MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 32182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020833	AGA	2	6	43430	43435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332555
502	NC_020833	TTA	2	6	43490	43495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020833	ATA	2	6	43525	43530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332556
504	NC_020833	GTG	2	6	43585	43590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332556
505	NC_020833	TTA	2	6	43671	43676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332556
506	NC_020833	TAT	2	6	43693	43698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332556
507	NC_020833	ATT	2	6	43711	43716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332556
508	NC_020833	ATT	2	6	43758	43763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332556
509	NC_020833	ATG	2	6	43791	43796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332556
510	NC_020833	ATT	2	6	44109	44114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332557
511	NC_020833	ACA	2	6	44169	44174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332557
512	NC_020833	GAT	2	6	44188	44193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332557
513	NC_020833	TGT	2	6	44356	44361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332558
514	NC_020833	ATA	2	6	44395	44400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332558
515	NC_020833	TGC	2	6	44412	44417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332558
516	NC_020833	CGC	2	6	44427	44432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332558
517	NC_020833	GAT	2	6	44624	44629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332558
518	NC_020833	TGC	2	6	44646	44651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332558
519	NC_020833	CTT	2	6	44726	44731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332558
520	NC_020833	TCT	2	6	44740	44745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332558
521	NC_020833	ACC	2	6	44772	44777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332558
522	NC_020833	CTT	2	6	44834	44839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332558
523	NC_020833	CTT	2	6	44852	44857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332558
524	NC_020833	CAT	2	6	44903	44908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332558
525	NC_020833	AAG	2	6	44990	44995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332558
526	NC_020833	TGT	2	6	45015	45020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332558
527	NC_020833	CAT	2	6	45095	45100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332558
528	NC_020833	TTG	2	6	45249	45254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332558
529	NC_020833	CCG	2	6	45343	45348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332558
530	NC_020833	CTA	2	6	45353	45358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332558
531	NC_020833	TCA	2	6	45391	45396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332558
532	NC_020833	AAT	2	6	45579	45584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332558
533	NC_020833	TAA	3	9	45750	45758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332558
534	NC_020833	CCA	2	6	45811	45816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332558
535	NC_020833	ATA	3	9	45820	45828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332558
536	NC_020833	TGT	2	6	45847	45852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332558
537	NC_020833	AAG	2	6	46034	46039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020833	TAT	2	6	46169	46174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020833	CGG	2	6	46282	46287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332559
540	NC_020833	TTC	2	6	46341	46346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332559
541	NC_020833	TCT	2	6	46621	46626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332559
542	NC_020833	TGG	2	6	46683	46688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332559
543	NC_020833	CAA	2	6	46833	46838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332559
544	NC_020833	GCA	2	6	46860	46865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332559
545	NC_020833	TGA	2	6	46894	46899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332559
546	NC_020833	GAC	2	6	46959	46964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332559
547	NC_020833	ACC	2	6	47271	47276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332559
548	NC_020833	GCA	2	6	47277	47282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332559
549	NC_020833	GCA	2	6	47466	47471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332559
550	NC_020833	CAG	3	9	47476	47484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332559
551	NC_020833	GGT	2	6	47511	47516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332559
552	NC_020833	AGT	2	6	47534	47539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332559
553	NC_020833	GCA	2	6	47547	47552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332559
554	NC_020833	CGG	2	6	47570	47575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332559
555	NC_020833	TGA	2	6	47584	47589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332559
556	NC_020833	GGT	3	9	47592	47600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332559
557	NC_020833	GAA	2	6	47637	47642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332559
558	NC_020833	AGA	2	6	47663	47668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332559
559	NC_020833	ATA	2	6	47681	47686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332559
560	NC_020833	TTC	2	6	47717	47722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_020833	TGC	2	6	47780	47785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332560
562	NC_020833	CAA	2	6	47823	47828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332560
563	NC_020833	GTG	2	6	47854	47859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332560
564	NC_020833	CAA	2	6	47913	47918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332560
565	NC_020833	TTA	2	6	48047	48052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332560
566	NC_020833	TGG	2	6	48055	48060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332560
567	NC_020833	TGA	2	6	48071	48076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332560
568	NC_020833	GAA	2	6	48189	48194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332560
569	NC_020833	TAC	2	6	48409	48414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332560
570	NC_020833	TGG	2	6	48595	48600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332560
571	NC_020833	CTG	2	6	48747	48752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332560
572	NC_020833	AAT	2	6	48915	48920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020833	TAG	2	6	48979	48984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020833	AGT	2	6	49008	49013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020833	CCA	2	6	49041	49046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332561
576	NC_020833	CAG	2	6	49067	49072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332561
577	NC_020833	ATT	2	6	49141	49146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332561
578	NC_020833	TAT	2	6	49265	49270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332561
579	NC_020833	GGC	2	6	49400	49405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332561
580	NC_020833	CCG	2	6	49437	49442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332561
581	NC_020833	GTG	2	6	49490	49495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332561
582	NC_020833	TGG	2	6	49500	49505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332561
583	NC_020833	GCG	2	6	49525	49530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332561
584	NC_020833	CCG	2	6	49674	49679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332561
585	NC_020833	TGA	2	6	49682	49687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332561
586	NC_020833	GTG	2	6	49704	49709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332561
587	NC_020833	ACA	2	6	49771	49776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332561
588	NC_020833	AAG	2	6	49861	49866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332561
589	NC_020833	CTT	2	6	49904	49909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332561
590	NC_020833	GCC	2	6	49985	49990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332561
591	NC_020833	TGT	2	6	49993	49998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332561
592	NC_020833	ACA	2	6	50068	50073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332561
593	NC_020833	TGA	3	9	50113	50121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332561
594	NC_020833	AGC	2	6	50132	50137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332561
595	NC_020833	GGT	2	6	50262	50267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332561
596	NC_020833	ATG	2	6	50428	50433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332562
597	NC_020833	TTC	2	6	50641	50646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332562
598	NC_020833	GGT	2	6	50730	50735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332562
599	NC_020833	ATA	2	6	50807	50812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332562
600	NC_020833	CAA	2	6	50914	50919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332562
601	NC_020833	CCG	2	6	50966	50971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332562
602	NC_020833	TCA	2	6	51002	51007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332562
603	NC_020833	CAA	2	6	51087	51092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332562
604	NC_020833	CAG	2	6	51123	51128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332562
605	NC_020833	GTT	2	6	51223	51228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332562
606	NC_020833	TGA	2	6	51299	51304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332562
607	NC_020833	TTG	2	6	51368	51373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332562
608	NC_020833	GTT	2	6	51390	51395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332562
609	NC_020833	CTG	2	6	51510	51515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332563
610	NC_020833	GAA	2	6	51568	51573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332563
611	NC_020833	ATC	2	6	51598	51603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332563
612	NC_020833	AAG	2	6	51756	51761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332563
613	NC_020833	TGT	2	6	51812	51817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332563
614	NC_020833	TGA	2	6	51834	51839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332563
615	NC_020833	GGC	2	6	52230	52235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332564
616	NC_020833	CAC	2	6	52328	52333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332564
617	NC_020833	TAA	2	6	52400	52405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332564
618	NC_020833	ACT	2	6	52462	52467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332564
619	NC_020833	GCC	2	6	52488	52493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332564
620	NC_020833	CCG	2	6	52496	52501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332564
621	NC_020833	ATA	2	6	52509	52514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332564
622	NC_020833	CCA	2	6	52547	52552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332564
623	NC_020833	TGA	2	6	52651	52656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332564
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625	NC_020833	AAC	2	6	52714	52719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332564
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744	NC_020833	GTA	2	6	63158	63163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332574
745	NC_020833	AAT	2	6	63261	63266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
746	NC_020833	TAA	2	6	63285	63290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
747	NC_020833	ATC	2	6	63395	63400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332575
748	NC_020833	AAT	2	6	63429	63434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332575
749	NC_020833	TCC	2	6	63521	63526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472332575
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