Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Flammulina velutipes strain 4019-20 mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_021373(TTTATT)3ttttaacttttttattaactcacttaatttatttaaataaattat(TTTA)3c23931375Design Primer
2NC_021373(ATA)7p373175121Design Primer
3NC_021373(AATT)3p41700171112Design Primer
4NC_021373(TTAA)3attaat(TTAAA)3c3157318933Design Primer
5NC_021373(TTTTAA)3p63643366018Design Primer
6NC_021373(TAA)4p35133514412Design Primer
7NC_021373(TTC)11p36202623433Design Primer
8NC_021373(A)11p17155716511Design Primer
9NC_021373(A)10p19688969710Design Primer
10NC_021373(ATTT)3p4108571086812Design Primer
11NC_021373(ATT)4p3123591237012Design Primer
12NC_021373(T)10p1127221273110Design Primer
13NC_021373(A)10p1131161312510Design Primer
14NC_021373(T)11p1133661337611Design Primer
15NC_021373(T)10p1135531356210Design Primer
16NC_021373(AATTT)3p5136691368315Design Primer
17NC_021373(TAA)4p3143601437112Design Primer
18NC_021373(AACTTT)6p6166261666136Design Primer
19NC_021373(AATT)3aaataatattaaatatactaa(AAT)4c168211686545Design Primer
20NC_021373(A)10p1171371714610Design Primer
21NC_021373(AAT)6p3173601737718Design Primer
22NC_021373(AAGGA)3p5176521766615Design Primer
23NC_021373(AAAAT)3p5192931930715Design Primer
24NC_021373(T)10p1196361964510Design Primer
25NC_021373(AATT)3p4220292204012Design Primer
26NC_021373(TAATAC)6p6225522258736Design Primer
27NC_021373(TTATTC)5p6227532278230Design Primer
28NC_021373(GTTA)3attaatttaattaatttatttaaacaaaaatatctaattggaatttttaaatttaaatttaatcttaaataaacagcctt(TTTAA)5(ATTT)3c2306723195129Design Primer
29NC_021373(TTATT)4p5234712349020Design Primer
30NC_021373(TATAAA)4p6251672519024Design Primer
31NC_021373(A)10p1261182612710Design Primer
32NC_021373(A)10p1262962630510Design Primer
33NC_021373(TAAT)3p4264852649612Design Primer
34NC_021373(T)10ataaagtaatattttaatcttgtataatttttatctataaaatattaaattgtatatagtattaacagtttaaataataatctatg(TTTTAA)3ttaaattttaatttaattttaatcttaattctttatatttataaaaaaagtaaatataaaat(A)10c2699027175186Design Primer
35NC_021373(AAT)4p3277542776512Design Primer
36NC_021373(ATA)4p3280792809012Design Primer
37NC_021373(TAA)4tattaaaaatttaaataaatctaataatatatctaataaaaatatagttataaataatgatatatta(AAT)4c283502844091Design Primer
38NC_021373(ATA)5p3289192893315Design Primer
39NC_021373(ATCTAA)3p6291632918018Design Primer
40NC_021373(A)10ttgaattatttaataaaaaatcaaaaatgtctaattttttaaataataacaatattaaaaattatggctttgggtataattttttaactaatgagt(ATA)4c2930229419118Design Primer
41NC_021373(TAA)4p3297002971112Design Primer
42NC_021373(TAA)4ttataataataatt(ATA)7atttattatattctttaaaatttaaattatttaaattgaataaatttattggttttttaaataatttctttaagaatgttaataaacaaataaatactat(TAA)7c2988330050168Design Primer
43NC_021373(AAT)5aaaattattaatagaatatctaatcctgtttatatgtttaaaaataataatcaaattaataataatttaaatattaacacaat(TAA)5c3032530437113Design Primer
44NC_021373(AAT)6p3309313094818Design Primer
45NC_021373(TAA)5aattaataattttaataatttaactcaa(AAT)6c317823184261Design Primer
46NC_021373(T)10p1325803258910Design Primer
47NC_021373(TAA)5ttaatataata(ATT)4c329043294138Design Primer
48NC_021373(AATTGT)4aa(TTGAAG)3c335283357144Design Primer
49NC_021373(AAATT)3p5339943400815Design Primer
50NC_021373(A)10p1345963460510Design Primer
51NC_021373(TAAT)3tatttactaaaaaaaataataaaataaactaaaaaaat(A)10taaatagtcaattaaaaaaaataaaaagattaaaagaagataataaaaattgtaaaaagcatataaaatataac(A)11c3523235376145Design Primer
52NC_021373(TTAA)3actaatataaattaggtacagttaattc(TTAA)3c356483569952Design Primer
53NC_021373(TTTA)3p4374643747512Design Primer
54NC_021373(TATT)3p4376483765912Design Primer
55NC_021373(TAAA)3p4379883799912Design Primer
56NC_021373(ATAATT)3p6384883850518Design Primer
57NC_021373(T)12attttatattattttatttttatattattataattttattttaat(ATTA)3c386723874069Design Primer
58NC_021373(TTAT)3ttaaa(TATT)3taattctttatataa(ATTT)4c395033956260Design Primer
59NC_021373(A)10gatacctttaag(TGTAAT)3c399634000240Design Primer
60NC_021373(TAAA)3p4403964040712Design Primer
61NC_021373(AATTA)3p5408214083515Design Primer
62NC_021373(TTTTA)3p5418474186115Design Primer
63NC_021373(TTA)4p3428894290012Design Primer
64NC_021373(AAAT)3p4459584596912Design Primer
65NC_021373(A)10p1487524876110Design Primer
66NC_021373(T)10p1490594906810Design Primer
67NC_021373(ATTTTT)5p6499094993830Design Primer
68NC_021373(TTTA)3p4501395015012Design Primer
69NC_021373(TAATCT)6p6507635079836Design Primer
70NC_021373(TTTAAT)3p6518875190418Design Primer
71NC_021373(TTTAT)3p5559955600915Design Primer
72NC_021373(TAAT)3p4561995621012Design Primer
73NC_021373(ATT)4p3566065661712Design Primer
74NC_021373(AAT)4p3581475815812Design Primer
75NC_021373(A)10p1588125882110Design Primer
76NC_021373(TTATTT)3p6602856030218Design Primer
77NC_021373(TTA)5p3606836069715Design Primer
78NC_021373(GATTAA)6p6609416097636Design Primer
79NC_021373(T)10p1615036151210Design Primer
80NC_021373(A)10p1616836169210Design Primer
81NC_021373(TTA)4tttag(TAT)4c654546548229Design Primer
82NC_021373(T)10p1656636567210Design Primer
83NC_021373(ATT)4tgtgactatcgttaaactgttttaagtgtctaacagt(A)12c686356869561Design Primer
84NC_021373(A)11ttctattaaattaaatatacaaaaatcaatgaaaaaaacagaaatac(A)11c694626953069Design Primer
85NC_021373(AATA)3taataaatttaataattaatttaaataatcaaaagaaattatattttttatacaccca(T)10attctaaagtatgtactttttataatattaaaagtatttttttacgtgaatttaattaaatttaaccattttaaagagaaatttttaaattatttaaaa(TAT)4c7072770917191Design Primer
86NC_021373(TTAAT)4p5714637148220Design Primer
87NC_021373(A)11tataataatatactaatataataat(ATA)4c729507299748Design Primer
88NC_021373(T)10aatt(A)10c732237324624Design Primer
89NC_021373(AAT)4p3745317454212Design Primer
90NC_021373(AAT)4p3748707488112Design Primer
91NC_021373(ATTA)3att(TTTTA)3atatta(ATTT)3c755127555948Design Primer
92NC_021373(TAAA)3p4758697588012Design Primer
93NC_021373(ATAA)3p4770067701712Design Primer
94NC_021373(TTA)4attaatttaatttatacatctt(TTA)4c787167876146Design Primer
95NC_021373(T)11p1790377904711Design Primer
96NC_021373(TAA)4p3796827969312Design Primer
97NC_021373(TAT)6p3803748039118Design Primer
98NC_021373(A)10tactataattataaactgattataaaaattatttaattattttattgaaaaacctttatattattatatatttttaaaatatgataaaaatatcc(T)12caaaaaataacaaataaaatataatatcatatcaaaatttattca(ATT)4c8090181074174Design Primer
99NC_021373(TTAA)3p4821638217412Design Primer
100NC_021373(A)10p1838488385710Design Primer
101NC_021373(TTAGTT)3ttaaaattaaatctagtttatttttattactattttatttaagtattatttctagttaaaaaa(TATT)3c847668485893Design Primer
102NC_021373(TTAAA)3p5859098592315Design Primer
103NC_021373(TTTAA)3p5861538616715Design Primer
104NC_021373(T)12p1867178672812Design Primer
105NC_021373(TATT)3p4870148702512Design Primer
106NC_021373(TTAT)3ttaaatcttaaaattaaaaaaaatctcacataaaaaaaaataaaaagtagcaaatt(A)10c872598733678Design Primer
107NC_021373(ATT)4p3874998751012Design Primer
108NC_021373(AATT)3p4881148812512Design Primer
109NC_021373(AATTA)3(ATT)4*c*884158843723Design Primer