MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 3346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009633	ATTCA	2	10	698	707	40 %	40 %	0 %	20 %	150387854
2	NC_009633	TAAAG	2	10	3330	3339	60 %	20 %	20 %	0 %	150387857
3	NC_009633	TTGTT	2	10	3455	3464	0 %	80 %	20 %	0 %	150387857
4	NC_009633	TGAAA	2	10	6620	6629	60 %	20 %	20 %	0 %	150387860
5	NC_009633	AAATT	2	10	9713	9722	60 %	40 %	0 %	0 %	150387862
6	NC_009633	CAAGT	2	10	10603	10612	40 %	20 %	20 %	20 %	150387863
7	NC_009633	ACTTA	2	10	10633	10642	40 %	40 %	0 %	20 %	150387863
8	NC_009633	AGAAA	2	10	16814	16823	80 %	0 %	20 %	0 %	150387864
9	NC_009633	TTTTA	2	10	17871	17880	20 %	80 %	0 %	0 %	150387866
10	NC_009633	ATGGG	2	10	17914	17923	20 %	20 %	60 %	0 %	150387866
11	NC_009633	ATGGA	2	10	18342	18351	40 %	20 %	40 %	0 %	150387867
12	NC_009633	AAATA	2	10	19033	19042	80 %	20 %	0 %	0 %	150387867
13	NC_009633	AAAAG	2	10	19773	19782	80 %	0 %	20 %	0 %	150387868
14	NC_009633	AAATA	2	10	20391	20400	80 %	20 %	0 %	0 %	150387868
15	NC_009633	GGCTA	2	10	20780	20789	20 %	20 %	40 %	20 %	150387869
16	NC_009633	CTACG	2	10	21441	21450	20 %	20 %	20 %	40 %	150387869
17	NC_009633	ACAAT	2	10	28783	28792	60 %	20 %	0 %	20 %	150387871
18	NC_009633	ATTAT	2	10	29785	29794	40 %	60 %	0 %	0 %	150387871
19	NC_009633	TAGAA	2	10	30074	30083	60 %	20 %	20 %	0 %	150387871
20	NC_009633	TAGAG	2	10	30711	30720	40 %	20 %	40 %	0 %	150387872
21	NC_009633	ATGGC	2	10	31794	31803	20 %	20 %	40 %	20 %	150387874
22	NC_009633	CATTT	2	10	32693	32702	20 %	60 %	0 %	20 %	150387874
23	NC_009633	ACTAA	2	10	33050	33059	60 %	20 %	0 %	20 %	150387875
24	NC_009633	CAAAT	2	10	33152	33161	60 %	20 %	0 %	20 %	150387875
25	NC_009633	GTATT	2	10	34521	34530	20 %	60 %	20 %	0 %	150387875
26	NC_009633	GAATC	2	10	35422	35431	40 %	20 %	20 %	20 %	150387875
27	NC_009633	AAGAG	2	10	35455	35464	60 %	0 %	40 %	0 %	150387875
28	NC_009633	GATTT	2	10	36600	36609	20 %	60 %	20 %	0 %	150387877
29	NC_009633	AGTGG	2	10	40725	40734	20 %	20 %	60 %	0 %	150387880
30	NC_009633	CAAAT	2	10	41178	41187	60 %	20 %	0 %	20 %	150387882
31	NC_009633	GTGAT	2	10	41397	41406	20 %	40 %	40 %	0 %	150387882
32	NC_009633	AGAAA	2	10	43997	44006	80 %	0 %	20 %	0 %	150387885
33	NC_009633	CATTC	2	10	44684	44693	20 %	40 %	0 %	40 %	150387886
34	NC_009633	GGGTG	2	10	48131	48140	0 %	20 %	80 %	0 %	150387891
35	NC_009633	AAATC	2	10	61348	61357	60 %	20 %	0 %	20 %	150387893
36	NC_009633	AAAAG	2	10	62117	62126	80 %	0 %	20 %	0 %	150387893
37	NC_009633	TCGTT	2	10	62294	62303	0 %	60 %	20 %	20 %	150387893
38	NC_009633	AAGAA	2	10	63601	63610	80 %	0 %	20 %	0 %	150387894
39	NC_009633	CATCA	2	10	66109	66118	40 %	20 %	0 %	40 %	150387896
40	NC_009633	TGAGG	2	10	66223	66232	20 %	20 %	60 %	0 %	150387896
41	NC_009633	AATTT	2	10	67918	67927	40 %	60 %	0 %	0 %	150387899
42	NC_009633	TAGTC	2	10	69385	69394	20 %	40 %	20 %	20 %	150387900
43	NC_009633	GGATA	2	10	70536	70545	40 %	20 %	40 %	0 %	150387901
44	NC_009633	TAGCC	2	10	70716	70725	20 %	20 %	20 %	40 %	150387901
45	NC_009633	TTTGC	2	10	72362	72371	0 %	60 %	20 %	20 %	150387904
46	NC_009633	GCCTT	2	10	72931	72940	0 %	40 %	20 %	40 %	150387904
47	NC_009633	TTTTC	2	10	75611	75620	0 %	80 %	0 %	20 %	150387906
48	NC_009633	AAAGA	2	10	77925	77934	80 %	0 %	20 %	0 %	150387910
49	NC_009633	ATTGC	2	10	80515	80524	20 %	40 %	20 %	20 %	150387911
50	NC_009633	GAAAA	2	10	83292	83301	80 %	0 %	20 %	0 %	150387914
51	NC_009633	GCCCA	2	10	83491	83500	20 %	0 %	20 %	60 %	150387914
52	NC_009633	ATTTA	2	10	84220	84229	40 %	60 %	0 %	0 %	150387915
53	NC_009633	GGTTC	2	10	86954	86963	0 %	40 %	40 %	20 %	150387917
54	NC_009633	AAAGG	2	10	87302	87311	60 %	0 %	40 %	0 %	150387918
55	NC_009633	ATCAA	2	10	89421	89430	60 %	20 %	0 %	20 %	150387920
56	NC_009633	GAAAT	2	10	89757	89766	60 %	20 %	20 %	0 %	150387920
57	NC_009633	CCAGG	2	10	91955	91964	20 %	0 %	40 %	40 %	150387923
58	NC_009633	CATTG	2	10	93175	93184	20 %	40 %	20 %	20 %	150387924
59	NC_009633	AAGGG	2	10	93882	93891	40 %	0 %	60 %	0 %	150387925
60	NC_009633	GCATT	2	10	94091	94100	20 %	40 %	20 %	20 %	150387926
61	NC_009633	GAAAG	2	10	94824	94833	60 %	0 %	40 %	0 %	150387927
62	NC_009633	AATTG	2	10	95873	95882	40 %	40 %	20 %	0 %	150387928
63	NC_009633	AAAAG	2	10	101055	101064	80 %	0 %	20 %	0 %	150387934
64	NC_009633	AGGGT	2	10	101631	101640	20 %	20 %	60 %	0 %	150387935
65	NC_009633	AAAAG	2	10	103569	103578	80 %	0 %	20 %	0 %	150387938
66	NC_009633	GAAAT	2	10	103624	103633	60 %	20 %	20 %	0 %	150387938
67	NC_009633	AAAGG	2	10	107362	107371	60 %	0 %	40 %	0 %	150387942
68	NC_009633	GTTTT	2	10	108031	108040	0 %	80 %	20 %	0 %	150387943
69	NC_009633	AATAA	2	10	112141	112150	80 %	20 %	0 %	0 %	150387947
70	NC_009633	TTCAA	2	10	113948	113957	40 %	40 %	0 %	20 %	150387948
71	NC_009633	GATAG	2	10	115660	115669	40 %	20 %	40 %	0 %	150387950
72	NC_009633	ACAAA	2	10	116260	116269	80 %	0 %	0 %	20 %	150387951
73	NC_009633	GAAAG	2	10	117133	117142	60 %	0 %	40 %	0 %	150387952
74	NC_009633	GATAT	2	10	117514	117523	40 %	40 %	20 %	0 %	150387953
75	NC_009633	ATATT	2	10	118315	118324	40 %	60 %	0 %	0 %	150387953
76	NC_009633	ATTTT	2	10	120436	120445	20 %	80 %	0 %	0 %	150387955
77	NC_009633	AATAT	2	10	123972	123981	60 %	40 %	0 %	0 %	150387957
78	NC_009633	AAATG	2	10	129286	129295	60 %	20 %	20 %	0 %	150387962
79	NC_009633	GAATC	2	10	130587	130596	40 %	20 %	20 %	20 %	150387962
80	NC_009633	AGATA	2	10	132889	132898	60 %	20 %	20 %	0 %	150387965
81	NC_009633	CTATT	2	10	135257	135266	20 %	60 %	0 %	20 %	150387968
82	NC_009633	TTTCT	2	10	136046	136055	0 %	80 %	0 %	20 %	150387969
83	NC_009633	GCAGT	2	10	136807	136816	20 %	20 %	40 %	20 %	150387969
84	NC_009633	AATTC	2	10	136840	136849	40 %	40 %	0 %	20 %	150387969
85	NC_009633	AAAAG	2	10	136908	136917	80 %	0 %	20 %	0 %	150387969
86	NC_009633	TTCAT	2	10	138597	138606	20 %	60 %	0 %	20 %	150387971
87	NC_009633	CCGAT	2	10	140895	140904	20 %	20 %	20 %	40 %	150387973
88	NC_009633	AGATA	2	10	143384	143393	60 %	20 %	20 %	0 %	150387976
89	NC_009633	AAAAG	2	10	144951	144960	80 %	0 %	20 %	0 %	150387979
90	NC_009633	TATAT	2	10	145275	145284	40 %	60 %	0 %	0 %	150387979
91	NC_009633	TTGTA	2	10	145325	145334	20 %	60 %	20 %	0 %	150387979
92	NC_009633	ACTGG	2	10	157251	157260	20 %	20 %	40 %	20 %	150387989
93	NC_009633	TGTTA	2	10	161471	161480	20 %	60 %	20 %	0 %	150387995
94	NC_009633	TTTAG	2	10	162784	162793	20 %	60 %	20 %	0 %	150387996
95	NC_009633	CGAAG	2	10	165156	165165	40 %	0 %	40 %	20 %	150387997
96	NC_009633	TCAAT	2	10	165899	165908	40 %	40 %	0 %	20 %	150387998
97	NC_009633	TTCCA	2	10	168565	168574	20 %	40 %	0 %	40 %	150387999
98	NC_009633	TGCCA	2	10	172112	172121	20 %	20 %	20 %	40 %	150388002
99	NC_009633	GTGGC	2	10	175699	175708	0 %	20 %	60 %	20 %	150388006
100	NC_009633	TATGA	2	10	175770	175779	40 %	40 %	20 %	0 %	150388006
101	NC_009633	GATCA	2	10	176457	176466	40 %	20 %	20 %	20 %	150388007
102	NC_009633	AAAGG	2	10	177296	177305	60 %	0 %	40 %	0 %	150388007
103	NC_009633	AAAAG	2	10	179342	179351	80 %	0 %	20 %	0 %	150388007
104	NC_009633	ACTGC	2	10	179643	179652	20 %	20 %	20 %	40 %	150388008
105	NC_009633	GCAGT	2	10	180286	180295	20 %	20 %	40 %	20 %	150388008
106	NC_009633	TCTAT	2	10	181729	181738	20 %	60 %	0 %	20 %	150388010
107	NC_009633	GAGAT	2	10	185103	185112	40 %	20 %	40 %	0 %	150388013
108	NC_009633	GAAAT	2	10	185371	185380	60 %	20 %	20 %	0 %	150388014
109	NC_009633	AAGCA	2	10	185533	185542	60 %	0 %	20 %	20 %	150388014
110	NC_009633	GTCAA	2	10	188639	188648	40 %	20 %	20 %	20 %	150388019
111	NC_009633	CTTTA	2	10	190794	190803	20 %	60 %	0 %	20 %	150388020
112	NC_009633	GGGGA	2	10	191726	191735	20 %	0 %	80 %	0 %	150388021
113	NC_009633	TCATT	2	10	191920	191929	20 %	60 %	0 %	20 %	150388021
114	NC_009633	CAGTC	2	10	192050	192059	20 %	20 %	20 %	40 %	150388021
115	NC_009633	TTACA	2	10	193316	193325	40 %	40 %	0 %	20 %	150388024
116	NC_009633	GAGAT	2	10	193399	193408	40 %	20 %	40 %	0 %	150388024
117	NC_009633	AGTAA	2	10	195704	195713	60 %	20 %	20 %	0 %	150388026
118	NC_009633	ATTCC	2	10	196123	196132	20 %	40 %	0 %	40 %	150388026
119	NC_009633	GAAAT	2	10	199000	199009	60 %	20 %	20 %	0 %	150388027
120	NC_009633	TCGAA	2	10	202700	202709	40 %	20 %	20 %	20 %	150388027
121	NC_009633	AACCA	2	10	203306	203315	60 %	0 %	0 %	40 %	150388027
122	NC_009633	GCAGA	2	10	203961	203970	40 %	0 %	40 %	20 %	150388027
123	NC_009633	AATGA	2	10	209560	209569	60 %	20 %	20 %	0 %	150388030
124	NC_009633	TGATA	2	10	212816	212825	40 %	40 %	20 %	0 %	150388031
125	NC_009633	GTAAA	2	10	214514	214523	60 %	20 %	20 %	0 %	150388032
126	NC_009633	AGATT	2	10	215699	215708	40 %	40 %	20 %	0 %	150388033
127	NC_009633	GAAAT	2	10	216400	216409	60 %	20 %	20 %	0 %	150388034
128	NC_009633	AAATC	2	10	216947	216956	60 %	20 %	0 %	20 %	150388034
129	NC_009633	ATGCC	2	10	218023	218032	20 %	20 %	20 %	40 %	150388035
130	NC_009633	ATGCT	2	10	219063	219072	20 %	40 %	20 %	20 %	150388035
131	NC_009633	GATTT	2	10	220224	220233	20 %	60 %	20 %	0 %	150388035
132	NC_009633	AGCGA	2	10	220488	220497	40 %	0 %	40 %	20 %	150388035
133	NC_009633	GTCAT	2	10	221630	221639	20 %	40 %	20 %	20 %	150388037
134	NC_009633	GGATT	2	10	221680	221689	20 %	40 %	40 %	0 %	150388037
135	NC_009633	TAATC	2	10	223582	223591	40 %	40 %	0 %	20 %	150388037
136	NC_009633	AAATA	2	10	227239	227248	80 %	20 %	0 %	0 %	150388039
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138	NC_009633	AAGCT	2	10	228712	228721	40 %	20 %	20 %	20 %	150388040
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142	NC_009633	AAGTT	2	10	239038	239047	40 %	40 %	20 %	0 %	150388049
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173	NC_009633	CTTTT	2	10	289816	289825	0 %	80 %	0 %	20 %	150388092
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177	NC_009633	TGATA	2	10	297229	297238	40 %	40 %	20 %	0 %	150388100
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199	NC_009633	ATTGT	2	10	321569	321578	20 %	60 %	20 %	0 %	150388125
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246	NC_009633	TATAG	2	10	387351	387360	40 %	40 %	20 %	0 %	150388190
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248	NC_009633	AGCAA	2	10	391512	391521	60 %	0 %	20 %	20 %	150388194
249	NC_009633	AAGAA	2	10	392601	392610	80 %	0 %	20 %	0 %	150388196
250	NC_009633	TTATT	2	10	393603	393612	20 %	80 %	0 %	0 %	150388197
251	NC_009633	ATGGA	2	10	393851	393860	40 %	20 %	40 %	0 %	150388197
252	NC_009633	AATTG	2	10	394142	394151	40 %	40 %	20 %	0 %	150388197
253	NC_009633	AAATG	2	10	395427	395436	60 %	20 %	20 %	0 %	150388198
254	NC_009633	TAGAA	2	10	396212	396221	60 %	20 %	20 %	0 %	150388199
255	NC_009633	AATGG	2	10	396444	396453	40 %	20 %	40 %	0 %	150388199
256	NC_009633	CTAAA	2	10	397532	397541	60 %	20 %	0 %	20 %	150388200
257	NC_009633	ATGAA	2	10	399801	399810	60 %	20 %	20 %	0 %	150388203
258	NC_009633	AAAAG	2	10	401074	401083	80 %	0 %	20 %	0 %	150388203
259	NC_009633	CAGGA	2	10	401622	401631	40 %	0 %	40 %	20 %	150388203
260	NC_009633	AAAAG	2	10	402433	402442	80 %	0 %	20 %	0 %	150388203
261	NC_009633	GTATA	2	10	405559	405568	40 %	40 %	20 %	0 %	150388207
262	NC_009633	ATTCA	2	10	405725	405734	40 %	40 %	0 %	20 %	150388207
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