MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 48211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021081	CAG	2	6	195	200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021081	AGT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021081	GTT	2	6	227	232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021081	GGT	3	9	241	249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021081	CCA	2	6	312	317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_021081	GCG	2	6	346	351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881634
7	NC_021081	GGC	2	6	358	363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881634
8	NC_021081	CCG	2	6	426	431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881634
9	NC_021081	CGT	2	6	457	462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881634
10	NC_021081	GCT	2	6	478	483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881634
11	NC_021081	TGC	2	6	486	491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881634
12	NC_021081	CTT	2	6	614	619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881635
13	NC_021081	CCA	2	6	743	748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881635
14	NC_021081	CGG	2	6	821	826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881636
15	NC_021081	GTT	2	6	832	837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881636
16	NC_021081	CTG	2	6	841	846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881636
17	NC_021081	CTT	2	6	852	857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881636
18	NC_021081	CCT	2	6	873	878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881636
19	NC_021081	GGC	2	6	913	918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881636
20	NC_021081	CTT	2	6	975	980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881636
21	NC_021081	GCT	2	6	996	1001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881636
22	NC_021081	CCA	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881636
23	NC_021081	GGC	2	6	1375	1380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881636
24	NC_021081	GTA	2	6	1514	1519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881637
25	NC_021081	TCC	2	6	1539	1544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881637
26	NC_021081	TCC	2	6	1584	1589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881637
27	NC_021081	CCA	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881637
28	NC_021081	GCA	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881638
29	NC_021081	GCG	2	6	1792	1797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881638
30	NC_021081	CAC	2	6	1803	1808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881638
31	NC_021081	CAG	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881638
32	NC_021081	GCC	2	6	1989	1994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881638
33	NC_021081	GCG	2	6	2012	2017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881638
34	NC_021081	GTT	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881638
35	NC_021081	CCT	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881639
36	NC_021081	CGG	2	6	2175	2180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881639
37	NC_021081	GTG	2	6	2241	2246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881639
38	NC_021081	CTG	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881639
39	NC_021081	GTT	2	6	2318	2323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881639
40	NC_021081	GTA	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881639
41	NC_021081	TGG	3	9	2458	2466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881639
42	NC_021081	CCG	2	6	2473	2478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881639
43	NC_021081	GCC	2	6	2498	2503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881639
44	NC_021081	TAA	2	6	2521	2526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881639
45	NC_021081	GGT	2	6	2575	2580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881639
46	NC_021081	CTG	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881639
47	NC_021081	TCC	2	6	2814	2819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881639
48	NC_021081	GCC	2	6	2886	2891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881639
49	NC_021081	TCC	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_021081	GTA	2	6	3170	3175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881640
51	NC_021081	GTA	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881640
52	NC_021081	CAC	2	6	3332	3337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881640
53	NC_021081	CAC	2	6	3377	3382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881640
54	NC_021081	GCC	2	6	3434	3439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881640
55	NC_021081	CCT	2	6	3496	3501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881640
56	NC_021081	TCC	2	6	3509	3514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_021081	CAG	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881641
58	NC_021081	CCA	2	6	3592	3597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881641
59	NC_021081	TTG	3	9	3615	3623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881641
60	NC_021081	CGC	2	6	3646	3651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881641
61	NC_021081	CAG	3	9	3659	3667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881641
62	NC_021081	GTG	3	9	3696	3704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881641
63	NC_021081	GTA	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881641
64	NC_021081	CAC	2	6	3860	3865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881641
65	NC_021081	CGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881641
66	NC_021081	CTC	2	6	3940	3945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021081	GCT	2	6	4046	4051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021081	TTG	2	6	4071	4076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021081	GCA	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881642
70	NC_021081	CGT	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881642
71	NC_021081	CGT	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881642
72	NC_021081	GAA	2	6	4434	4439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881642
73	NC_021081	CCA	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881642
74	NC_021081	CAA	2	6	4461	4466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881642
75	NC_021081	GAA	2	6	4539	4544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881642
76	NC_021081	CTG	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881642
77	NC_021081	CGC	2	6	4558	4563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881642
78	NC_021081	CTT	2	6	4583	4588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881642
79	NC_021081	CCA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881642
80	NC_021081	GGC	2	6	4873	4878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881643
81	NC_021081	CTT	2	6	5106	5111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021081	ACA	2	6	5183	5188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021081	CGT	2	6	5196	5201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021081	ACA	2	6	5292	5297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021081	TGC	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881644
86	NC_021081	GGC	2	6	5423	5428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881644
87	NC_021081	GGC	2	6	5500	5505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881644
88	NC_021081	GTT	2	6	5552	5557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881644
89	NC_021081	CAC	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881644
90	NC_021081	CCT	2	6	5586	5591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881645
91	NC_021081	CCA	2	6	5676	5681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881645
92	NC_021081	CCG	2	6	5685	5690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881645
93	NC_021081	GTC	2	6	5701	5706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881645
94	NC_021081	GTG	2	6	5848	5853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881645
95	NC_021081	CCA	2	6	5961	5966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881645
96	NC_021081	TCA	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881645
97	NC_021081	CAG	2	6	6124	6129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881646
98	NC_021081	CAG	2	6	6212	6217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881646
99	NC_021081	GGC	2	6	6287	6292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881646
100	NC_021081	CTT	2	6	6385	6390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881646
101	NC_021081	TCT	2	6	6519	6524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881646
102	NC_021081	GAT	2	6	6549	6554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881646
103	NC_021081	CCG	2	6	6580	6585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881646
104	NC_021081	CCG	2	6	6595	6600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881646
105	NC_021081	GTT	2	6	6616	6621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881646
106	NC_021081	CCT	2	6	6631	6636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881647
107	NC_021081	CCG	2	6	6782	6787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881647
108	NC_021081	CCT	2	6	6963	6968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881648
109	NC_021081	GGC	2	6	7011	7016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881648
110	NC_021081	TGG	2	6	7088	7093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881648
111	NC_021081	GCT	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881648
112	NC_021081	TGG	2	6	7396	7401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021081	ACG	2	6	7528	7533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021081	CCA	2	6	7616	7621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881649
115	NC_021081	GGC	2	6	7737	7742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881649
116	NC_021081	AGC	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881649
117	NC_021081	GGC	2	6	7835	7840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881649
118	NC_021081	GTC	2	6	7900	7905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881650
119	NC_021081	CGG	2	6	7914	7919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881650
120	NC_021081	CAC	2	6	7950	7955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881650
121	NC_021081	GGC	2	6	7975	7980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881650
122	NC_021081	GTG	2	6	8117	8122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881650
123	NC_021081	TTC	2	6	8152	8157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881650
124	NC_021081	CAG	2	6	8206	8211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881650
125	NC_021081	GGC	2	6	8277	8282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021081	CTT	2	6	8385	8390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881651
127	NC_021081	TGC	2	6	8414	8419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881651
128	NC_021081	CTG	2	6	8455	8460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881651
129	NC_021081	CTG	2	6	8635	8640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881651
130	NC_021081	TCT	2	6	8681	8686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881651
131	NC_021081	CGG	2	6	8690	8695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881651
132	NC_021081	CAT	2	6	8742	8747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881651
133	NC_021081	GCC	2	6	8770	8775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881651
134	NC_021081	TGG	2	6	8777	8782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881651
135	NC_021081	GTT	2	6	8947	8952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881652
136	NC_021081	GCC	2	6	8988	8993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881652
137	NC_021081	CGG	2	6	8994	8999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881652
138	NC_021081	GCA	2	6	9012	9017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881652
139	NC_021081	CGG	2	6	9094	9099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881652
140	NC_021081	CAG	2	6	9298	9303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881652
141	NC_021081	GCC	2	6	9339	9344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881652
142	NC_021081	CAC	2	6	9490	9495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881652
143	NC_021081	CAG	2	6	9523	9528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881652
144	NC_021081	TCC	2	6	9626	9631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881652
145	NC_021081	GTC	2	6	9682	9687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881652
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147	NC_021081	CCA	2	6	9792	9797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881652
148	NC_021081	CTC	2	6	9988	9993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881652
149	NC_021081	CAG	2	6	9994	9999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881652
150	NC_021081	CGC	2	6	10000	10005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881652
151	NC_021081	CAG	2	6	10048	10053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881652
152	NC_021081	CGG	2	6	10173	10178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881652
153	NC_021081	GCT	2	6	10365	10370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881652
154	NC_021081	GCG	2	6	10373	10378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881652
155	NC_021081	CCA	3	9	10458	10466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881652
156	NC_021081	CAC	2	6	10516	10521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881652
157	NC_021081	GCG	2	6	10525	10530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881652
158	NC_021081	GGC	2	6	10549	10554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881652
159	NC_021081	CTG	2	6	10555	10560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881652
160	NC_021081	GGC	2	6	10561	10566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881652
161	NC_021081	CAG	2	6	10621	10626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881652
162	NC_021081	CCA	2	6	10716	10721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881652
163	NC_021081	GCC	2	6	10779	10784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881652
164	NC_021081	CCG	2	6	10788	10793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881652
165	NC_021081	CTG	2	6	10882	10887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881652
166	NC_021081	TCG	2	6	10943	10948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881652
167	NC_021081	CGG	2	6	10994	10999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881652
168	NC_021081	CAG	2	6	11098	11103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881652
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171	NC_021081	CAG	2	6	11191	11196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881652
172	NC_021081	GCA	2	6	11205	11210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881652
173	NC_021081	GAC	2	6	11245	11250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881652
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176	NC_021081	GCT	2	6	11559	11564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881653
177	NC_021081	GAA	2	6	11755	11760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881654
178	NC_021081	CGG	2	6	11794	11799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881654
179	NC_021081	GTG	2	6	11800	11805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881654
180	NC_021081	GGC	2	6	11916	11921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881654
181	NC_021081	GTA	2	6	12033	12038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021081	TAC	2	6	12065	12070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_021081	GGC	2	6	12277	12282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881655
184	NC_021081	GGC	2	6	12298	12303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881655
185	NC_021081	GAG	2	6	12335	12340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881655
186	NC_021081	CGC	2	6	12465	12470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881655
187	NC_021081	CTG	2	6	12506	12511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881655
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189	NC_021081	CTG	2	6	12605	12610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881655
190	NC_021081	CCA	2	6	12624	12629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881655
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192	NC_021081	TGG	2	6	12738	12743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881655
193	NC_021081	CGG	2	6	12783	12788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881655
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200	NC_021081	GTT	2	6	13021	13026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881655
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235	NC_021081	AGC	2	6	15003	15008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881658
236	NC_021081	GAT	2	6	15099	15104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
237	NC_021081	AGA	2	6	15128	15133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
238	NC_021081	CAC	2	6	15193	15198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881659
239	NC_021081	GGC	2	6	15216	15221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881659
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241	NC_021081	CCG	2	6	15275	15280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881659
242	NC_021081	CGT	2	6	15309	15314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881659
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244	NC_021081	ACC	2	6	15350	15355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881659
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249	NC_021081	CCA	2	6	15624	15629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881659
250	NC_021081	GCC	2	6	15760	15765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881659
251	NC_021081	GCA	2	6	15795	15800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881659
252	NC_021081	CCA	2	6	15825	15830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881659
253	NC_021081	TGA	2	6	15840	15845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881659
254	NC_021081	TGC	2	6	15867	15872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881659
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256	NC_021081	CCG	2	6	16098	16103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881659
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258	NC_021081	TTG	2	6	16316	16321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881659
259	NC_021081	ATG	2	6	16379	16384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881659
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263	NC_021081	CGT	2	6	16604	16609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881660
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281	NC_021081	CGG	2	6	17812	17817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881662
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287	NC_021081	GCT	2	6	18194	18199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881662
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291	NC_021081	CCT	2	6	18601	18606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881662
292	NC_021081	ACC	2	6	18675	18680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881662
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