MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 46228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013205	CGA	2	6	379152	379157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510341
6002	NC_013205	TCG	2	6	379160	379165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510341
6003	NC_013205	GGA	2	6	379242	379247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510341
6004	NC_013205	GGC	2	6	379323	379328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510341
6005	NC_013205	GCC	2	6	379363	379368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510341
6006	NC_013205	TGA	2	6	379391	379396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510341
6007	NC_013205	TTC	2	6	379488	379493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_013205	CCG	2	6	379520	379525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_013205	AAC	2	6	379533	379538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_013205	GTT	2	6	379564	379569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_013205	GAT	2	6	379630	379635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_013205	GAC	2	6	379727	379732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_013205	CGT	2	6	379752	379757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_013205	GCG	2	6	379864	379869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_013205	AAG	2	6	379870	379875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_013205	GGT	2	6	380031	380036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510342
6017	NC_013205	CGC	2	6	380037	380042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510342
6018	NC_013205	GCC	2	6	380047	380052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510342
6019	NC_013205	GTC	2	6	380439	380444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510342
6020	NC_013205	ATC	2	6	380476	380481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510342
6021	NC_013205	TCT	2	6	380501	380506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510342
6022	NC_013205	CGC	2	6	380574	380579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510342
6023	NC_013205	TTC	2	6	380771	380776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510342
6024	NC_013205	ACG	2	6	380794	380799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510342
6025	NC_013205	TGC	2	6	380891	380896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510342
6026	NC_013205	CGT	2	6	380919	380924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510342
6027	NC_013205	ACC	2	6	380956	380961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510342
6028	NC_013205	CGG	2	6	380973	380978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510342
6029	NC_013205	CCG	2	6	381038	381043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510342
6030	NC_013205	GCA	2	6	381057	381062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510342
6031	NC_013205	CGA	2	6	381069	381074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510342
6032	NC_013205	TCG	2	6	381107	381112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510342
6033	NC_013205	GAG	2	6	381127	381132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510342
6034	NC_013205	CGC	2	6	381189	381194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510342
6035	NC_013205	CAT	2	6	381199	381204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510342
6036	NC_013205	CCG	2	6	381272	381277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510342
6037	NC_013205	TCG	2	6	381296	381301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510342
6038	NC_013205	TAC	2	6	381481	381486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510342
6039	NC_013205	TCA	2	6	381840	381845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510343
6040	NC_013205	GAG	2	6	381897	381902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510343
6041	NC_013205	GGT	2	6	381904	381909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510343
6042	NC_013205	CGC	2	6	381957	381962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510343
6043	NC_013205	TCG	2	6	381971	381976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510343
6044	NC_013205	TCC	2	6	381987	381992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510343
6045	NC_013205	CGC	2	6	382126	382131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510343
6046	NC_013205	GTG	2	6	382217	382222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510343
6047	NC_013205	CGT	2	6	382266	382271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510343
6048	NC_013205	GGC	2	6	382515	382520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510343
6049	NC_013205	CCG	2	6	382529	382534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510343
6050	NC_013205	GGC	2	6	382606	382611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510343
6051	NC_013205	CCA	2	6	382713	382718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510343
6052	NC_013205	CGG	2	6	382729	382734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510343
6053	NC_013205	TCA	3	9	382851	382859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510343
6054	NC_013205	GAT	2	6	382870	382875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510343
6055	NC_013205	GCA	2	6	383014	383019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510343
6056	NC_013205	GAC	2	6	383094	383099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510344
6057	NC_013205	CGT	2	6	383147	383152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510344
6058	NC_013205	GGC	2	6	383169	383174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510344
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6060	NC_013205	TGA	2	6	383423	383428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510344
6061	NC_013205	CGC	2	6	383621	383626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510344
6062	NC_013205	GCC	2	6	383677	383682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510344
6063	NC_013205	GTC	2	6	383701	383706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510344
6064	NC_013205	GGT	2	6	383721	383726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510344
6065	NC_013205	GAC	2	6	383754	383759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510344
6066	NC_013205	TGA	2	6	383780	383785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510344
6067	NC_013205	GTG	2	6	383854	383859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510344
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6071	NC_013205	CGA	2	6	384447	384452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510344
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6074	NC_013205	GCA	2	6	384726	384731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510344
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6082	NC_013205	CGG	2	6	385184	385189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510344
6083	NC_013205	ACC	2	6	385198	385203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510344
6084	NC_013205	GCG	2	6	385256	385261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510344
6085	NC_013205	GGT	2	6	385266	385271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510344
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6087	NC_013205	GCG	2	6	385295	385300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510344
6088	NC_013205	CTG	2	6	385363	385368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510344
6089	NC_013205	GAG	2	6	385418	385423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510344
6090	NC_013205	GCC	2	6	385431	385436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6091	NC_013205	CGC	2	6	385480	385485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510345
6092	NC_013205	ACG	2	6	385516	385521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510345
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6096	NC_013205	TGG	2	6	385741	385746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510345
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6101	NC_013205	TTG	2	6	386013	386018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510345
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6103	NC_013205	TGC	2	6	386067	386072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510345
6104	NC_013205	TCG	2	6	386097	386102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510345
6105	NC_013205	ACG	2	6	386115	386120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510345
6106	NC_013205	CCT	2	6	386128	386133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510345
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6109	NC_013205	CGC	2	6	386215	386220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510345
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6111	NC_013205	TGG	2	6	386277	386282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510345
6112	NC_013205	TGC	2	6	386289	386294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510345
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6114	NC_013205	CTC	2	6	386365	386370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_013205	CAT	2	6	386379	386384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_013205	GCC	2	6	386424	386429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_013205	GTT	2	6	386440	386445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6119	NC_013205	GCC	2	6	386689	386694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510346
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6238	NC_013205	TCG	2	6	394837	394842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510353
6239	NC_013205	CGA	2	6	394847	394852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510353
6240	NC_013205	CGT	2	6	394931	394936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510353
6241	NC_013205	TGG	2	6	395008	395013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510353
6242	NC_013205	CGA	2	6	395126	395131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510353
6243	NC_013205	TGA	2	6	395140	395145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510353
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6246	NC_013205	TTC	3	9	395409	395417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510353
6247	NC_013205	ACG	2	6	395449	395454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510353
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6271	NC_013205	CAT	2	6	397029	397034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510355
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6273	NC_013205	ATG	2	6	397333	397338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510355
6274	NC_013205	GTG	2	6	397354	397359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510355
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6278	NC_013205	GTG	2	6	397595	397600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510356
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6302	NC_013205	CAG	2	6	399401	399406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6325	NC_013205	CTG	2	6	400742	400747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
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6344	NC_013205	TCG	2	6	401980	401985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
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6353	NC_013205	CCA	2	6	402436	402441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510357
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6475	NC_013205	TGG	2	6	409298	409303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6476	NC_013205	GTG	2	6	409320	409325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510363
6477	NC_013205	ATC	2	6	409332	409337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510363
6478	NC_013205	CTT	2	6	409346	409351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510363
6479	NC_013205	CGA	2	6	409378	409383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510363
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6481	NC_013205	GGC	2	6	409447	409452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6482	NC_013205	GAC	2	6	409592	409597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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