MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 3346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009633	GGATG	2	10	3625003	3625012	20 %	20 %	60 %	0 %	150391273
2502	NC_009633	TCCCA	2	10	3625186	3625195	20 %	20 %	0 %	60 %	150391273
2503	NC_009633	ACCCT	2	10	3626245	3626254	20 %	20 %	0 %	60 %	150391273
2504	NC_009633	AGCGA	2	10	3628024	3628033	40 %	0 %	40 %	20 %	150391274
2505	NC_009633	GATAC	2	10	3629845	3629854	40 %	20 %	20 %	20 %	150391275
2506	NC_009633	ATATA	2	10	3630734	3630743	60 %	40 %	0 %	0 %	150391275
2507	NC_009633	TCATG	2	10	3631520	3631529	20 %	40 %	20 %	20 %	150391275
2508	NC_009633	TATAC	2	10	3632062	3632071	40 %	40 %	0 %	20 %	150391275
2509	NC_009633	CATGG	2	10	3632154	3632163	20 %	20 %	40 %	20 %	150391275
2510	NC_009633	TCAAA	2	10	3632351	3632360	60 %	20 %	0 %	20 %	150391275
2511	NC_009633	CTCTA	2	10	3633306	3633315	20 %	40 %	0 %	40 %	150391275
2512	NC_009633	TCCCT	2	10	3633989	3633998	0 %	40 %	0 %	60 %	150391275
2513	NC_009633	CATTT	2	10	3634683	3634692	20 %	60 %	0 %	20 %	150391276
2514	NC_009633	ATTTT	2	10	3635623	3635632	20 %	80 %	0 %	0 %	150391277
2515	NC_009633	ATATA	2	10	3635837	3635846	60 %	40 %	0 %	0 %	150391277
2516	NC_009633	CTTTA	2	10	3640800	3640809	20 %	60 %	0 %	20 %	150391282
2517	NC_009633	TCTGC	2	10	3643361	3643370	0 %	40 %	20 %	40 %	150391285
2518	NC_009633	AAAAT	2	10	3644410	3644419	80 %	20 %	0 %	0 %	150391285
2519	NC_009633	CTTTT	2	10	3646696	3646705	0 %	80 %	0 %	20 %	150391287
2520	NC_009633	AAAAC	2	10	3647706	3647715	80 %	0 %	0 %	20 %	150391288
2521	NC_009633	TTAAA	2	10	3647887	3647896	60 %	40 %	0 %	0 %	150391288
2522	NC_009633	TTTTA	2	10	3653463	3653472	20 %	80 %	0 %	0 %	150391294
2523	NC_009633	TATCT	2	10	3653670	3653679	20 %	60 %	0 %	20 %	150391294
2524	NC_009633	TCCTT	2	10	3656337	3656346	0 %	60 %	0 %	40 %	150391298
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2528	NC_009633	CTCTT	2	10	3662564	3662573	0 %	60 %	0 %	40 %	150391304
2529	NC_009633	TGATT	2	10	3664129	3664138	20 %	60 %	20 %	0 %	150391305
2530	NC_009633	TGTAC	2	10	3664370	3664379	20 %	40 %	20 %	20 %	150391305
2531	NC_009633	TTCTT	2	10	3671536	3671545	0 %	80 %	0 %	20 %	150391311
2532	NC_009633	TTGCT	2	10	3671598	3671607	0 %	60 %	20 %	20 %	150391311
2533	NC_009633	TTCTC	2	10	3673390	3673399	0 %	60 %	0 %	40 %	150391313
2534	NC_009633	TTCAA	2	10	3674625	3674634	40 %	40 %	0 %	20 %	150391314
2535	NC_009633	GGCTT	2	10	3678848	3678857	0 %	40 %	40 %	20 %	150391317
2536	NC_009633	CTCAC	2	10	3678878	3678887	20 %	20 %	0 %	60 %	150391317
2537	NC_009633	AAATA	2	10	3679453	3679462	80 %	20 %	0 %	0 %	150391317
2538	NC_009633	CTTTG	2	10	3681857	3681866	0 %	60 %	20 %	20 %	150391319
2539	NC_009633	ATTTA	2	10	3681962	3681971	40 %	60 %	0 %	0 %	150391320
2540	NC_009633	TGCAT	2	10	3684444	3684453	20 %	40 %	20 %	20 %	150391321
2541	NC_009633	CTTCC	2	10	3684690	3684699	0 %	40 %	0 %	60 %	150391322
2542	NC_009633	AGGTA	2	10	3684756	3684765	40 %	20 %	40 %	0 %	150391322
2543	NC_009633	CATGG	2	10	3685265	3685274	20 %	20 %	40 %	20 %	150391322
2544	NC_009633	ATTCG	2	10	3686369	3686378	20 %	40 %	20 %	20 %	150391323
2545	NC_009633	CTTTT	2	10	3689624	3689633	0 %	80 %	0 %	20 %	150391326
2546	NC_009633	TAACT	2	10	3690619	3690628	40 %	40 %	0 %	20 %	150391327
2547	NC_009633	TCTTT	2	10	3690771	3690780	0 %	80 %	0 %	20 %	150391327
2548	NC_009633	CCTTA	2	10	3692222	3692231	20 %	40 %	0 %	40 %	150391329
2549	NC_009633	TTTCT	2	10	3692404	3692413	0 %	80 %	0 %	20 %	150391329
2550	NC_009633	TTCCT	2	10	3692414	3692423	0 %	60 %	0 %	40 %	150391329
2551	NC_009633	TTTCC	2	10	3693163	3693172	0 %	60 %	0 %	40 %	150391330
2552	NC_009633	CCATC	2	10	3693920	3693929	20 %	20 %	0 %	60 %	150391331
2553	NC_009633	TAAAA	2	10	3695410	3695419	80 %	20 %	0 %	0 %	150391332
2554	NC_009633	CCATA	2	10	3696218	3696227	40 %	20 %	0 %	40 %	150391334
2555	NC_009633	TCATG	2	10	3697248	3697257	20 %	40 %	20 %	20 %	150391335
2556	NC_009633	CTTCT	2	10	3697677	3697686	0 %	60 %	0 %	40 %	150391335
2557	NC_009633	TGGAG	2	10	3699712	3699721	20 %	20 %	60 %	0 %	150391337
2558	NC_009633	GATGC	2	10	3699875	3699884	20 %	20 %	40 %	20 %	150391337
2559	NC_009633	TGGTG	2	10	3700087	3700096	0 %	40 %	60 %	0 %	150391337
2560	NC_009633	CAAAC	2	10	3701240	3701249	60 %	0 %	0 %	40 %	150391338
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2563	NC_009633	CCATC	2	10	3705962	3705971	20 %	20 %	0 %	60 %	150391341
2564	NC_009633	AAATT	2	10	3706139	3706148	60 %	40 %	0 %	0 %	150391341
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2571	NC_009633	AAATT	2	10	3712155	3712164	60 %	40 %	0 %	0 %	150391346
2572	NC_009633	AAGAT	2	10	3713210	3713219	60 %	20 %	20 %	0 %	150391347
2573	NC_009633	TAATC	2	10	3715211	3715220	40 %	40 %	0 %	20 %	150391349
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2588	NC_009633	GTAGC	2	10	3729678	3729687	20 %	20 %	40 %	20 %	150391362
2589	NC_009633	AATGC	2	10	3733046	3733055	40 %	20 %	20 %	20 %	150391364
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2597	NC_009633	TTGCT	2	10	3742715	3742724	0 %	60 %	20 %	20 %	150391373
2598	NC_009633	CCTTT	2	10	3743369	3743378	0 %	60 %	0 %	40 %	150391374
2599	NC_009633	TAATT	2	10	3745315	3745324	40 %	60 %	0 %	0 %	150391375
2600	NC_009633	TGTAT	2	10	3745513	3745522	20 %	60 %	20 %	0 %	150391375
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2604	NC_009633	CCCAT	2	10	3763281	3763290	20 %	20 %	0 %	60 %	150391396
2605	NC_009633	TGTGG	2	10	3763315	3763324	0 %	40 %	60 %	0 %	150391396
2606	NC_009633	TGCAA	2	10	3766058	3766067	40 %	20 %	20 %	20 %	150391398
2607	NC_009633	TACTG	2	10	3766923	3766932	20 %	40 %	20 %	20 %	150391399
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2997	NC_009633	ATGAT	2	10	4348491	4348500	40 %	40 %	20 %	0 %	150391929
2998	NC_009633	TCTTT	2	10	4350158	4350167	0 %	80 %	0 %	20 %	150391931
2999	NC_009633	ATAGG	2	10	4350652	4350661	40 %	20 %	40 %	0 %	150391931
3000	NC_009633	CTAGA	2	10	4354987	4354996	40 %	20 %	20 %	20 %	150391934

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