MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 3346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009633	AGCTT	2	10	2943018	2943027	20 %	40 %	20 %	20 %	150390686
2002	NC_009633	TTGCT	2	10	2943059	2943068	0 %	60 %	20 %	20 %	150390686
2003	NC_009633	TTTCA	2	10	2944562	2944571	20 %	60 %	0 %	20 %	150390686
2004	NC_009633	CTTTA	2	10	2948813	2948822	20 %	60 %	0 %	20 %	150390692
2005	NC_009633	AGAGA	2	10	2953815	2953824	60 %	0 %	40 %	0 %	150390695
2006	NC_009633	GAATA	2	10	2954731	2954740	60 %	20 %	20 %	0 %	150390696
2007	NC_009633	CAAGG	2	10	2954916	2954925	40 %	0 %	40 %	20 %	150390696
2008	NC_009633	CTTTT	2	10	2955800	2955809	0 %	80 %	0 %	20 %	150390697
2009	NC_009633	TAAAA	2	10	2956384	2956393	80 %	20 %	0 %	0 %	150390698
2010	NC_009633	CAAAT	2	10	2959216	2959225	60 %	20 %	0 %	20 %	150390700
2011	NC_009633	TCTTT	2	10	2964182	2964191	0 %	80 %	0 %	20 %	150390703
2012	NC_009633	TTATT	2	10	2966489	2966498	20 %	80 %	0 %	0 %	150390704
2013	NC_009633	ATATC	2	10	2966974	2966983	40 %	40 %	0 %	20 %	150390704
2014	NC_009633	TTTTC	2	10	2969580	2969589	0 %	80 %	0 %	20 %	150390705
2015	NC_009633	CAGTA	2	10	2978427	2978436	40 %	20 %	20 %	20 %	150390711
2016	NC_009633	TCTTT	2	10	2978969	2978978	0 %	80 %	0 %	20 %	150390712
2017	NC_009633	TTCTT	2	10	2979200	2979209	0 %	80 %	0 %	20 %	150390712
2018	NC_009633	ATCTG	2	10	2979662	2979671	20 %	40 %	20 %	20 %	150390712
2019	NC_009633	ATCTA	2	10	2984799	2984808	40 %	40 %	0 %	20 %	150390715
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2021	NC_009633	CATTT	2	10	2988015	2988024	20 %	60 %	0 %	20 %	150390718
2022	NC_009633	ATTTG	2	10	2988592	2988601	20 %	60 %	20 %	0 %	150390719
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2029	NC_009633	TCTTT	2	10	2997790	2997799	0 %	80 %	0 %	20 %	150390727
2030	NC_009633	GGAAA	2	10	2999867	2999876	60 %	0 %	40 %	0 %	150390728
2031	NC_009633	TCTTT	2	10	3001231	3001240	0 %	80 %	0 %	20 %	150390729
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2037	NC_009633	AACAA	2	10	3006217	3006226	80 %	0 %	0 %	20 %	150390734
2038	NC_009633	AAAAT	2	10	3006940	3006949	80 %	20 %	0 %	0 %	150390735
2039	NC_009633	CTTTT	2	10	3009038	3009047	0 %	80 %	0 %	20 %	150390737
2040	NC_009633	TCCTC	2	10	3009129	3009138	0 %	40 %	0 %	60 %	150390737
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2051	NC_009633	ATCCC	2	10	3026026	3026035	20 %	20 %	0 %	60 %	150390750
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2497	NC_009633	CCTTT	2	10	3619286	3619295	0 %	60 %	0 %	40 %	150391273
2498	NC_009633	TGTGT	2	10	3619518	3619527	0 %	60 %	40 %	0 %	150391273
2499	NC_009633	CATTT	2	10	3621246	3621255	20 %	60 %	0 %	20 %	150391273
2500	NC_009633	CTATT	2	10	3623084	3623093	20 %	60 %	0 %	20 %	150391273

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