MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 46228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013205	CTC	2	6	120946	120951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510120
2002	NC_013205	GAG	2	6	121054	121059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510120
2003	NC_013205	TCT	2	6	121304	121309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510120
2004	NC_013205	GCT	2	6	121374	121379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510120
2005	NC_013205	GCC	2	6	121381	121386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510120
2006	NC_013205	CGG	2	6	121409	121414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510120
2007	NC_013205	GCC	2	6	121433	121438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510120
2008	NC_013205	TCC	2	6	121565	121570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2009	NC_013205	GAG	3	9	121701	121709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_013205	GCT	2	6	121781	121786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510121
2011	NC_013205	CGA	2	6	121811	121816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510121
2012	NC_013205	ACC	2	6	121837	121842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510121
2013	NC_013205	ACG	2	6	121860	121865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510121
2014	NC_013205	TCC	2	6	121924	121929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510121
2015	NC_013205	GGC	2	6	121943	121948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510121
2016	NC_013205	CGG	2	6	122005	122010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510121
2017	NC_013205	ATG	2	6	122033	122038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510121
2018	NC_013205	CGA	2	6	122050	122055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510122
2019	NC_013205	GGA	2	6	122086	122091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510122
2020	NC_013205	GGC	2	6	122092	122097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510122
2021	NC_013205	TCG	2	6	122148	122153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510122
2022	NC_013205	CCG	2	6	122167	122172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510122
2023	NC_013205	GAG	2	6	122219	122224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510122
2024	NC_013205	GGC	2	6	122240	122245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510122
2025	NC_013205	CGT	2	6	122332	122337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510122
2026	NC_013205	CGC	2	6	122415	122420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510122
2027	NC_013205	CTT	2	6	122470	122475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510122
2028	NC_013205	GCG	2	6	122494	122499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510122
2029	NC_013205	AGC	2	6	122745	122750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_013205	TGC	2	6	122832	122837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2031	NC_013205	CGT	2	6	122850	122855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_013205	TCG	2	6	122872	122877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2033	NC_013205	GCG	2	6	122955	122960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510123
2034	NC_013205	GAA	2	6	123095	123100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510123
2035	NC_013205	GTC	2	6	123200	123205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2036	NC_013205	CGT	2	6	123292	123297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2037	NC_013205	GCT	2	6	123322	123327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2038	NC_013205	GAC	2	6	123412	123417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2039	NC_013205	TCC	2	6	123429	123434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510123
2040	NC_013205	AGC	2	6	123444	123449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510123
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2042	NC_013205	TGA	2	6	123495	123500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510123
2043	NC_013205	CTG	2	6	123545	123550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2044	NC_013205	CGA	2	6	123622	123627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2045	NC_013205	ATG	2	6	123701	123706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510123
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2047	NC_013205	TAC	2	6	123839	123844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510123
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2049	NC_013205	ACG	2	6	123974	123979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2050	NC_013205	TCG	3	9	124007	124015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2051	NC_013205	GTC	2	6	124039	124044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510123
2052	NC_013205	GCG	2	6	124081	124086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
2053	NC_013205	CGC	2	6	124226	124231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510124
2054	NC_013205	GCG	2	6	124374	124379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
2055	NC_013205	GCG	2	6	124420	124425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
2056	NC_013205	CCA	2	6	124527	124532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510124
2057	NC_013205	GGC	2	6	124536	124541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
2058	NC_013205	GCG	2	6	124544	124549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
2059	NC_013205	CGA	2	6	124553	124558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510124
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2061	NC_013205	CCG	2	6	124601	124606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510124
2062	NC_013205	ACG	2	6	124615	124620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510124
2063	NC_013205	GAG	2	6	124650	124655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510124
2064	NC_013205	CGG	2	6	124738	124743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_013205	CCT	3	9	124828	124836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2105	NC_013205	AGG	2	6	127589	127594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2117	NC_013205	GAA	2	6	128113	128118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_013205	GCA	2	6	128149	128154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2119	NC_013205	GGT	2	6	128366	128371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510129
2120	NC_013205	TCT	2	6	128450	128455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510129
2121	NC_013205	GGA	2	6	128459	128464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510129
2122	NC_013205	TGC	2	6	128558	128563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510129
2123	NC_013205	TGC	2	6	128588	128593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510129
2124	NC_013205	CAA	2	6	128663	128668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510129
2125	NC_013205	ACC	2	6	128806	128811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510129
2126	NC_013205	AGG	2	6	128835	128840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510129
2127	NC_013205	CTG	2	6	128845	128850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510129
2128	NC_013205	GAC	2	6	129107	129112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510130
2129	NC_013205	TCG	2	6	129172	129177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510130
2130	NC_013205	CGA	2	6	129303	129308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510130
2131	NC_013205	CTC	2	6	129407	129412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510130
2132	NC_013205	ATG	2	6	129510	129515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510130
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2134	NC_013205	ATT	2	6	129637	129642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510130
2135	NC_013205	CAA	2	6	129756	129761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510130
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2140	NC_013205	AAC	2	6	130191	130196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510130
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2142	NC_013205	AAC	2	6	130254	130259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510130
2143	NC_013205	CGA	2	6	130334	130339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510130
2144	NC_013205	CTA	2	6	130376	130381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510130
2145	NC_013205	TCA	2	6	130615	130620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2146	NC_013205	GTG	3	9	130693	130701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2147	NC_013205	TCG	2	6	130708	130713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2148	NC_013205	GAA	2	6	130726	130731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2149	NC_013205	CTA	2	6	130746	130751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2150	NC_013205	AGG	2	6	130773	130778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2151	NC_013205	CTT	2	6	131045	131050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510131
2152	NC_013205	GGC	2	6	131307	131312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510131
2153	NC_013205	TGG	2	6	131467	131472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510131
2154	NC_013205	TGG	2	6	131599	131604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510131
2155	NC_013205	ATC	2	6	131610	131615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510131
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2162	NC_013205	CGT	2	6	131834	131839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510131
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2180	NC_013205	ATC	2	6	133498	133503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510133
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2183	NC_013205	CAT	2	6	133743	133748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510133
2184	NC_013205	TAT	2	6	133895	133900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510133
2185	NC_013205	GTC	2	6	133927	133932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510133
2186	NC_013205	ATG	2	6	134062	134067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2187	NC_013205	GTC	2	6	134118	134123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510134
2188	NC_013205	TGC	2	6	134186	134191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510134
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2190	NC_013205	GCT	2	6	134337	134342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510134
2191	NC_013205	CGT	2	6	134352	134357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510134
2192	NC_013205	CGA	2	6	134457	134462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510134
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2194	NC_013205	TTC	2	6	134563	134568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510135
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2196	NC_013205	TGC	2	6	134597	134602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510135
2197	NC_013205	GCT	3	9	134607	134615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510135
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2226	NC_013205	CAA	2	6	136603	136608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2227	NC_013205	GAG	2	6	136680	136685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510137
2228	NC_013205	CAT	2	6	136718	136723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510137
2229	NC_013205	CGC	2	6	136827	136832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510137
2230	NC_013205	CCT	2	6	136894	136899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2231	NC_013205	GCG	2	6	136957	136962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2232	NC_013205	AGG	2	6	137146	137151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510138
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2235	NC_013205	GCG	2	6	137247	137252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510139
2236	NC_013205	GGA	2	6	137405	137410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510139
2237	NC_013205	GGC	2	6	137654	137659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510139
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2479	NC_013205	GAA	2	6	152230	152235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510154
2480	NC_013205	AGG	2	6	152334	152339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2481	NC_013205	TGA	2	6	152454	152459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510155
2482	NC_013205	GTG	2	6	152465	152470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510155
2483	NC_013205	CAG	3	9	152564	152572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510155
2484	NC_013205	TGA	2	6	152589	152594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510155
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2490	NC_013205	CTT	2	6	153150	153155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510156
2491	NC_013205	ATC	2	6	153192	153197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510156
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2498	NC_013205	ATC	2	6	154198	154203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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