MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 46228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013205	CAT	2	6	212954	212959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510215
3502	NC_013205	GGC	2	6	212989	212994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_013205	GGC	2	6	213054	213059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_013205	CGG	2	6	213072	213077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_013205	CCT	2	6	213081	213086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510216
3506	NC_013205	CGG	2	6	213175	213180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3507	NC_013205	AGG	2	6	213225	213230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510216
3508	NC_013205	CAC	3	9	213269	213277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510216
3509	NC_013205	CGC	2	6	213301	213306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510216
3510	NC_013205	TCG	2	6	213309	213314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510216
3511	NC_013205	GGC	2	6	213394	213399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3512	NC_013205	GCG	2	6	213450	213455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3513	NC_013205	TCA	2	6	213498	213503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510216
3514	NC_013205	CTC	2	6	213590	213595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510216
3515	NC_013205	GGA	2	6	213652	213657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510216
3516	NC_013205	GGT	2	6	213703	213708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510216
3517	NC_013205	GAG	2	6	213743	213748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510216
3518	NC_013205	TGT	2	6	213771	213776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510216
3519	NC_013205	GGA	2	6	213781	213786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510216
3520	NC_013205	GCG	2	6	213837	213842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3521	NC_013205	GCC	2	6	213870	213875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510216
3522	NC_013205	CGC	2	6	213974	213979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510216
3523	NC_013205	GCC	2	6	213994	213999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510216
3524	NC_013205	CGG	2	6	214020	214025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3525	NC_013205	CGG	3	9	214122	214130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3526	NC_013205	TCG	2	6	214137	214142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510216
3527	NC_013205	CGG	2	6	214169	214174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3528	NC_013205	TGG	2	6	214217	214222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510216
3529	NC_013205	CGA	2	6	214272	214277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510216
3530	NC_013205	CGG	2	6	214297	214302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3531	NC_013205	CCT	2	6	214375	214380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510216
3532	NC_013205	CAT	2	6	214414	214419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510216
3533	NC_013205	GCG	2	6	214443	214448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510216
3534	NC_013205	GCG	2	6	214686	214691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510217
3535	NC_013205	CGA	2	6	214771	214776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510217
3536	NC_013205	GTC	2	6	214778	214783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510217
3537	NC_013205	TCA	2	6	214837	214842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510217
3538	NC_013205	GGA	2	6	214847	214852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510217
3539	NC_013205	GAT	2	6	214895	214900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510217
3540	NC_013205	CGG	2	6	214902	214907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510217
3541	NC_013205	GGC	2	6	214910	214915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510217
3542	NC_013205	ACT	2	6	214978	214983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510217
3543	NC_013205	TCG	2	6	215011	215016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510217
3544	NC_013205	GAG	2	6	215177	215182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_013205	GAA	2	6	215393	215398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510218
3546	NC_013205	ACA	2	6	215431	215436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510218
3547	NC_013205	CTT	2	6	215447	215452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510218
3548	NC_013205	CTC	2	6	215514	215519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510218
3549	NC_013205	GGT	2	6	215525	215530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510218
3550	NC_013205	GCG	2	6	215584	215589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510218
3551	NC_013205	GAG	2	6	215682	215687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510218
3552	NC_013205	GAG	2	6	215700	215705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510218
3553	NC_013205	TGC	2	6	215770	215775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
3554	NC_013205	CTC	2	6	215805	215810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510218
3555	NC_013205	TCG	2	6	215869	215874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
3556	NC_013205	TCG	2	6	215881	215886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
3557	NC_013205	CAT	2	6	215945	215950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510218
3558	NC_013205	CGA	2	6	215957	215962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510218
3559	NC_013205	CGG	3	9	215999	216007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510218
3560	NC_013205	TCG	2	6	216043	216048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
3561	NC_013205	TCA	2	6	216082	216087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510218
3562	NC_013205	CGC	2	6	216089	216094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510218
3563	NC_013205	GTC	2	6	216159	216164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
3564	NC_013205	GAG	2	6	216189	216194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510218
3565	NC_013205	ATC	2	6	216249	216254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510218
3566	NC_013205	GGC	2	6	216308	216313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510218
3567	NC_013205	GCT	2	6	216314	216319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
3568	NC_013205	GCG	2	6	216321	216326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510218
3569	NC_013205	AAG	2	6	216330	216335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510218
3570	NC_013205	CGA	2	6	216362	216367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510218
3571	NC_013205	TGA	2	6	216412	216417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510218
3572	NC_013205	TCG	2	6	216436	216441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510218
3573	NC_013205	GGT	2	6	216464	216469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510218
3574	NC_013205	CGG	2	6	216533	216538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510218
3575	NC_013205	TCA	2	6	216574	216579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510218
3576	NC_013205	AGC	2	6	216583	216588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510218
3577	NC_013205	CGA	2	6	216596	216601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510218
3578	NC_013205	CGG	2	6	216617	216622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510218
3579	NC_013205	GGA	2	6	216632	216637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510218
3580	NC_013205	GAT	2	6	216707	216712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510218
3581	NC_013205	CCT	2	6	216935	216940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510218
3582	NC_013205	GGC	2	6	217045	217050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_013205	GGC	2	6	217074	217079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_013205	CGG	2	6	217084	217089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_013205	GCG	2	6	217105	217110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_013205	TCG	2	6	217124	217129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_013205	CGA	2	6	217262	217267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510219
3588	NC_013205	CGC	2	6	217274	217279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510219
3589	NC_013205	GCC	2	6	217303	217308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510219
3590	NC_013205	GCA	2	6	217396	217401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510219
3591	NC_013205	TTC	2	6	217417	217422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510219
3592	NC_013205	TCC	2	6	217482	217487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510219
3593	NC_013205	GAG	2	6	217503	217508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510219
3594	NC_013205	TGA	2	6	217595	217600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510219
3595	NC_013205	CCA	2	6	217628	217633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510219
3596	NC_013205	TTC	2	6	217848	217853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510219
3597	NC_013205	TCC	2	6	217893	217898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510219
3598	NC_013205	ACG	2	6	217909	217914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510219
3599	NC_013205	TTG	2	6	217927	217932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510219
3600	NC_013205	CGG	2	6	217950	217955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510219
3601	NC_013205	CGA	2	6	218000	218005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510219
3602	NC_013205	GCG	2	6	218008	218013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510219
3603	NC_013205	GGC	2	6	218239	218244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_013205	ATG	3	9	218264	218272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_013205	CGG	2	6	218283	218288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_013205	CTC	2	6	218298	218303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_013205	GCC	3	9	218317	218325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_013205	AGT	2	6	218385	218390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510220
3609	NC_013205	CGC	2	6	218424	218429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510220
3610	NC_013205	GTT	2	6	218490	218495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510220
3611	NC_013205	GCG	2	6	218526	218531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510220
3612	NC_013205	ACG	2	6	218537	218542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510220
3613	NC_013205	TCA	2	6	218601	218606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510220
3614	NC_013205	CGA	2	6	218784	218789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510220
3615	NC_013205	CAC	2	6	219064	219069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510220
3616	NC_013205	TTG	2	6	219083	219088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510220
3617	NC_013205	CGC	2	6	219318	219323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_013205	CCT	2	6	219431	219436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_013205	CGT	2	6	219452	219457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_013205	GCA	2	6	219584	219589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_013205	CTG	2	6	219746	219751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510221
3622	NC_013205	CGC	2	6	219785	219790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510221
3623	NC_013205	GGA	2	6	219838	219843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510221
3624	NC_013205	GTG	2	6	219860	219865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510221
3625	NC_013205	GGT	2	6	219982	219987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510221
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3645	NC_013205	CGC	2	6	220774	220779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3864	NC_013205	TCG	2	6	234836	234841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510232
3865	NC_013205	TGA	2	6	234851	234856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510232
3866	NC_013205	GCG	2	6	234984	234989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510232
3867	NC_013205	CGG	2	6	234995	235000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510232
3868	NC_013205	CTT	2	6	235017	235022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510232
3869	NC_013205	CCT	2	6	235082	235087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510232
3870	NC_013205	CTG	2	6	235102	235107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510232
3871	NC_013205	AAG	2	6	235187	235192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510232
3872	NC_013205	CCG	2	6	235213	235218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3873	NC_013205	TAC	2	6	235227	235232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3874	NC_013205	GGA	2	6	235297	235302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3875	NC_013205	GTG	2	6	235365	235370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510233
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3880	NC_013205	CGT	2	6	235492	235497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510233
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3883	NC_013205	CGA	2	6	235748	235753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510233
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3983	NC_013205	TGG	2	6	243176	243181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510239
3984	NC_013205	TGG	2	6	243194	243199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510239
3985	NC_013205	CGA	2	6	243216	243221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510239
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