MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 3346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009633	TTCAT	2	10	4356697	4356706	20 %	60 %	0 %	20 %	150391936
3002	NC_009633	TTTCA	2	10	4357023	4357032	20 %	60 %	0 %	20 %	150391936
3003	NC_009633	TATAA	2	10	4357139	4357148	60 %	40 %	0 %	0 %	150391936
3004	NC_009633	ATGGC	2	10	4357301	4357310	20 %	20 %	40 %	20 %	150391936
3005	NC_009633	AAGTT	2	10	4358226	4358235	40 %	40 %	20 %	0 %	150391937
3006	NC_009633	CATTT	2	10	4358252	4358261	20 %	60 %	0 %	20 %	150391937
3007	NC_009633	GTTGT	2	10	4358389	4358398	0 %	60 %	40 %	0 %	150391937
3008	NC_009633	TTCTT	2	10	4359361	4359370	0 %	80 %	0 %	20 %	150391937
3009	NC_009633	CTTCT	2	10	4359467	4359476	0 %	60 %	0 %	40 %	150391937
3010	NC_009633	TATCT	2	10	4359691	4359700	20 %	60 %	0 %	20 %	150391938
3011	NC_009633	TCTTT	2	10	4360380	4360389	0 %	80 %	0 %	20 %	150391939
3012	NC_009633	TTCAT	2	10	4361022	4361031	20 %	60 %	0 %	20 %	150391940
3013	NC_009633	CCTTT	2	10	4364664	4364673	0 %	60 %	0 %	40 %	150391942
3014	NC_009633	ATATC	2	10	4365447	4365456	40 %	40 %	0 %	20 %	150391943
3015	NC_009633	AAATA	2	10	4367065	4367074	80 %	20 %	0 %	0 %	150391944
3016	NC_009633	GTCTT	2	10	4368762	4368771	0 %	60 %	20 %	20 %	150391946
3017	NC_009633	AAAGC	2	10	4368772	4368781	60 %	0 %	20 %	20 %	150391946
3018	NC_009633	CTTTT	2	10	4370723	4370732	0 %	80 %	0 %	20 %	150391949
3019	NC_009633	TACAA	2	10	4371154	4371163	60 %	20 %	0 %	20 %	150391949
3020	NC_009633	ATTTT	2	10	4372256	4372265	20 %	80 %	0 %	0 %	150391950
3021	NC_009633	CATTG	2	10	4374424	4374433	20 %	40 %	20 %	20 %	150391953
3022	NC_009633	TTTTA	2	10	4377081	4377090	20 %	80 %	0 %	0 %	150391955
3023	NC_009633	AACTT	2	10	4377190	4377199	40 %	40 %	0 %	20 %	150391956
3024	NC_009633	TACTG	2	10	4377360	4377369	20 %	40 %	20 %	20 %	150391956
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3031	NC_009633	TGCTC	2	10	4388278	4388287	0 %	40 %	20 %	40 %	150391965
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3033	NC_009633	AAATA	2	10	4395204	4395213	80 %	20 %	0 %	0 %	150391973
3034	NC_009633	CTTTT	2	10	4397534	4397543	0 %	80 %	0 %	20 %	150391976
3035	NC_009633	TGATT	2	10	4397831	4397840	20 %	60 %	20 %	0 %	150391976
3036	NC_009633	TCTTT	2	10	4398017	4398026	0 %	80 %	0 %	20 %	150391976
3037	NC_009633	CCATT	2	10	4398215	4398224	20 %	40 %	0 %	40 %	150391976
3038	NC_009633	TGCCC	2	10	4398272	4398281	0 %	20 %	20 %	60 %	150391976
3039	NC_009633	AAAAC	2	10	4402821	4402830	80 %	0 %	0 %	20 %	150391979
3040	NC_009633	TCTTG	2	10	4404170	4404179	0 %	60 %	20 %	20 %	150391981
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3042	NC_009633	TGTTT	2	10	4404670	4404679	0 %	80 %	20 %	0 %	150391981
3043	NC_009633	TTGTG	2	10	4409370	4409379	0 %	60 %	40 %	0 %	150391983
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3046	NC_009633	TGCTT	2	10	4422186	4422195	0 %	60 %	20 %	20 %	150391995
3047	NC_009633	GCATT	2	10	4422539	4422548	20 %	40 %	20 %	20 %	150391995
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3049	NC_009633	TCTCA	2	10	4424718	4424727	20 %	40 %	0 %	40 %	150391997
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3059	NC_009633	CTTTT	2	10	4465909	4465918	0 %	80 %	0 %	20 %	150392011
3060	NC_009633	GTTTT	2	10	4466056	4466065	0 %	80 %	20 %	0 %	150392011
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3062	NC_009633	TTATT	2	10	4469409	4469418	20 %	80 %	0 %	0 %	150392016
3063	NC_009633	TTCTT	2	10	4469540	4469549	0 %	80 %	0 %	20 %	150392017
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3077	NC_009633	ATTTT	2	10	4489612	4489621	20 %	80 %	0 %	0 %	150392043
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3095	NC_009633	ATTTT	2	10	4512362	4512371	20 %	80 %	0 %	0 %	150392083
3096	NC_009633	CTTTT	2	10	4514306	4514315	0 %	80 %	0 %	20 %	150392084
3097	NC_009633	TGAAT	2	10	4514373	4514382	40 %	40 %	20 %	0 %	150392084
3098	NC_009633	GCACT	2	10	4514405	4514414	20 %	20 %	20 %	40 %	150392084
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3107	NC_009633	GTTTT	2	10	4527599	4527608	0 %	80 %	20 %	0 %	150392094
3108	NC_009633	CCCAT	2	10	4528057	4528066	20 %	20 %	0 %	60 %	150392094
3109	NC_009633	TCAAT	2	10	4529503	4529512	40 %	40 %	0 %	20 %	150392095
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3113	NC_009633	ACAAG	2	10	4538080	4538089	60 %	0 %	20 %	20 %	150392102
3114	NC_009633	CTTGC	2	10	4538167	4538176	0 %	40 %	20 %	40 %	150392102
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3121	NC_009633	ACCCC	2	10	4544179	4544188	20 %	0 %	0 %	80 %	150392108
3122	NC_009633	CATTT	2	10	4544518	4544527	20 %	60 %	0 %	20 %	150392109
3123	NC_009633	TTAAA	2	10	4545653	4545662	60 %	40 %	0 %	0 %	150392111
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.