MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 46228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_013205	GAA	2	6	63313	63318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510070
1003	NC_013205	GGC	2	6	63334	63339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510070
1004	NC_013205	GAG	2	6	63415	63420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510070
1005	NC_013205	CGC	2	6	63421	63426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510070
1006	NC_013205	CGA	2	6	63433	63438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510070
1007	NC_013205	CCG	2	6	63465	63470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510070
1008	NC_013205	CGC	2	6	63526	63531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510070
1009	NC_013205	CCA	2	6	63540	63545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510070
1010	NC_013205	GAA	2	6	63553	63558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510070
1011	NC_013205	TCA	2	6	63570	63575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510070
1012	NC_013205	GTT	2	6	63586	63591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510070
1013	NC_013205	ATG	2	6	63647	63652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510070
1014	NC_013205	GTT	2	6	63658	63663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510070
1015	NC_013205	GCG	2	6	63746	63751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510070
1016	NC_013205	AGC	2	6	63752	63757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510070
1017	NC_013205	GCC	2	6	63784	63789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510070
1018	NC_013205	CGG	2	6	63843	63848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510070
1019	NC_013205	CCA	2	6	63858	63863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510070
1020	NC_013205	GCG	2	6	63894	63899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510070
1021	NC_013205	GAT	2	6	63949	63954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510070
1022	NC_013205	AAC	2	6	64034	64039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510070
1023	NC_013205	CAC	2	6	64099	64104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510070
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1029	NC_013205	CGC	2	6	64494	64499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510070
1030	NC_013205	ATG	2	6	64523	64528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510070
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1034	NC_013205	GAT	2	6	64771	64776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510070
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1039	NC_013205	ATA	2	6	65268	65273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258510071
1040	NC_013205	GCG	2	6	65285	65290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510071
1041	NC_013205	CCT	2	6	65352	65357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_013205	TCT	2	6	65360	65365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_013205	TCA	2	6	65439	65444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_013205	GCC	2	6	65479	65484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_013205	CGG	2	6	65493	65498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_013205	GCC	2	6	65551	65556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_013205	CGG	2	6	65565	65570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_013205	GAG	2	6	65585	65590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_013205	GCC	2	6	65623	65628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1052	NC_013205	GCC	2	6	65696	65701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_013205	CGG	2	6	65710	65715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_013205	GCC	2	6	65768	65773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_013205	CGG	2	6	65782	65787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_013205	CGT	2	6	65803	65808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_013205	GCC	2	6	65841	65846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_013205	CGG	2	6	65855	65860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_013205	GCC	2	6	65913	65918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_013205	CGG	2	6	65927	65932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_013205	GCC	2	6	65988	65993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_013205	CGG	2	6	66002	66007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_013205	CCG	2	6	66019	66024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_013205	GTC	2	6	66046	66051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_013205	GCC	2	6	66063	66068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1092	NC_013205	CGG	2	6	66888	66893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1098	NC_013205	GCC	2	6	67268	67273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_013205	TAA	2	6	67286	67291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1109	NC_013205	CAT	2	6	67942	67947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510072
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1111	NC_013205	TCG	2	6	68015	68020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510072
1112	NC_013205	CGT	2	6	68109	68114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510072
1113	NC_013205	ACG	2	6	68149	68154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510072
1114	NC_013205	GTG	2	6	68221	68226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510072
1115	NC_013205	TCG	2	6	68273	68278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510072
1116	NC_013205	AGG	2	6	68491	68496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510073
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1127	NC_013205	TGG	2	6	68920	68925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510073
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1129	NC_013205	CCG	2	6	69100	69105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1498	NC_013205	GCC	2	6	90894	90899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510091
1499	NC_013205	GCT	2	6	90908	90913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510091
1500	NC_013205	TCG	2	6	91015	91020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510091

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