MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 46228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013205	GTG	2	6	91029	91034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510091
1502	NC_013205	CGG	2	6	91049	91054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510091
1503	NC_013205	CGG	2	6	91146	91151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510091
1504	NC_013205	CAA	2	6	91169	91174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510091
1505	NC_013205	GTG	2	6	91320	91325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510091
1506	NC_013205	GGC	2	6	91349	91354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510091
1507	NC_013205	CAT	2	6	91505	91510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510091
1508	NC_013205	GCC	2	6	91540	91545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510091
1509	NC_013205	CGC	2	6	91552	91557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510091
1510	NC_013205	TCG	2	6	91576	91581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510091
1511	NC_013205	AGG	2	6	91594	91599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510091
1512	NC_013205	TGC	2	6	91624	91629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510091
1513	NC_013205	TGG	2	6	91660	91665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510091
1514	NC_013205	CGC	2	6	91739	91744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510091
1515	NC_013205	GGC	2	6	91835	91840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510091
1516	NC_013205	GCG	2	6	91846	91851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510091
1517	NC_013205	GGC	2	6	91896	91901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_013205	GTG	2	6	92063	92068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510092
1519	NC_013205	GAC	2	6	92078	92083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510092
1520	NC_013205	CCG	2	6	92147	92152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510092
1521	NC_013205	CGC	2	6	92169	92174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510092
1522	NC_013205	GTC	2	6	92290	92295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510092
1523	NC_013205	CGA	2	6	92325	92330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510092
1524	NC_013205	CGA	2	6	92374	92379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510092
1525	NC_013205	GGA	2	6	92446	92451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510092
1526	NC_013205	GGC	2	6	92472	92477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510092
1527	NC_013205	GCC	2	6	92492	92497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510092
1528	NC_013205	CGT	2	6	92511	92516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510092
1529	NC_013205	CTC	3	9	92521	92529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510092
1530	NC_013205	CAT	2	6	92533	92538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510092
1531	NC_013205	CCG	2	6	92678	92683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510092
1532	NC_013205	GCC	2	6	92713	92718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510092
1533	NC_013205	CCA	3	9	92772	92780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510092
1534	NC_013205	TCG	2	6	92802	92807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510092
1535	NC_013205	CGC	2	6	92922	92927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510092
1536	NC_013205	TCG	2	6	92963	92968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510092
1537	NC_013205	CGC	2	6	93079	93084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510092
1538	NC_013205	CGC	2	6	93127	93132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510092
1539	NC_013205	GCG	2	6	93221	93226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510092
1540	NC_013205	GCG	2	6	93327	93332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510093
1541	NC_013205	TGG	2	6	93351	93356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510093
1542	NC_013205	GAT	2	6	93385	93390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510093
1543	NC_013205	GGT	2	6	93462	93467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510093
1544	NC_013205	GCG	2	6	93610	93615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510093
1545	NC_013205	GCG	2	6	93629	93634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510093
1546	NC_013205	AGG	2	6	93642	93647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510093
1547	NC_013205	CGG	2	6	93698	93703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510093
1548	NC_013205	TCG	2	6	93782	93787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510093
1549	NC_013205	CGG	2	6	93870	93875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510093
1550	NC_013205	GTC	2	6	93893	93898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510093
1551	NC_013205	ACG	2	6	93926	93931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510093
1552	NC_013205	CCG	2	6	93932	93937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510093
1553	NC_013205	CCG	2	6	93984	93989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510093
1554	NC_013205	CGG	2	6	94026	94031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510093
1555	NC_013205	CGC	2	6	94035	94040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510093
1556	NC_013205	GTC	2	6	94060	94065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510093
1557	NC_013205	CCT	2	6	94097	94102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_013205	CGG	2	6	94138	94143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510094
1559	NC_013205	TCG	2	6	94185	94190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510094
1560	NC_013205	GCA	2	6	94222	94227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510094
1561	NC_013205	CTC	2	6	94274	94279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510094
1562	NC_013205	CCA	2	6	94406	94411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510094
1563	NC_013205	CGG	2	6	94484	94489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510094
1564	NC_013205	TGA	2	6	94609	94614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510094
1565	NC_013205	AGT	2	6	94636	94641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510094
1566	NC_013205	GCC	3	9	94760	94768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510094
1567	NC_013205	CCA	2	6	94793	94798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510094
1568	NC_013205	CGA	2	6	94801	94806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510094
1569	NC_013205	CTT	2	6	94853	94858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510094
1570	NC_013205	CCG	2	6	94864	94869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510094
1571	NC_013205	TTG	2	6	94926	94931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510094
1572	NC_013205	TAG	2	6	94932	94937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510094
1573	NC_013205	GTA	2	6	94970	94975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510094
1574	NC_013205	CGC	2	6	95081	95086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510094
1575	NC_013205	TGG	2	6	95122	95127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510094
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1577	NC_013205	CTG	2	6	95162	95167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510094
1578	NC_013205	CGC	3	9	95173	95181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510094
1579	NC_013205	CTG	2	6	95252	95257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510094
1580	NC_013205	CGT	2	6	95273	95278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510094
1581	NC_013205	CGC	2	6	95345	95350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510094
1582	NC_013205	CCG	3	9	95355	95363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510094
1583	NC_013205	GCG	2	6	95367	95372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510094
1584	NC_013205	GAC	2	6	95555	95560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510095
1585	NC_013205	CAC	2	6	95654	95659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510095
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1587	NC_013205	TGG	2	6	95677	95682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510095
1588	NC_013205	TGT	2	6	95704	95709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510095
1589	NC_013205	AGC	2	6	95727	95732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510095
1590	NC_013205	TTG	2	6	95754	95759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510095
1591	NC_013205	CCA	2	6	95786	95791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510095
1592	NC_013205	CGA	2	6	95821	95826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510095
1593	NC_013205	TGA	2	6	95917	95922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510095
1594	NC_013205	CCG	2	6	95929	95934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510095
1595	NC_013205	CAT	2	6	95978	95983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510095
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1598	NC_013205	GCG	3	9	96144	96152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510095
1599	NC_013205	CAG	2	6	96194	96199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510095
1600	NC_013205	TCG	2	6	96205	96210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510095
1601	NC_013205	ATC	2	6	96228	96233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510095
1602	NC_013205	CAA	2	6	96272	96277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510095
1603	NC_013205	TCC	2	6	96320	96325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510096
1604	NC_013205	ACC	2	6	96326	96331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510096
1605	NC_013205	CGG	2	6	96335	96340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510096
1606	NC_013205	CGC	2	6	96397	96402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510096
1607	NC_013205	GTG	2	6	96461	96466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510096
1608	NC_013205	GAC	2	6	96541	96546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510096
1609	NC_013205	GAA	2	6	96550	96555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510096
1610	NC_013205	GAT	2	6	96673	96678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510096
1611	NC_013205	CGG	2	6	96873	96878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510096
1612	NC_013205	AAC	2	6	96884	96889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510096
1613	NC_013205	CAT	2	6	96955	96960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510096
1614	NC_013205	CGC	2	6	96988	96993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510096
1615	NC_013205	CAT	2	6	97150	97155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510096
1616	NC_013205	TGC	2	6	97182	97187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510096
1617	NC_013205	CGG	2	6	97233	97238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510096
1618	NC_013205	CCT	2	6	97255	97260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1619	NC_013205	GAG	2	6	97389	97394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_013205	ACG	2	6	97436	97441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510097
1621	NC_013205	TCG	2	6	97472	97477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510097
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1623	NC_013205	ACG	2	6	97589	97594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510097
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1980	NC_013205	GCC	2	6	119357	119362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1981	NC_013205	ACC	2	6	119387	119392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1982	NC_013205	CAT	2	6	119398	119403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1983	NC_013205	CCA	2	6	119517	119522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510119
1984	NC_013205	ATG	2	6	119582	119587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510119
1985	NC_013205	CCT	2	6	119593	119598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1986	NC_013205	AGT	2	6	119760	119765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510120
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1988	NC_013205	CGC	2	6	120033	120038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510120
1989	NC_013205	CCG	2	6	120039	120044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510120
1990	NC_013205	CCA	2	6	120078	120083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510120
1991	NC_013205	AGC	2	6	120152	120157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510120
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1993	NC_013205	CCG	2	6	120398	120403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510120
1994	NC_013205	CCG	2	6	120414	120419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510120
1995	NC_013205	AGA	2	6	120465	120470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510120
1996	NC_013205	ATC	2	6	120599	120604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510120
1997	NC_013205	CGA	2	6	120666	120671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510120
1998	NC_013205	GTA	2	6	120715	120720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510120
1999	NC_013205	GCC	2	6	120757	120762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510120
2000	NC_013205	TCT	2	6	120846	120851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510120

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