MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 46228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013205	CGC	2	6	154269	154274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510158
2502	NC_013205	CCG	2	6	154277	154282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510158
2503	NC_013205	TCT	2	6	154435	154440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510158
2504	NC_013205	GAG	2	6	154469	154474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510158
2505	NC_013205	GAA	2	6	154562	154567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510158
2506	NC_013205	TGA	2	6	154569	154574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510158
2507	NC_013205	CGC	2	6	154725	154730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510158
2508	NC_013205	GAG	2	6	154814	154819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510158
2509	NC_013205	CGC	2	6	154985	154990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510158
2510	NC_013205	CGG	2	6	155047	155052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510158
2511	NC_013205	CGA	2	6	155098	155103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510158
2512	NC_013205	CTT	2	6	155194	155199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510158
2513	NC_013205	TCG	2	6	155390	155395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510158
2514	NC_013205	TGC	2	6	155442	155447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510158
2515	NC_013205	CGG	2	6	155455	155460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510158
2516	NC_013205	TGG	2	6	155496	155501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510158
2517	NC_013205	GAT	2	6	155527	155532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510158
2518	NC_013205	GCG	2	6	155561	155566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510158
2519	NC_013205	CGC	2	6	155574	155579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510158
2520	NC_013205	CAT	2	6	155764	155769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510158
2521	NC_013205	ACG	2	6	155836	155841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_013205	TCG	2	6	156140	156145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510159
2523	NC_013205	CGA	2	6	156348	156353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510159
2524	NC_013205	CGC	2	6	156409	156414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510159
2525	NC_013205	GCC	2	6	156508	156513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510159
2526	NC_013205	CGT	2	6	156635	156640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510159
2527	NC_013205	CGG	2	6	156642	156647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510159
2528	NC_013205	TCG	2	6	156667	156672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510159
2529	NC_013205	GAG	2	6	156691	156696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510159
2530	NC_013205	ACG	2	6	156731	156736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510159
2531	NC_013205	GTC	2	6	156754	156759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510159
2532	NC_013205	TCA	2	6	156773	156778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510159
2533	NC_013205	CGT	3	9	156819	156827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510159
2534	NC_013205	TCG	2	6	156893	156898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510159
2535	NC_013205	CAT	2	6	156915	156920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510159
2536	NC_013205	GCC	2	6	156929	156934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510159
2537	NC_013205	GAA	2	6	157003	157008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510159
2538	NC_013205	GCG	2	6	157016	157021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510159
2539	NC_013205	GGC	2	6	157143	157148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510159
2540	NC_013205	AAC	2	6	157201	157206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510159
2541	NC_013205	CAT	2	6	157338	157343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510159
2542	NC_013205	CGT	2	6	157365	157370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510159
2543	NC_013205	AGC	2	6	157395	157400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510159
2544	NC_013205	AGG	2	6	157636	157641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_013205	ACC	2	6	157653	157658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510160
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2550	NC_013205	CCG	2	6	157987	157992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510160
2551	NC_013205	AAC	2	6	157995	158000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510160
2552	NC_013205	GGA	2	6	158040	158045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_013205	CCG	2	6	158067	158072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_013205	ATT	2	6	158117	158122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510161
2555	NC_013205	GGC	2	6	158198	158203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510161
2556	NC_013205	CAT	2	6	158223	158228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510161
2557	NC_013205	GGT	2	6	158291	158296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510161
2558	NC_013205	CAT	2	6	158378	158383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510161
2559	NC_013205	CAG	2	6	158439	158444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510161
2560	NC_013205	CCG	2	6	158466	158471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510161
2561	NC_013205	GGA	2	6	158558	158563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510161
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2563	NC_013205	CGC	3	9	158657	158665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510161
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2565	NC_013205	CTG	2	6	158790	158795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510161
2566	NC_013205	CGG	2	6	158857	158862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510161
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2568	NC_013205	CAT	2	6	158889	158894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510161
2569	NC_013205	CGT	2	6	159038	159043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510161
2570	NC_013205	CGA	3	9	159122	159130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510161
2571	NC_013205	GCC	2	6	159143	159148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510161
2572	NC_013205	GGA	2	6	159212	159217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510161
2573	NC_013205	ATC	2	6	159318	159323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510161
2574	NC_013205	CGG	2	6	159326	159331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510161
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2579	NC_013205	GGT	2	6	159533	159538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510161
2580	NC_013205	AAG	2	6	159588	159593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510161
2581	NC_013205	AGG	2	6	159634	159639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2583	NC_013205	GAG	2	6	159671	159676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510162
2584	NC_013205	TCG	2	6	159684	159689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510162
2585	NC_013205	TGA	2	6	159763	159768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510162
2586	NC_013205	GTG	2	6	159770	159775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510162
2587	NC_013205	TCG	2	6	160035	160040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510162
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2589	NC_013205	GGA	2	6	160180	160185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510162
2590	NC_013205	GCT	2	6	160207	160212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510162
2591	NC_013205	CGC	2	6	160213	160218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510162
2592	NC_013205	GCG	2	6	160617	160622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510162
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2597	NC_013205	CGG	2	6	161021	161026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510163
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2602	NC_013205	CGG	2	6	161432	161437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510163
2603	NC_013205	CGG	2	6	161481	161486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510163
2604	NC_013205	GGC	2	6	161568	161573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510163
2605	NC_013205	CGC	2	6	161703	161708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510163
2606	NC_013205	GCG	2	6	161770	161775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510163
2607	NC_013205	TGG	2	6	161864	161869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510163
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2611	NC_013205	CCG	2	6	162057	162062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510164
2612	NC_013205	ATC	2	6	162160	162165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510164
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2975	NC_013205	GAT	2	6	180551	180556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510179
2976	NC_013205	CGC	2	6	180693	180698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510180
2977	NC_013205	GCC	2	6	180706	180711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510180
2978	NC_013205	GGA	2	6	180778	180783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510180
2979	NC_013205	CGG	2	6	180805	180810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510180
2980	NC_013205	CTG	2	6	180887	180892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510180
2981	NC_013205	ATC	2	6	180935	180940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510180
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2998	NC_013205	GCT	2	6	181551	181556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510181
2999	NC_013205	GAC	2	6	181568	181573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510181
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