MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 3346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009633	TATTT	2	10	759911	759920	20 %	80 %	0 %	0 %	150388546
502	NC_009633	ATATA	2	10	759953	759962	60 %	40 %	0 %	0 %	150388546
503	NC_009633	ATGCC	2	10	763478	763487	20 %	20 %	20 %	40 %	150388550
504	NC_009633	TAAAT	2	10	765406	765415	60 %	40 %	0 %	0 %	150388552
505	NC_009633	TTTTA	2	10	765788	765797	20 %	80 %	0 %	0 %	150388552
506	NC_009633	GCCAT	2	10	767345	767354	20 %	20 %	20 %	40 %	150388553
507	NC_009633	TATCA	2	10	769708	769717	40 %	40 %	0 %	20 %	150388557
508	NC_009633	TGTCA	2	10	770497	770506	20 %	40 %	20 %	20 %	150388557
509	NC_009633	ATATT	2	10	770534	770543	40 %	60 %	0 %	0 %	150388557
510	NC_009633	TTTTA	2	10	770782	770791	20 %	80 %	0 %	0 %	150388557
511	NC_009633	TCTAC	2	10	771324	771333	20 %	40 %	0 %	40 %	150388557
512	NC_009633	TGCAT	2	10	771648	771657	20 %	40 %	20 %	20 %	150388558
513	NC_009633	GACAA	2	10	772121	772130	60 %	0 %	20 %	20 %	150388558
514	NC_009633	TGAAA	2	10	772639	772648	60 %	20 %	20 %	0 %	150388559
515	NC_009633	TTTAA	2	10	773539	773548	40 %	60 %	0 %	0 %	150388561
516	NC_009633	CAGAT	2	10	774198	774207	40 %	20 %	20 %	20 %	150388562
517	NC_009633	ATGAA	2	10	776182	776191	60 %	20 %	20 %	0 %	150388564
518	NC_009633	GCACA	2	10	776416	776425	40 %	0 %	20 %	40 %	150388564
519	NC_009633	ATTAG	2	10	780896	780905	40 %	40 %	20 %	0 %	150388568
520	NC_009633	AATCC	2	10	781224	781233	40 %	20 %	0 %	40 %	150388569
521	NC_009633	AAAGG	2	10	782630	782639	60 %	0 %	40 %	0 %	150388572
522	NC_009633	TTGAT	2	10	784281	784290	20 %	60 %	20 %	0 %	150388577
523	NC_009633	GAAGA	2	10	784652	784661	60 %	0 %	40 %	0 %	150388578
524	NC_009633	AGTAA	2	10	785215	785224	60 %	20 %	20 %	0 %	150388578
525	NC_009633	GAAAA	2	10	787364	787373	80 %	0 %	20 %	0 %	150388583
526	NC_009633	TGCAT	2	10	789663	789672	20 %	40 %	20 %	20 %	150388587
527	NC_009633	TACAA	2	10	790192	790201	60 %	20 %	0 %	20 %	150388588
528	NC_009633	TAGTT	2	10	791938	791947	20 %	60 %	20 %	0 %	150388591
529	NC_009633	GCAAT	2	10	795704	795713	40 %	20 %	20 %	20 %	150388594
530	NC_009633	ACTTC	2	10	796894	796903	20 %	40 %	0 %	40 %	150388596
531	NC_009633	TGTGG	2	10	797912	797921	0 %	40 %	60 %	0 %	150388597
532	NC_009633	ATAGA	2	10	798812	798821	60 %	20 %	20 %	0 %	150388598
533	NC_009633	TTTCC	2	10	799331	799340	0 %	60 %	0 %	40 %	150388599
534	NC_009633	CTGTT	2	10	799874	799883	0 %	60 %	20 %	20 %	150388599
535	NC_009633	TTGAT	2	10	801159	801168	20 %	60 %	20 %	0 %	150388600
536	NC_009633	GTATT	2	10	802943	802952	20 %	60 %	20 %	0 %	150388602
537	NC_009633	TTTGG	2	10	803343	803352	0 %	60 %	40 %	0 %	150388602
538	NC_009633	GGGTT	2	10	803559	803568	0 %	40 %	60 %	0 %	150388602
539	NC_009633	GTTAC	2	10	803607	803616	20 %	40 %	20 %	20 %	150388602
540	NC_009633	TCGAT	2	10	805883	805892	20 %	40 %	20 %	20 %	150388605
541	NC_009633	GATGG	2	10	808053	808062	20 %	20 %	60 %	0 %	150388606
542	NC_009633	AGAAA	2	10	808743	808752	80 %	0 %	20 %	0 %	150388607
543	NC_009633	ATAAC	2	10	809170	809179	60 %	20 %	0 %	20 %	150388609
544	NC_009633	TGAAG	2	10	809288	809297	40 %	20 %	40 %	0 %	150388609
545	NC_009633	TATTG	2	10	813357	813366	20 %	60 %	20 %	0 %	150388613
546	NC_009633	GAGTT	2	10	814615	814624	20 %	40 %	40 %	0 %	150388614
547	NC_009633	GGAAT	2	10	814824	814833	40 %	20 %	40 %	0 %	150388614
548	NC_009633	ACTGG	2	10	816083	816092	20 %	20 %	40 %	20 %	150388616
549	NC_009633	TATTT	2	10	817176	817185	20 %	80 %	0 %	0 %	150388616
550	NC_009633	AATCA	2	10	820723	820732	60 %	20 %	0 %	20 %	150388620
551	NC_009633	ACATT	2	10	821735	821744	40 %	40 %	0 %	20 %	150388621
552	NC_009633	TGATT	2	10	822059	822068	20 %	60 %	20 %	0 %	150388622
553	NC_009633	ATTCG	2	10	823836	823845	20 %	40 %	20 %	20 %	150388623
554	NC_009633	AAAAG	2	10	824022	824031	80 %	0 %	20 %	0 %	150388623
555	NC_009633	TGAAA	2	10	825338	825347	60 %	20 %	20 %	0 %	150388625
556	NC_009633	TGAAA	2	10	826559	826568	60 %	20 %	20 %	0 %	150388625
557	NC_009633	GCATG	2	10	826925	826934	20 %	20 %	40 %	20 %	150388625
558	NC_009633	CAATG	2	10	827495	827504	40 %	20 %	20 %	20 %	150388625
559	NC_009633	ATCGA	2	10	827940	827949	40 %	20 %	20 %	20 %	150388626
560	NC_009633	AATAG	2	10	829077	829086	60 %	20 %	20 %	0 %	150388627
561	NC_009633	AGGGT	2	10	829751	829760	20 %	20 %	60 %	0 %	150388628
562	NC_009633	GGAAG	2	10	830097	830106	40 %	0 %	60 %	0 %	150388628
563	NC_009633	TGAAG	2	10	830259	830268	40 %	20 %	40 %	0 %	150388628
564	NC_009633	CCTAT	2	10	832674	832683	20 %	40 %	0 %	40 %	150388628
565	NC_009633	ATGAA	2	10	833483	833492	60 %	20 %	20 %	0 %	150388630
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567	NC_009633	TTTGG	2	10	840009	840018	0 %	60 %	40 %	0 %	150388635
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569	NC_009633	TTAGT	2	10	840253	840262	20 %	60 %	20 %	0 %	150388635
570	NC_009633	TGGAG	2	10	843769	843778	20 %	20 %	60 %	0 %	150388639
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573	NC_009633	AAAGA	2	10	845112	845121	80 %	0 %	20 %	0 %	150388641
574	NC_009633	GAAGA	2	10	845931	845940	60 %	0 %	40 %	0 %	150388643
575	NC_009633	AGGTT	2	10	848666	848675	20 %	40 %	40 %	0 %	150388645
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579	NC_009633	TGAAG	2	10	861967	861976	40 %	20 %	40 %	0 %	150388658
580	NC_009633	ATGGA	2	10	862083	862092	40 %	20 %	40 %	0 %	150388658
581	NC_009633	TTTTC	2	10	862455	862464	0 %	80 %	0 %	20 %	150388658
582	NC_009633	TATTT	2	10	863444	863453	20 %	80 %	0 %	0 %	150388659
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585	NC_009633	TAAAA	2	10	866336	866345	80 %	20 %	0 %	0 %	150388662
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593	NC_009633	TTAAT	2	10	881018	881027	40 %	60 %	0 %	0 %	150388679
594	NC_009633	GTTTT	2	10	881224	881233	0 %	80 %	20 %	0 %	150388679
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598	NC_009633	TTCAA	2	10	883496	883505	40 %	40 %	0 %	20 %	150388681
599	NC_009633	AAGAA	2	10	883932	883941	80 %	0 %	20 %	0 %	150388681
600	NC_009633	ATTCT	2	10	888428	888437	20 %	60 %	0 %	20 %	150388682
601	NC_009633	TGATT	2	10	888652	888661	20 %	60 %	20 %	0 %	150388682
602	NC_009633	AAAGA	2	10	895562	895571	80 %	0 %	20 %	0 %	150388687
603	NC_009633	ATTTT	2	10	895578	895587	20 %	80 %	0 %	0 %	150388687
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610	NC_009633	TATCT	2	10	910470	910479	20 %	60 %	0 %	20 %	150388705
611	NC_009633	TAGCG	2	10	910704	910713	20 %	20 %	40 %	20 %	150388705
612	NC_009633	GTACA	2	10	913841	913850	40 %	20 %	20 %	20 %	150388707
613	NC_009633	AAGAC	2	10	917622	917631	60 %	0 %	20 %	20 %	150388710
614	NC_009633	AAACA	2	10	917675	917684	80 %	0 %	0 %	20 %	150388710
615	NC_009633	ACTAT	2	10	919428	919437	40 %	40 %	0 %	20 %	150388712
616	NC_009633	TAAAA	2	10	921368	921377	80 %	20 %	0 %	0 %	150388717
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618	NC_009633	TACTT	2	10	924921	924930	20 %	60 %	0 %	20 %	150388721
619	NC_009633	AGCAA	2	10	927215	927224	60 %	0 %	20 %	20 %	150388723
620	NC_009633	TGGTG	2	10	930573	930582	0 %	40 %	60 %	0 %	150388726
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622	NC_009633	GTACT	2	10	932603	932612	20 %	40 %	20 %	20 %	150388728
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624	NC_009633	TGGTT	2	10	934401	934410	0 %	60 %	40 %	0 %	150388730
625	NC_009633	GTACT	2	10	934874	934883	20 %	40 %	20 %	20 %	150388730
626	NC_009633	AATGG	2	10	936676	936685	40 %	20 %	40 %	0 %	150388731
627	NC_009633	AGGTA	2	10	936762	936771	40 %	20 %	40 %	0 %	150388732
628	NC_009633	AGGAA	2	10	936940	936949	60 %	0 %	40 %	0 %	150388732
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