MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 46228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013205	GAA	2	6	349043	349048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510316
5502	NC_013205	CCG	2	6	349128	349133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510316
5503	NC_013205	GAG	2	6	349209	349214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510316
5504	NC_013205	TGG	2	6	349288	349293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510316
5505	NC_013205	TGA	2	6	349303	349308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510316
5506	NC_013205	CGT	2	6	349321	349326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510316
5507	NC_013205	TGT	2	6	349381	349386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510316
5508	NC_013205	GTG	2	6	349434	349439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510316
5509	NC_013205	TCA	2	6	349462	349467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510316
5510	NC_013205	GCT	2	6	349532	349537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510316
5511	NC_013205	GCG	2	6	349664	349669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510316
5512	NC_013205	GAT	2	6	349785	349790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510316
5513	NC_013205	TGG	2	6	349837	349842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510316
5514	NC_013205	GAC	2	6	349874	349879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510316
5515	NC_013205	GTG	2	6	349893	349898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510316
5516	NC_013205	CAT	2	6	349901	349906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510316
5517	NC_013205	TAA	2	6	350049	350054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_013205	GCG	2	6	350179	350184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510317
5519	NC_013205	GGC	2	6	350231	350236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510317
5520	NC_013205	CGA	2	6	350356	350361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510317
5521	NC_013205	AAC	2	6	350448	350453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510317
5522	NC_013205	CGC	2	6	350518	350523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510317
5523	NC_013205	CTC	2	6	350573	350578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510317
5524	NC_013205	CGG	2	6	350615	350620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510317
5525	NC_013205	CAA	2	6	350801	350806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510318
5526	NC_013205	TCA	2	6	350869	350874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510318
5527	NC_013205	CGG	2	6	350890	350895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510318
5528	NC_013205	ACG	2	6	350970	350975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510318
5529	NC_013205	TAT	2	6	351032	351037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510318
5530	NC_013205	GGC	2	6	351054	351059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510318
5531	NC_013205	GCA	2	6	351098	351103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510318
5532	NC_013205	CAA	2	6	351174	351179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510318
5533	NC_013205	TGT	2	6	351295	351300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510318
5534	NC_013205	GAA	2	6	351350	351355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510318
5535	NC_013205	CGA	2	6	351440	351445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510318
5536	NC_013205	GGT	2	6	351453	351458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510318
5537	NC_013205	GCG	2	6	351794	351799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510319
5538	NC_013205	ATG	2	6	351882	351887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510319
5539	NC_013205	TAT	2	6	352058	352063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510319
5540	NC_013205	AAC	2	6	352100	352105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510319
5541	NC_013205	CGT	2	6	352131	352136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510319
5542	NC_013205	CCG	2	6	352206	352211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510319
5543	NC_013205	ACG	2	6	352214	352219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510319
5544	NC_013205	TCG	2	6	352292	352297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510319
5545	NC_013205	CAT	2	6	352324	352329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510319
5546	NC_013205	TAG	2	6	352454	352459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510320
5547	NC_013205	TTG	2	6	352526	352531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510320
5548	NC_013205	CTC	2	6	352558	352563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510320
5549	NC_013205	CTT	2	6	352691	352696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510320
5550	NC_013205	GAC	2	6	352743	352748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510320
5551	NC_013205	ACT	2	6	352834	352839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510320
5552	NC_013205	CGG	2	6	352847	352852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510320
5553	NC_013205	GCC	2	6	352894	352899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510320
5554	NC_013205	GTG	2	6	352930	352935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510320
5555	NC_013205	CGA	2	6	353054	353059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510320
5556	NC_013205	TTG	2	6	353248	353253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510320
5557	NC_013205	TCA	2	6	353279	353284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510320
5558	NC_013205	CGT	2	6	353316	353321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510320
5559	NC_013205	TGC	2	6	353378	353383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510321
5560	NC_013205	CAC	2	6	353391	353396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510321
5561	NC_013205	CGG	2	6	353657	353662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510321
5562	NC_013205	GCT	2	6	353793	353798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510321
5563	NC_013205	TTG	2	6	353944	353949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510321
5564	NC_013205	CGG	2	6	354038	354043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510321
5565	NC_013205	CTT	2	6	354102	354107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510321
5566	NC_013205	GAT	2	6	354246	354251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510321
5567	NC_013205	CGC	2	6	354462	354467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510322
5568	NC_013205	CGG	2	6	354500	354505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510322
5569	NC_013205	CAG	3	9	354523	354531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510322
5570	NC_013205	CGA	2	6	354566	354571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510322
5571	NC_013205	ACC	2	6	354592	354597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510322
5572	NC_013205	CAG	2	6	354601	354606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510322
5573	NC_013205	CGA	2	6	354671	354676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510322
5574	NC_013205	GGC	2	6	354759	354764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510322
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5576	NC_013205	CGT	2	6	354794	354799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510322
5577	NC_013205	CGG	2	6	354803	354808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510322
5578	NC_013205	TCG	2	6	354872	354877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510322
5579	NC_013205	CGT	2	6	355013	355018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510323
5580	NC_013205	GGT	2	6	355019	355024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510323
5581	NC_013205	GTC	2	6	355094	355099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510323
5582	NC_013205	CAG	2	6	355143	355148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510323
5583	NC_013205	AGG	2	6	355153	355158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510323
5584	NC_013205	TGA	2	6	355174	355179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510323
5585	NC_013205	TCA	2	6	355222	355227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510323
5586	NC_013205	CAA	2	6	355291	355296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510323
5587	NC_013205	CGG	2	6	355399	355404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510323
5588	NC_013205	CTT	2	6	355415	355420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510323
5589	NC_013205	TGA	2	6	355447	355452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510323
5590	NC_013205	CGT	2	6	355490	355495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510323
5591	NC_013205	TAT	2	6	355518	355523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510323
5592	NC_013205	CCG	2	6	355590	355595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_013205	CTG	2	6	355642	355647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510324
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5597	NC_013205	CGG	2	6	355812	355817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510324
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5599	NC_013205	GAC	2	6	355888	355893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510324
5600	NC_013205	CTG	2	6	355933	355938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510324
5601	NC_013205	CGG	2	6	355942	355947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510324
5602	NC_013205	GAT	2	6	355957	355962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510324
5603	NC_013205	GAT	2	6	356161	356166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510324
5604	NC_013205	ATG	2	6	356213	356218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510324
5605	NC_013205	CCG	2	6	356253	356258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510324
5606	NC_013205	CGT	2	6	356263	356268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510324
5607	NC_013205	TCA	2	6	356322	356327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510324
5608	NC_013205	TCC	2	6	356357	356362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510324
5609	NC_013205	TCG	2	6	356364	356369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510324
5610	NC_013205	CTC	2	6	356506	356511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510324
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5612	NC_013205	TCA	2	6	356663	356668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510324
5613	NC_013205	AAG	2	6	356736	356741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_013205	CGG	2	6	356752	356757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_013205	CGC	2	6	356809	356814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5616	NC_013205	GCT	2	6	356928	356933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510325
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