MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 46228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013205	TGA	2	6	33734	33739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510044
502	NC_013205	GAG	2	6	33798	33803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510044
503	NC_013205	GGC	3	9	33813	33821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510044
504	NC_013205	ATC	2	6	33852	33857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_013205	AGA	2	6	33922	33927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013205	CGC	2	6	33933	33938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_013205	CGG	2	6	33941	33946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_013205	CGT	2	6	34054	34059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510045
509	NC_013205	TGC	2	6	34077	34082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510045
510	NC_013205	GGC	2	6	34093	34098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
511	NC_013205	CGG	2	6	34184	34189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
512	NC_013205	GAT	2	6	34193	34198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510045
513	NC_013205	CGG	2	6	34212	34217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
514	NC_013205	CGG	2	6	34225	34230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
515	NC_013205	GGC	2	6	34349	34354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
516	NC_013205	GTG	2	6	34442	34447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510045
517	NC_013205	ATG	2	6	34448	34453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510045
518	NC_013205	CGG	2	6	34552	34557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
519	NC_013205	GCC	2	6	34577	34582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510045
520	NC_013205	AGA	2	6	34585	34590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510045
521	NC_013205	GCC	2	6	34615	34620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510045
522	NC_013205	GCC	2	6	34711	34716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510045
523	NC_013205	GCC	2	6	34774	34779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510045
524	NC_013205	GCG	2	6	34788	34793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
525	NC_013205	GGT	2	6	34804	34809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510045
526	NC_013205	CAC	2	6	34988	34993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510045
527	NC_013205	GCG	2	6	35089	35094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
528	NC_013205	TCG	2	6	35193	35198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510045
529	NC_013205	CGG	2	6	35321	35326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
530	NC_013205	GAT	2	6	35339	35344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510045
531	NC_013205	GGC	2	6	35353	35358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
532	NC_013205	CGC	2	6	35442	35447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510046
533	NC_013205	GGC	2	6	35484	35489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510046
534	NC_013205	GCG	2	6	35835	35840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510046
535	NC_013205	GCC	2	6	35938	35943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510046
536	NC_013205	TGC	2	6	36023	36028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510046
537	NC_013205	ACC	2	6	36035	36040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510046
538	NC_013205	ACG	2	6	36200	36205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510046
539	NC_013205	TCG	2	6	36300	36305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510046
540	NC_013205	CAT	2	6	36334	36339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510046
541	NC_013205	TGC	2	6	36354	36359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510046
542	NC_013205	CGA	2	6	36432	36437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510046
543	NC_013205	CGG	2	6	36489	36494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510046
544	NC_013205	TGT	2	6	36508	36513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510046
545	NC_013205	CGC	2	6	36567	36572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510046
546	NC_013205	CGC	2	6	36654	36659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510046
547	NC_013205	TCC	2	6	36735	36740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_013205	GAG	2	6	36818	36823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013205	GAG	2	6	36871	36876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013205	CAG	2	6	36997	37002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_013205	CGG	3	9	37203	37211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510047
552	NC_013205	AGC	2	6	37218	37223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510047
553	NC_013205	GGC	2	6	37462	37467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510047
554	NC_013205	GCG	2	6	37540	37545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510047
555	NC_013205	CAA	2	6	37549	37554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510047
556	NC_013205	CGG	2	6	37648	37653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510047
557	NC_013205	GAT	3	9	37681	37689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510047
558	NC_013205	GAA	2	6	37738	37743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510047
559	NC_013205	GGC	2	6	37757	37762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510047
560	NC_013205	GCC	2	6	37805	37810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510047
561	NC_013205	TCA	2	6	37881	37886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510047
562	NC_013205	CGA	2	6	37897	37902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510047
563	NC_013205	TCA	2	6	37917	37922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510047
564	NC_013205	GAA	2	6	38137	38142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510047
565	NC_013205	GAG	2	6	38162	38167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510047
566	NC_013205	ATC	2	6	38177	38182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510047
567	NC_013205	CGT	2	6	38184	38189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510047
568	NC_013205	GCA	3	9	38302	38310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510047
569	NC_013205	CGG	2	6	38319	38324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510047
570	NC_013205	GGT	2	6	38395	38400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510047
571	NC_013205	ACG	2	6	38420	38425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510047
572	NC_013205	GGA	3	9	38443	38451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510047
573	NC_013205	GAT	2	6	38622	38627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013205	GTG	2	6	38674	38679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013205	GCG	2	6	38706	38711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_013205	ATG	2	6	38812	38817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013205	CCG	2	6	38917	38922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_013205	TCG	2	6	38926	38931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_013205	TTA	2	6	38978	38983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013205	CCG	2	6	38991	38996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_013205	TCG	2	6	39000	39005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_013205	CGG	2	6	39037	39042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_013205	CCG	2	6	39062	39067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_013205	TCG	2	6	39071	39076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_013205	TCA	2	6	39122	39127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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587	NC_013205	TCG	2	6	39145	39150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_013205	GGA	2	6	39190	39195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013205	CCG	2	6	39209	39214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_013205	TCG	2	6	39218	39223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_013205	CAT	2	6	39242	39247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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593	NC_013205	TCG	2	6	39293	39298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_013205	AGG	2	6	39327	39332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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596	NC_013205	TCG	2	6	39369	39374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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598	NC_013205	TCG	2	6	39441	39446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_013205	CCG	2	6	39504	39509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_013205	TCG	2	6	39513	39518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_013205	CCG	2	6	39576	39581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_013205	TCG	2	6	39585	39590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_013205	ATG	2	6	39615	39620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_013205	GTC	2	6	39692	39697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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609	NC_013205	GCG	2	6	39754	39759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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611	NC_013205	CGG	2	6	39813	39818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_013205	CCG	2	6	39875	39880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_013205	CGG	2	6	39888	39893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_013205	CCG	2	6	39949	39954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_013205	CGG	2	6	39962	39967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_013205	CCG	2	6	40024	40029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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618	NC_013205	CCG	2	6	40097	40102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_013205	TCG	2	6	40106	40111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_013205	CCG	2	6	40172	40177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_013205	CGG	2	6	40185	40190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_013205	CCG	2	6	40246	40251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_013205	TCG	2	6	40255	40260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013205	GAC	2	6	40280	40285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_013205	CCG	2	6	40319	40324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_013205	TCG	2	6	40328	40333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_013205	CCG	2	6	40391	40396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_013205	TCG	2	6	40400	40405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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630	NC_013205	TCG	2	6	40474	40479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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753	NC_013205	CGG	2	6	47025	47030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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