_020833	ATC	2	6	332195	332200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332837
4029	NC_020833	GCC	2	6	332306	332311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332837
4030	NC_020833	GAT	2	6	332468	332473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332837
4031	NC_020833	TAT	2	6	332495	332500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332837
4032	NC_020833	ATT	2	6	332515	332520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332837
4033	NC_020833	CTT	2	6	332770	332775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332838
4034	NC_020833	AAC	2	6	332837	332842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332838
4035	NC_020833	CGG	2	6	332935	332940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332838
4036	NC_020833	AAG	2	6	333263	333268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332838
4037	NC_020833	TTA	2	6	333292	333297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332838
4038	NC_020833	TAT	2	6	333441	333446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332838
4039	NC_020833	GAT	2	6	333516	333521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332838
4040	NC_020833	TGG	2	6	333594	333599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332838
4041	NC_020833	GCA	2	6	333613	333618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332838
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4043	NC_020833	GGT	2	6	333783	333788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332838
4044	NC_020833	GAT	2	6	333891	333896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332838
4045	NC_020833	TGA	2	6	333954	333959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332838
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4047	NC_020833	TTG	2	6	334066	334071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_020833	ATT	2	6	334099	334104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332839
4049	NC_020833	CGG	2	6	334278	334283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332839
4050	NC_020833	ATT	2	6	334337	334342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332839
4051	NC_020833	TAA	2	6	334615	334620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_020833	GCG	2	6	334683	334688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332840
4053	NC_020833	CAA	2	6	334800	334805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332840
4054	NC_020833	GGT	2	6	334832	334837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332840
4055	NC_020833	GCA	2	6	334952	334957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332841
4056	NC_020833	GCA	2	6	335078	335083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332841
4057	NC_020833	TAT	2	6	335085	335090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332841
4058	NC_020833	AAT	2	6	335093	335098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332841
4059	NC_020833	TCA	2	6	335111	335116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332841
4060	NC_020833	TCA	2	6	335118	335123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332841
4061	NC_020833	AGT	2	6	335151	335156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332841
4062	NC_020833	GTG	2	6	335208	335213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332841
4063	NC_020833	TAC	2	6	335274	335279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332841
4064	NC_020833	TGG	3	9	335357	335365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332841
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4067	NC_020833	GCT	2	6	335720	335725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332841
4068	NC_020833	TTG	2	6	335752	335757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332841
4069	NC_020833	TGA	2	6	335802	335807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332841
4070	NC_020833	TAA	2	6	335905	335910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332841
4071	NC_020833	GTT	2	6	335926	335931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332841
4072	NC_020833	AAG	2	6	336008	336013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332841
4073	NC_020833	GTT	2	6	336025	336030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332841
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4078	NC_020833	ACG	2	6	336253	336258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332841
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4080	NC_020833	CAA	2	6	336363	336368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332841
4081	NC_020833	GTT	2	6	336379	336384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332841
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4083	NC_020833	GAT	2	6	336573	336578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_020833	CAA	2	6	336647	336652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_020833	ATA	2	6	336660	336665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_020833	TTC	2	6	336730	336735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332842
4087	NC_020833	TTC	2	6	336822	336827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332842
4088	NC_020833	ACC	2	6	336850	336855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332842
4089	NC_020833	CCA	2	6	336883	336888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332842
4090	NC_020833	CAC	2	6	337089	337094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332842
4091	NC_020833	CTT	2	6	337448	337453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332842
4092	NC_020833	ATC	2	6	337482	337487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332842
4093	NC_020833	CCA	2	6	337519	337524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332842
4094	NC_020833	ACC	2	6	337563	337568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332842
4095	NC_020833	ACC	2	6	337572	337577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332842
4096	NC_020833	GCC	2	6	337578	337583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332842
4097	NC_020833	GGC	2	6	337626	337631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332842
4098	NC_020833	GCC	2	6	337756	337761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332842
4099	NC_020833	TAA	2	6	337825	337830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332842
4100	NC_020833	TTG	2	6	337844	337849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332842
4101	NC_020833	GGT	2	6	338451	338456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_020833	ATT	2	6	338510	338515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332844
4103	NC_020833	TAT	2	6	338516	338521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332844
4104	NC_020833	CTT	2	6	338528	338533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332844
4105	NC_020833	TTG	2	6	338571	338576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332844
4106	NC_020833	CGC	2	6	338585	338590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332844
4107	NC_020833	TGC	2	6	338607	338612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332844
4108	NC_020833	TTG	2	6	338919	338924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332844
4109	NC_020833	ATA	2	6	338962	338967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332844
4110	NC_020833	TAT	2	6	339059	339064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332844
4111	NC_020833	ACC	2	6	339195	339200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332844
4112	NC_020833	TAA	2	6	339237	339242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332844
4113	NC_020833	CCG	2	6	339284	339289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332844
4114	NC_020833	AAG	2	6	339343	339348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332844
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4116	NC_020833	AGA	2	6	339588	339593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332844
4117	NC_020833	GCT	2	6	339616	339621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332844
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4119	NC_020833	AGT	2	6	339695	339700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332844
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4121	NC_020833	ACC	3	9	339819	339827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332844
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4364	NC_020833	ATT	2	6	359986	359991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332860
4365	NC_020833	CTG	2	6	360033	360038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332860
4366	NC_020833	ATG	2	6	360263	360268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332860
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4398	NC_020833	AAT	2	6	363255	363260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4420	NC_020833	GTA	2	6	365400	365405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332866
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