MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 3346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009633	TTCGA	2	10	1440316	1440325	20 %	40 %	20 %	20 %	150389190
1002	NC_009633	ATTCC	2	10	1440880	1440889	20 %	40 %	0 %	40 %	150389190
1003	NC_009633	TTTTG	2	10	1442382	1442391	0 %	80 %	20 %	0 %	150389192
1004	NC_009633	GTGAA	2	10	1442558	1442567	40 %	20 %	40 %	0 %	150389192
1005	NC_009633	GTGTT	2	10	1444119	1444128	0 %	60 %	40 %	0 %	150389193
1006	NC_009633	TTTAC	2	10	1446846	1446855	20 %	60 %	0 %	20 %	150389197
1007	NC_009633	GCAAA	2	10	1447522	1447531	60 %	0 %	20 %	20 %	150389197
1008	NC_009633	ATTGA	2	10	1448788	1448797	40 %	40 %	20 %	0 %	150389198
1009	NC_009633	TTTTG	2	10	1449478	1449487	0 %	80 %	20 %	0 %	150389199
1010	NC_009633	TTCTC	2	10	1449829	1449838	0 %	60 %	0 %	40 %	150389200
1011	NC_009633	TAATA	2	10	1450313	1450322	60 %	40 %	0 %	0 %	150389201
1012	NC_009633	TATTG	2	10	1451138	1451147	20 %	60 %	20 %	0 %	150389202
1013	NC_009633	ATGTT	2	10	1453194	1453203	20 %	60 %	20 %	0 %	150389203
1014	NC_009633	CCGAT	2	10	1453532	1453541	20 %	20 %	20 %	40 %	150389203
1015	NC_009633	AGAAA	2	10	1457459	1457468	80 %	0 %	20 %	0 %	150389206
1016	NC_009633	TAGCC	2	10	1458576	1458585	20 %	20 %	20 %	40 %	150389208
1017	NC_009633	GGGAA	2	10	1459409	1459418	40 %	0 %	60 %	0 %	150389209
1018	NC_009633	TATTC	2	10	1459684	1459693	20 %	60 %	0 %	20 %	150389209
1019	NC_009633	AAAGA	2	10	1460326	1460335	80 %	0 %	20 %	0 %	150389210
1020	NC_009633	GTTCA	2	10	1462345	1462354	20 %	40 %	20 %	20 %	150389212
1021	NC_009633	CTGGA	2	10	1462482	1462491	20 %	20 %	40 %	20 %	150389212
1022	NC_009633	TCAAA	3	15	1465130	1465144	60 %	20 %	0 %	20 %	150389213
1023	NC_009633	GATAA	2	10	1467964	1467973	60 %	20 %	20 %	0 %	150389216
1024	NC_009633	AGAAT	2	10	1470670	1470679	60 %	20 %	20 %	0 %	150389219
1025	NC_009633	ATGGT	2	10	1472196	1472205	20 %	40 %	40 %	0 %	150389220
1026	NC_009633	GAAGA	2	10	1474461	1474470	60 %	0 %	40 %	0 %	150389221
1027	NC_009633	ACAAT	2	10	1479817	1479826	60 %	20 %	0 %	20 %	150389227
1028	NC_009633	AGTAT	2	10	1480612	1480621	40 %	40 %	20 %	0 %	150389228
1029	NC_009633	TGTAG	2	10	1481292	1481301	20 %	40 %	40 %	0 %	150389229
1030	NC_009633	TGTGT	2	10	1483614	1483623	0 %	60 %	40 %	0 %	150389232
1031	NC_009633	AGTGG	2	10	1484891	1484900	20 %	20 %	60 %	0 %	150389233
1032	NC_009633	TAAAC	2	10	1486021	1486030	60 %	20 %	0 %	20 %	150389234
1033	NC_009633	GAAAA	2	10	1486288	1486297	80 %	0 %	20 %	0 %	150389235
1034	NC_009633	TAAAC	2	10	1486412	1486421	60 %	20 %	0 %	20 %	150389235
1035	NC_009633	TTTTA	2	10	1486510	1486519	20 %	80 %	0 %	0 %	150389235
1036	NC_009633	ACATT	2	10	1486584	1486593	40 %	40 %	0 %	20 %	150389235
1037	NC_009633	TAAAT	2	10	1490006	1490015	60 %	40 %	0 %	0 %	150389239
1038	NC_009633	TGTTA	2	10	1491359	1491368	20 %	60 %	20 %	0 %	150389241
1039	NC_009633	AAAAT	2	10	1491435	1491444	80 %	20 %	0 %	0 %	150389241
1040	NC_009633	AAAAT	2	10	1492430	1492439	80 %	20 %	0 %	0 %	150389243
1041	NC_009633	AATTT	2	10	1494032	1494041	40 %	60 %	0 %	0 %	150389245
1042	NC_009633	AAAAG	2	10	1495678	1495687	80 %	0 %	20 %	0 %	150389248
1043	NC_009633	AAAGA	2	10	1496559	1496568	80 %	0 %	20 %	0 %	150389249
1044	NC_009633	TCATA	2	10	1497440	1497449	40 %	40 %	0 %	20 %	150389250
1045	NC_009633	TAAAT	2	10	1497526	1497535	60 %	40 %	0 %	0 %	150389250
1046	NC_009633	ATGAA	2	10	1500130	1500139	60 %	20 %	20 %	0 %	150389253
1047	NC_009633	AAAAC	2	10	1501774	1501783	80 %	0 %	0 %	20 %	150389254
1048	NC_009633	AAAGT	2	10	1502616	1502625	60 %	20 %	20 %	0 %	150389254
1049	NC_009633	TGGAG	2	10	1507039	1507048	20 %	20 %	60 %	0 %	150389257
1050	NC_009633	AAAAC	2	10	1508770	1508779	80 %	0 %	0 %	20 %	150389258
1051	NC_009633	ATGCT	2	10	1511091	1511100	20 %	40 %	20 %	20 %	150389259
1052	NC_009633	GGGAA	2	10	1511620	1511629	40 %	0 %	60 %	0 %	150389259
1053	NC_009633	ACTCA	2	10	1511834	1511843	40 %	20 %	0 %	40 %	150389259
1054	NC_009633	TTTTA	2	10	1513733	1513742	20 %	80 %	0 %	0 %	150389260
1055	NC_009633	TGGAT	2	10	1514314	1514323	20 %	40 %	40 %	0 %	150389260
1056	NC_009633	AGTGA	2	10	1514840	1514849	40 %	20 %	40 %	0 %	150389261
1057	NC_009633	TCATT	2	10	1515217	1515226	20 %	60 %	0 %	20 %	150389261
1058	NC_009633	CAAAT	2	10	1515461	1515470	60 %	20 %	0 %	20 %	150389262
1059	NC_009633	CTTTT	2	10	1516296	1516305	0 %	80 %	0 %	20 %	150389263
1060	NC_009633	AGATA	2	10	1518639	1518648	60 %	20 %	20 %	0 %	150389267
1061	NC_009633	TTAAC	2	10	1519346	1519355	40 %	40 %	0 %	20 %	150389267
1062	NC_009633	TAAAA	2	10	1524150	1524159	80 %	20 %	0 %	0 %	150389273
1063	NC_009633	AACAA	2	10	1525906	1525915	80 %	0 %	0 %	20 %	150389276
1064	NC_009633	CCAAC	2	10	1536811	1536820	40 %	0 %	0 %	60 %	150389284
1065	NC_009633	TACAA	2	10	1540786	1540795	60 %	20 %	0 %	20 %	150389286
1066	NC_009633	TCACT	2	10	1543445	1543454	20 %	40 %	0 %	40 %	150389290
1067	NC_009633	ATTCT	2	10	1544655	1544664	20 %	60 %	0 %	20 %	150389291
1068	NC_009633	ATTTT	2	10	1546254	1546263	20 %	80 %	0 %	0 %	150389293
1069	NC_009633	TGGAA	2	10	1548219	1548228	40 %	20 %	40 %	0 %	150389295
1070	NC_009633	ACAAG	2	10	1551701	1551710	60 %	0 %	20 %	20 %	150389298
1071	NC_009633	ATGAA	2	10	1554315	1554324	60 %	20 %	20 %	0 %	150389299
1072	NC_009633	CATGG	2	10	1555187	1555196	20 %	20 %	40 %	20 %	150389300
1073	NC_009633	ATGAA	2	10	1556339	1556348	60 %	20 %	20 %	0 %	150389302
1074	NC_009633	TGGAA	2	10	1557161	1557170	40 %	20 %	40 %	0 %	150389302
1075	NC_009633	GAAAT	2	10	1557658	1557667	60 %	20 %	20 %	0 %	150389302
1076	NC_009633	ATGAA	2	10	1557710	1557719	60 %	20 %	20 %	0 %	150389302
1077	NC_009633	GCAGA	2	10	1559699	1559708	40 %	0 %	40 %	20 %	150389303
1078	NC_009633	GGTGA	2	10	1562243	1562252	20 %	20 %	60 %	0 %	150389305
1079	NC_009633	AATCA	2	10	1563416	1563425	60 %	20 %	0 %	20 %	150389306
1080	NC_009633	AGAAA	2	10	1563961	1563970	80 %	0 %	20 %	0 %	150389307
1081	NC_009633	AAAGG	2	10	1566089	1566098	60 %	0 %	40 %	0 %	150389309
1082	NC_009633	TTTGA	2	10	1566639	1566648	20 %	60 %	20 %	0 %	150389310
1083	NC_009633	GATCA	2	10	1566836	1566845	40 %	20 %	20 %	20 %	150389310
1084	NC_009633	GATTT	2	10	1570300	1570309	20 %	60 %	20 %	0 %	150389314
1085	NC_009633	ATTAT	2	10	1572409	1572418	40 %	60 %	0 %	0 %	150389316
1086	NC_009633	GTTTT	2	10	1574307	1574316	0 %	80 %	20 %	0 %	150389317
1087	NC_009633	AGCTT	2	10	1575204	1575213	20 %	40 %	20 %	20 %	150389318
1088	NC_009633	CCATG	2	10	1575263	1575272	20 %	20 %	20 %	40 %	150389318
1089	NC_009633	TGCTA	2	10	1576046	1576055	20 %	40 %	20 %	20 %	150389319
1090	NC_009633	ATAGT	2	10	1580905	1580914	40 %	40 %	20 %	0 %	150389322
1091	NC_009633	AAGCC	2	10	1584313	1584322	40 %	0 %	20 %	40 %	150389324
1092	NC_009633	TAAGA	2	10	1584655	1584664	60 %	20 %	20 %	0 %	150389324
1093	NC_009633	CAATT	2	10	1585911	1585920	40 %	40 %	0 %	20 %	150389325
1094	NC_009633	TAGAG	2	10	1586166	1586175	40 %	20 %	40 %	0 %	150389325
1095	NC_009633	CAGAA	2	10	1586184	1586193	60 %	0 %	20 %	20 %	150389325
1096	NC_009633	TTGGT	2	10	1587566	1587575	0 %	60 %	40 %	0 %	150389325
1097	NC_009633	ATTAT	2	10	1587625	1587634	40 %	60 %	0 %	0 %	150389325
1098	NC_009633	TATTG	2	10	1587750	1587759	20 %	60 %	20 %	0 %	150389325
1099	NC_009633	ATTCT	2	10	1590739	1590748	20 %	60 %	0 %	20 %	150389327
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1101	NC_009633	TGTTA	2	10	1594401	1594410	20 %	60 %	20 %	0 %	150389329
1102	NC_009633	ATGTA	2	10	1597389	1597398	40 %	40 %	20 %	0 %	150389331
1103	NC_009633	TAACA	2	10	1601561	1601570	60 %	20 %	0 %	20 %	150389333
1104	NC_009633	AGGAG	2	10	1608605	1608614	40 %	0 %	60 %	0 %	150389334
1105	NC_009633	AAACC	2	10	1608918	1608927	60 %	0 %	0 %	40 %	150389334
1106	NC_009633	TTCTT	2	10	1610594	1610603	0 %	80 %	0 %	20 %	150389335
1107	NC_009633	GTTTC	2	10	1611767	1611776	0 %	60 %	20 %	20 %	150389336
1108	NC_009633	TGTTA	2	10	1612623	1612632	20 %	60 %	20 %	0 %	150389337
1109	NC_009633	CTTTA	2	10	1614205	1614214	20 %	60 %	0 %	20 %	150389338
1110	NC_009633	TCAAT	2	10	1614267	1614276	40 %	40 %	0 %	20 %	150389338
1111	NC_009633	AATGA	2	10	1615776	1615785	60 %	20 %	20 %	0 %	150389339
1112	NC_009633	ATCTT	2	10	1619350	1619359	20 %	60 %	0 %	20 %	150389341
1113	NC_009633	TGATG	2	10	1620705	1620714	20 %	40 %	40 %	0 %	150389343
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1116	NC_009633	ATTTC	2	10	1628654	1628663	20 %	60 %	0 %	20 %	150389348
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1119	NC_009633	ATTAT	2	10	1634235	1634244	40 %	60 %	0 %	0 %	150389354
1120	NC_009633	TCATT	2	10	1639805	1639814	20 %	60 %	0 %	20 %	150389358
1121	NC_009633	GCTTT	2	10	1640087	1640096	0 %	60 %	20 %	20 %	150389358
1122	NC_009633	CTGGT	2	10	1640141	1640150	0 %	40 %	40 %	20 %	150389358
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