MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 46008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015942	ATG	2	6	357587	357592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198566
5502	NC_015942	CCA	2	6	357745	357750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198566
5503	NC_015942	CGG	2	6	358037	358042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198566
5504	NC_015942	CCA	2	6	358078	358083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198566
5505	NC_015942	GCC	2	6	358129	358134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198566
5506	NC_015942	TCA	2	6	358147	358152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198566
5507	NC_015942	ATG	2	6	358239	358244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198566
5508	NC_015942	TGA	2	6	358267	358272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198566
5509	NC_015942	CAG	2	6	358289	358294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198566
5510	NC_015942	CGC	2	6	358366	358371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198566
5511	NC_015942	TTG	2	6	358440	358445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198566
5512	NC_015942	TCC	2	6	358547	358552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198566
5513	NC_015942	GCG	2	6	358604	358609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198566
5514	NC_015942	CAG	2	6	358610	358615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198566
5515	NC_015942	GCC	3	9	358648	358656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198566
5516	NC_015942	TGG	2	6	358768	358773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198566
5517	NC_015942	TGG	2	6	358794	358799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198566
5518	NC_015942	GAA	2	6	358867	358872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198566
5519	NC_015942	ATC	2	6	358875	358880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198566
5520	NC_015942	TGG	2	6	358960	358965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198566
5521	NC_015942	CGA	2	6	359032	359037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198566
5522	NC_015942	TGG	2	6	359077	359082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198566
5523	NC_015942	GTT	2	6	359084	359089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198566
5524	NC_015942	TTG	2	6	359154	359159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198566
5525	NC_015942	CGC	2	6	359281	359286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198566
5526	NC_015942	GAA	2	6	359357	359362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198566
5527	NC_015942	CCA	2	6	359374	359379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198566
5528	NC_015942	CCG	2	6	359443	359448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198566
5529	NC_015942	TTG	2	6	359496	359501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198566
5530	NC_015942	ACA	2	6	359626	359631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198566
5531	NC_015942	CGT	2	6	359762	359767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198566
5532	NC_015942	ATG	2	6	359790	359795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198566
5533	NC_015942	TCC	2	6	359801	359806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5534	NC_015942	GCC	2	6	359877	359882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5535	NC_015942	GGA	2	6	359900	359905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198567
5536	NC_015942	TGC	3	9	359916	359924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198567
5537	NC_015942	CCA	2	6	359975	359980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198567
5538	NC_015942	GGT	2	6	360099	360104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198567
5539	NC_015942	GCG	2	6	360130	360135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198567
5540	NC_015942	ACG	2	6	360144	360149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198567
5541	NC_015942	CCA	2	6	360193	360198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198567
5542	NC_015942	CAC	2	6	360227	360232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_015942	CCT	2	6	360248	360253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_015942	TCA	2	6	360296	360301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198568
5545	NC_015942	CGC	2	6	360312	360317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198568
5546	NC_015942	GGC	2	6	360346	360351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198568
5547	NC_015942	CAG	2	6	360457	360462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198568
5548	NC_015942	CAT	2	6	360496	360501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198568
5549	NC_015942	ACC	2	6	360514	360519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198568
5550	NC_015942	CAT	2	6	360520	360525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198568
5551	NC_015942	CCA	3	9	360609	360617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198568
5552	NC_015942	TGG	2	6	360630	360635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198568
5553	NC_015942	TTC	2	6	360651	360656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198568
5554	NC_015942	TCA	2	6	360678	360683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198568
5555	NC_015942	CCG	2	6	360693	360698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_015942	TGC	2	6	360744	360749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_015942	GCC	2	6	360962	360967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_015942	AAG	2	6	360974	360979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_015942	GAG	2	6	360983	360988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_015942	CGC	2	6	361009	361014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_015942	CGC	2	6	361030	361035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_015942	TCG	2	6	361066	361071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_015942	CGC	2	6	361133	361138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_015942	CGA	2	6	361139	361144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_015942	TGC	2	6	361198	361203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_015942	ATG	2	6	361222	361227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_015942	AGG	2	6	361228	361233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_015942	GAG	2	6	361365	361370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_015942	GAA	2	6	361384	361389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198569
5570	NC_015942	GGC	2	6	361407	361412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198569
5571	NC_015942	TGT	2	6	361617	361622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198569
5572	NC_015942	GCA	2	6	361735	361740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198570
5573	NC_015942	GGC	2	6	361773	361778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198570
5574	NC_015942	CCG	2	6	361839	361844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198570
5575	NC_015942	TGC	2	6	362079	362084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_015942	AGT	2	6	362125	362130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_015942	CAT	2	6	362222	362227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198571
5578	NC_015942	CAG	2	6	362277	362282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198571
5579	NC_015942	ACA	2	6	362401	362406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198571
5580	NC_015942	CTG	2	6	362449	362454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198571
5581	NC_015942	CCT	2	6	362726	362731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198571
5582	NC_015942	GAA	2	6	362842	362847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_015942	CAG	2	6	362898	362903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_015942	TCG	2	6	362935	362940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_015942	ATG	2	6	362944	362949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_015942	GTA	2	6	363111	363116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198572
5587	NC_015942	CGT	2	6	363220	363225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198572
5588	NC_015942	CGA	2	6	363293	363298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198572
5589	NC_015942	TGA	2	6	363314	363319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198572
5590	NC_015942	CGC	2	6	363375	363380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_015942	AAG	2	6	363405	363410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_015942	ACT	2	6	363431	363436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198573
5593	NC_015942	TGG	2	6	363492	363497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198573
5594	NC_015942	CTT	2	6	363705	363710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198573
5595	NC_015942	ACT	2	6	363727	363732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198573
5596	NC_015942	GAG	2	6	363741	363746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198573
5597	NC_015942	GGC	2	6	363877	363882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198573
5598	NC_015942	AAT	2	6	363958	363963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_015942	TTG	2	6	363966	363971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_015942	AAG	2	6	363973	363978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_015942	TCA	2	6	364086	364091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198574
5602	NC_015942	CGT	2	6	364097	364102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198574
5603	NC_015942	ATC	2	6	364111	364116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198574
5604	NC_015942	TCC	2	6	364159	364164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198574
5605	NC_015942	AAT	2	6	364171	364176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198574
5606	NC_015942	ATT	2	6	364569	364574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_015942	ATT	2	6	364599	364604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_015942	GCA	2	6	364687	364692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_015942	ACC	2	6	364794	364799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198575
5610	NC_015942	TAT	2	6	364835	364840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198575
5611	NC_015942	AAG	2	6	364882	364887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198575
5612	NC_015942	AGC	2	6	364953	364958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198575
5613	NC_015942	CCG	2	6	364965	364970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198575
5614	NC_015942	TGG	2	6	365066	365071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198575
5615	NC_015942	TCA	2	6	365109	365114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198575
5616	NC_015942	TTA	2	6	365162	365167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198576
5617	NC_015942	ACC	2	6	365223	365228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198576
5618	NC_015942	CCG	2	6	365242	365247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198576
5619	NC_015942	TGA	2	6	365296	365301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198576
5620	NC_015942	TGG	2	6	365415	365420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_015942	ACA	2	6	365440	365445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_015942	TGC	2	6	365518	365523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_015942	GCA	2	6	365543	365548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5652	NC_015942	CAT	2	6	367898	367903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5654	NC_015942	GGC	2	6	368282	368287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198580
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