MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 3346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009633	TCTTA	2	10	2272678	2272687	20 %	60 %	0 %	20 %	150389962
1502	NC_009633	AAAGT	2	10	2272905	2272914	60 %	20 %	20 %	0 %	150389962
1503	NC_009633	AGAAA	2	10	2273112	2273121	80 %	0 %	20 %	0 %	150389963
1504	NC_009633	GATCA	2	10	2273376	2273385	40 %	20 %	20 %	20 %	150389963
1505	NC_009633	GAAAA	2	10	2273509	2273518	80 %	0 %	20 %	0 %	150389964
1506	NC_009633	AAATC	2	10	2274232	2274241	60 %	20 %	0 %	20 %	150389964
1507	NC_009633	AAAGA	2	10	2280124	2280133	80 %	0 %	20 %	0 %	150389966
1508	NC_009633	ATTTT	2	10	2281489	2281498	20 %	80 %	0 %	0 %	150389968
1509	NC_009633	AAAGC	2	10	2282541	2282550	60 %	0 %	20 %	20 %	150389969
1510	NC_009633	GGAAT	2	10	2283330	2283339	40 %	20 %	40 %	0 %	150389969
1511	NC_009633	ATACA	2	10	2283522	2283531	60 %	20 %	0 %	20 %	150389969
1512	NC_009633	CATTC	2	10	2284186	2284195	20 %	40 %	0 %	40 %	150389970
1513	NC_009633	GATTT	2	10	2284335	2284344	20 %	60 %	20 %	0 %	150389970
1514	NC_009633	GCAGT	2	10	2288687	2288696	20 %	20 %	40 %	20 %	150389973
1515	NC_009633	AAATC	2	10	2289596	2289605	60 %	20 %	0 %	20 %	150389974
1516	NC_009633	ATTAG	2	10	2290943	2290952	40 %	40 %	20 %	0 %	150389975
1517	NC_009633	AATTT	2	10	2292568	2292577	40 %	60 %	0 %	0 %	150389978
1518	NC_009633	TGTTT	2	10	2293468	2293477	0 %	80 %	20 %	0 %	150389979
1519	NC_009633	AAAAC	2	10	2300441	2300450	80 %	0 %	0 %	20 %	150389989
1520	NC_009633	AGACA	2	10	2304242	2304251	60 %	0 %	20 %	20 %	150389992
1521	NC_009633	ACAGA	2	10	2305425	2305434	60 %	0 %	20 %	20 %	150389993
1522	NC_009633	TGAAT	2	10	2308632	2308641	40 %	40 %	20 %	0 %	150389997
1523	NC_009633	AATAG	2	10	2308686	2308695	60 %	20 %	20 %	0 %	150389997
1524	NC_009633	CAGGG	2	10	2309784	2309793	20 %	0 %	60 %	20 %	150390000
1525	NC_009633	TAAAA	2	10	2314628	2314637	80 %	20 %	0 %	0 %	150390005
1526	NC_009633	TCTTT	2	10	2315154	2315163	0 %	80 %	0 %	20 %	150390006
1527	NC_009633	ATTAA	2	10	2318572	2318581	60 %	40 %	0 %	0 %	150390010
1528	NC_009633	ATTTT	2	10	2318621	2318630	20 %	80 %	0 %	0 %	150390010
1529	NC_009633	AAACA	2	10	2318760	2318769	80 %	0 %	0 %	20 %	150390010
1530	NC_009633	TTGAA	2	10	2321325	2321334	40 %	40 %	20 %	0 %	150390013
1531	NC_009633	AGAAA	2	10	2321480	2321489	80 %	0 %	20 %	0 %	150390013
1532	NC_009633	GGAGA	2	10	2322323	2322332	40 %	0 %	60 %	0 %	150390014
1533	NC_009633	ATAAA	2	10	2322387	2322396	80 %	20 %	0 %	0 %	150390014
1534	NC_009633	ATTTA	2	10	2323056	2323065	40 %	60 %	0 %	0 %	150390016
1535	NC_009633	TGTTA	2	10	2325038	2325047	20 %	60 %	20 %	0 %	150390018
1536	NC_009633	AAAAT	2	10	2327348	2327357	80 %	20 %	0 %	0 %	150390020
1537	NC_009633	AGTGA	2	10	2330320	2330329	40 %	20 %	40 %	0 %	150390023
1538	NC_009633	TATAG	2	10	2331315	2331324	40 %	40 %	20 %	0 %	150390024
1539	NC_009633	CCAAA	2	10	2331493	2331502	60 %	0 %	0 %	40 %	150390024
1540	NC_009633	TTGTC	2	10	2332266	2332275	0 %	60 %	20 %	20 %	150390025
1541	NC_009633	AAAGG	2	10	2333249	2333258	60 %	0 %	40 %	0 %	150390026
1542	NC_009633	ACGGA	2	10	2333331	2333340	40 %	0 %	40 %	20 %	150390026
1543	NC_009633	TGAAC	2	10	2335286	2335295	40 %	20 %	20 %	20 %	150390028
1544	NC_009633	AGCGA	2	10	2335563	2335572	40 %	0 %	40 %	20 %	150390028
1545	NC_009633	GATTT	2	10	2338294	2338303	20 %	60 %	20 %	0 %	150390031
1546	NC_009633	AATCA	2	10	2340573	2340582	60 %	20 %	0 %	20 %	150390033
1547	NC_009633	TGGAT	2	10	2340773	2340782	20 %	40 %	40 %	0 %	150390033
1548	NC_009633	ATTGA	2	10	2341275	2341284	40 %	40 %	20 %	0 %	150390034
1549	NC_009633	TGGGT	2	10	2341627	2341636	0 %	40 %	60 %	0 %	150390034
1550	NC_009633	TTCTT	2	10	2343627	2343636	0 %	80 %	0 %	20 %	150390036
1551	NC_009633	GTTTT	2	10	2345036	2345045	0 %	80 %	20 %	0 %	150390037
1552	NC_009633	CAAAA	2	10	2346720	2346729	80 %	0 %	0 %	20 %	150390040
1553	NC_009633	GAAAA	2	10	2347159	2347168	80 %	0 %	20 %	0 %	150390041
1554	NC_009633	TGCTT	2	10	2348171	2348180	0 %	60 %	20 %	20 %	150390042
1555	NC_009633	ATCAG	2	10	2348891	2348900	40 %	20 %	20 %	20 %	150390043
1556	NC_009633	GAAAT	2	10	2351202	2351211	60 %	20 %	20 %	0 %	150390047
1557	NC_009633	GATTT	2	10	2352916	2352925	20 %	60 %	20 %	0 %	150390048
1558	NC_009633	AATTA	2	10	2353197	2353206	60 %	40 %	0 %	0 %	150390049
1559	NC_009633	TTTTG	2	10	2353242	2353251	0 %	80 %	20 %	0 %	150390049
1560	NC_009633	GTGAT	2	10	2354971	2354980	20 %	40 %	40 %	0 %	150390052
1561	NC_009633	GAATA	2	10	2357111	2357120	60 %	20 %	20 %	0 %	150390055
1562	NC_009633	ATTGC	2	10	2357946	2357955	20 %	40 %	20 %	20 %	150390056
1563	NC_009633	AACGA	2	10	2358134	2358143	60 %	0 %	20 %	20 %	150390056
1564	NC_009633	TGCTC	2	10	2359140	2359149	0 %	40 %	20 %	40 %	150390057
1565	NC_009633	TGGAT	2	10	2359152	2359161	20 %	40 %	40 %	0 %	150390057
1566	NC_009633	ATCAA	2	10	2359401	2359410	60 %	20 %	0 %	20 %	150390058
1567	NC_009633	AGAGA	2	10	2359411	2359420	60 %	0 %	40 %	0 %	150390058
1568	NC_009633	CAAAA	2	10	2360629	2360638	80 %	0 %	0 %	20 %	150390059
1569	NC_009633	TAATG	2	10	2360705	2360714	40 %	40 %	20 %	0 %	150390060
1570	NC_009633	TAATC	2	10	2363743	2363752	40 %	40 %	0 %	20 %	150390061
1571	NC_009633	GATAT	2	10	2364847	2364856	40 %	40 %	20 %	0 %	150390062
1572	NC_009633	CTTTT	2	10	2366839	2366848	0 %	80 %	0 %	20 %	150390066
1573	NC_009633	CATTG	2	10	2367038	2367047	20 %	40 %	20 %	20 %	150390066
1574	NC_009633	AGATG	2	10	2367386	2367395	40 %	20 %	40 %	0 %	150390066
1575	NC_009633	ATATT	2	10	2367533	2367542	40 %	60 %	0 %	0 %	150390066
1576	NC_009633	TTACA	2	10	2368102	2368111	40 %	40 %	0 %	20 %	150390067
1577	NC_009633	AAAGT	2	10	2369901	2369910	60 %	20 %	20 %	0 %	150390068
1578	NC_009633	AGAAA	2	10	2371200	2371209	80 %	0 %	20 %	0 %	150390069
1579	NC_009633	ATCGA	3	15	2371544	2371558	40 %	20 %	20 %	20 %	150390069
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1581	NC_009633	TTATT	2	10	2376076	2376085	20 %	80 %	0 %	0 %	150390076
1582	NC_009633	ACAAT	2	10	2376880	2376889	60 %	20 %	0 %	20 %	150390077
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1584	NC_009633	CAACA	2	10	2378665	2378674	60 %	0 %	0 %	40 %	150390079
1585	NC_009633	ATGGG	2	10	2380438	2380447	20 %	20 %	60 %	0 %	150390081
1586	NC_009633	ATTGG	2	10	2380874	2380883	20 %	40 %	40 %	0 %	150390081
1587	NC_009633	GGTAA	2	10	2382529	2382538	40 %	20 %	40 %	0 %	150390081
1588	NC_009633	CAAAC	2	10	2383517	2383526	60 %	0 %	0 %	40 %	150390083
1589	NC_009633	AAGTG	2	10	2384999	2385008	40 %	20 %	40 %	0 %	150390085
1590	NC_009633	TTGTT	2	10	2392402	2392411	0 %	80 %	20 %	0 %	150390091
1591	NC_009633	AAAGG	2	10	2392559	2392568	60 %	0 %	40 %	0 %	150390091
1592	NC_009633	AGCAA	2	10	2392811	2392820	60 %	0 %	20 %	20 %	150390091
1593	NC_009633	TCAAG	2	10	2393681	2393690	40 %	20 %	20 %	20 %	150390091
1594	NC_009633	CAAAG	2	10	2394458	2394467	60 %	0 %	20 %	20 %	150390092
1595	NC_009633	AATCA	2	10	2394970	2394979	60 %	20 %	0 %	20 %	150390093
1596	NC_009633	TATTT	2	10	2395346	2395355	20 %	80 %	0 %	0 %	150390093
1597	NC_009633	ATTGA	2	10	2396353	2396362	40 %	40 %	20 %	0 %	150390094
1598	NC_009633	ATAAC	2	10	2402951	2402960	60 %	20 %	0 %	20 %	150390099
1599	NC_009633	ATACA	2	10	2403272	2403281	60 %	20 %	0 %	20 %	150390099
1600	NC_009633	CCACA	2	10	2404926	2404935	40 %	0 %	0 %	60 %	150390101
1601	NC_009633	ATGCC	2	10	2405254	2405263	20 %	20 %	20 %	40 %	150390101
1602	NC_009633	TCCTC	2	10	2406432	2406441	0 %	40 %	0 %	60 %	150390103
1603	NC_009633	CACAG	2	10	2407575	2407584	40 %	0 %	20 %	40 %	150390104
1604	NC_009633	AATTA	2	10	2408682	2408691	60 %	40 %	0 %	0 %	150390104
1605	NC_009633	TTGTC	2	10	2408912	2408921	0 %	60 %	20 %	20 %	150390105
1606	NC_009633	TGTTA	2	10	2412960	2412969	20 %	60 %	20 %	0 %	150390110
1607	NC_009633	TGCCA	2	10	2413449	2413458	20 %	20 %	20 %	40 %	150390110
1608	NC_009633	CAGCT	2	10	2414549	2414558	20 %	20 %	20 %	40 %	150390112
1609	NC_009633	TGCTA	2	10	2417630	2417639	20 %	40 %	20 %	20 %	150390114
1610	NC_009633	CAGAT	2	10	2417823	2417832	40 %	20 %	20 %	20 %	150390114
1611	NC_009633	CAATT	2	10	2418568	2418577	40 %	40 %	0 %	20 %	150390115
1612	NC_009633	AAATT	2	10	2419377	2419386	60 %	40 %	0 %	0 %	150390115
1613	NC_009633	TATGG	2	10	2419623	2419632	20 %	40 %	40 %	0 %	150390115
1614	NC_009633	ACCCC	2	10	2420593	2420602	20 %	0 %	0 %	80 %	150390115
1615	NC_009633	ATGCG	2	10	2421334	2421343	20 %	20 %	40 %	20 %	150390117
1616	NC_009633	AAGAG	2	10	2421538	2421547	60 %	0 %	40 %	0 %	150390117
1617	NC_009633	GAAAA	2	10	2421740	2421749	80 %	0 %	20 %	0 %	150390117
1618	NC_009633	AGAGA	2	10	2421897	2421906	60 %	0 %	40 %	0 %	150390117
1619	NC_009633	TAAAG	2	10	2423038	2423047	60 %	20 %	20 %	0 %	150390117
1620	NC_009633	GATCT	2	10	2424428	2424437	20 %	40 %	20 %	20 %	150390119
1621	NC_009633	AAAAT	2	10	2424701	2424710	80 %	20 %	0 %	0 %	150390120
1622	NC_009633	AGGAT	2	10	2425691	2425700	40 %	20 %	40 %	0 %	150390121
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1624	NC_009633	TATAA	2	10	2430525	2430534	60 %	40 %	0 %	0 %	150390125
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1992	NC_009633	AGAGT	2	10	2935416	2935425	40 %	20 %	40 %	0 %	150390681
1993	NC_009633	TGGAA	2	10	2936003	2936012	40 %	20 %	40 %	0 %	150390681
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1996	NC_009633	CATTA	2	10	2937514	2937523	40 %	40 %	0 %	20 %	150390683
1997	NC_009633	CTTTT	2	10	2940240	2940249	0 %	80 %	0 %	20 %	150390685
1998	NC_009633	GCATC	2	10	2941745	2941754	20 %	20 %	20 %	40 %	150390685
1999	NC_009633	TTTAT	2	10	2942826	2942835	20 %	80 %	0 %	0 %	150390686
2000	NC_009633	AAGAG	2	10	2942861	2942870	60 %	0 %	40 %	0 %	150390686

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