MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 48211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021081	ACG	2	6	217424	217429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881868
3502	NC_021081	AAG	2	6	217448	217453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881868
3503	NC_021081	GCC	2	6	217501	217506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881868
3504	NC_021081	CCA	2	6	217617	217622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881868
3505	NC_021081	CCG	2	6	217647	217652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881868
3506	NC_021081	ACC	2	6	217724	217729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881868
3507	NC_021081	CTG	2	6	217873	217878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881868
3508	NC_021081	CTT	2	6	218019	218024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881868
3509	NC_021081	TGG	2	6	218045	218050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881868
3510	NC_021081	CCG	2	6	218259	218264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881868
3511	NC_021081	ACC	2	6	218282	218287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881868
3512	NC_021081	CCG	2	6	218288	218293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881868
3513	NC_021081	GCA	2	6	218300	218305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881868
3514	NC_021081	GGT	2	6	218313	218318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881868
3515	NC_021081	TGG	2	6	218360	218365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881868
3516	NC_021081	GTG	2	6	218386	218391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881868
3517	NC_021081	GCC	2	6	218434	218439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881868
3518	NC_021081	TAG	2	6	218458	218463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881868
3519	NC_021081	ACT	2	6	218586	218591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_021081	CGC	3	9	218601	218609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_021081	ATT	2	6	218653	218658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_021081	ACC	2	6	218680	218685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881869
3523	NC_021081	TGG	2	6	218868	218873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881869
3524	NC_021081	TGG	2	6	218897	218902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881869
3525	NC_021081	TGC	2	6	218909	218914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881869
3526	NC_021081	TGG	2	6	218918	218923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881869
3527	NC_021081	AAG	2	6	218965	218970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881869
3528	NC_021081	GTG	2	6	218998	219003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881869
3529	NC_021081	CAA	2	6	219006	219011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881869
3530	NC_021081	CGA	2	6	219087	219092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881869
3531	NC_021081	ACT	2	6	219257	219262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881869
3532	NC_021081	GGT	2	6	219366	219371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881869
3533	NC_021081	GCC	2	6	219599	219604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881869
3534	NC_021081	GCG	2	6	219695	219700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881869
3535	NC_021081	TGC	2	6	219716	219721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881869
3536	NC_021081	GCG	2	6	219732	219737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881869
3537	NC_021081	TGG	3	9	219821	219829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881869
3538	NC_021081	TGA	2	6	220001	220006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881869
3539	NC_021081	CAC	2	6	220056	220061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881869
3540	NC_021081	GCC	2	6	220249	220254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881869
3541	NC_021081	CCG	2	6	220282	220287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881869
3542	NC_021081	GGA	2	6	220302	220307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881869
3543	NC_021081	CGA	2	6	220329	220334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881869
3544	NC_021081	ACC	2	6	220523	220528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_021081	TGG	2	6	220741	220746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881870
3546	NC_021081	ACG	2	6	220804	220809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881870
3547	NC_021081	CCT	2	6	220822	220827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881870
3548	NC_021081	GCG	2	6	220841	220846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881870
3549	NC_021081	GAT	2	6	220847	220852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881870
3550	NC_021081	CGG	2	6	220866	220871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881870
3551	NC_021081	GCC	2	6	220884	220889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881870
3552	NC_021081	TTC	2	6	220932	220937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881870
3553	NC_021081	TGC	2	6	221017	221022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881870
3554	NC_021081	GCA	2	6	221162	221167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881870
3555	NC_021081	AAG	2	6	221200	221205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881870
3556	NC_021081	GCT	2	6	221213	221218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881870
3557	NC_021081	ACG	2	6	221242	221247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881870
3558	NC_021081	CTG	2	6	221250	221255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881870
3559	NC_021081	GGC	2	6	221552	221557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881871
3560	NC_021081	CTG	3	9	221581	221589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
3561	NC_021081	GCT	2	6	221598	221603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
3562	NC_021081	TGC	2	6	221606	221611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
3563	NC_021081	TGC	2	6	221720	221725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
3564	NC_021081	GCT	2	6	221805	221810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
3565	NC_021081	GGC	2	6	221811	221816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881871
3566	NC_021081	TGG	2	6	221822	221827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881871
3567	NC_021081	TTC	2	6	221866	221871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881871
3568	NC_021081	ACC	2	6	221875	221880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881871
3569	NC_021081	GGC	2	6	221898	221903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881871
3570	NC_021081	CGG	2	6	221934	221939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881871
3571	NC_021081	CAG	2	6	222082	222087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881871
3572	NC_021081	GCC	2	6	222109	222114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881871
3573	NC_021081	TGG	2	6	222188	222193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881871
3574	NC_021081	CTG	2	6	222196	222201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
3575	NC_021081	CTG	2	6	222241	222246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
3576	NC_021081	CGG	2	6	222252	222257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881871
3577	NC_021081	CAC	2	6	222270	222275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881871
3578	NC_021081	CTT	2	6	222306	222311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881871
3579	NC_021081	GCG	3	9	222331	222339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881871
3580	NC_021081	GTT	2	6	222448	222453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881872
3581	NC_021081	TGC	2	6	222489	222494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881872
3582	NC_021081	GCT	2	6	222553	222558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881872
3583	NC_021081	TGC	2	6	222666	222671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881872
3584	NC_021081	TGG	2	6	222744	222749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881872
3585	NC_021081	CGA	2	6	222766	222771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881872
3586	NC_021081	CTG	2	6	222794	222799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881872
3587	NC_021081	CGC	2	6	222858	222863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881872
3588	NC_021081	GCC	2	6	222980	222985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881872
3589	NC_021081	TGG	2	6	223050	223055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881872
3590	NC_021081	GTG	2	6	223133	223138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881872
3591	NC_021081	GCG	2	6	223139	223144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881872
3592	NC_021081	AGG	2	6	223245	223250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_021081	CAG	2	6	223313	223318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881873
3594	NC_021081	ACG	3	9	223443	223451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881873
3595	NC_021081	CAA	2	6	223585	223590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881873
3596	NC_021081	ACT	2	6	223626	223631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881873
3597	NC_021081	GCC	2	6	223760	223765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881873
3598	NC_021081	ACC	2	6	223802	223807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881873
3599	NC_021081	CAA	2	6	223882	223887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881873
3600	NC_021081	CAA	2	6	223927	223932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881873
3601	NC_021081	CGG	3	9	223935	223943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881873
3602	NC_021081	GGC	2	6	223987	223992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881873
3603	NC_021081	TGC	2	6	224085	224090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881873
3604	NC_021081	ACG	2	6	224199	224204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881873
3605	NC_021081	CTG	2	6	224240	224245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881873
3606	NC_021081	GGT	2	6	224293	224298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881873
3607	NC_021081	ACC	2	6	224357	224362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881873
3608	NC_021081	CGG	2	6	224403	224408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881873
3609	NC_021081	GCT	2	6	224409	224414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881873
3610	NC_021081	GGC	2	6	224420	224425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881873
3611	NC_021081	GAG	2	6	224462	224467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881873
3612	NC_021081	CAG	2	6	224489	224494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881873
3613	NC_021081	CGA	2	6	224500	224505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881873
3614	NC_021081	AGC	2	6	224511	224516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881873
3615	NC_021081	GGC	2	6	224745	224750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881874
3616	NC_021081	CTT	2	6	224829	224834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881874
3617	NC_021081	GGC	2	6	224910	224915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881874
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3619	NC_021081	CTG	2	6	224998	225003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881874
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3738	NC_021081	TAC	2	6	232479	232484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3740	NC_021081	GCC	2	6	232567	232572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881880
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3763	NC_021081	TGG	2	6	234784	234789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3768	NC_021081	GGA	2	6	235237	235242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881881
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3865	NC_021081	GCT	2	6	242126	242131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3980	NC_021081	CCG	2	6	251359	251364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881894
3981	NC_021081	TAA	2	6	251408	251413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881894
3982	NC_021081	GCC	2	6	251518	251523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881894
3983	NC_021081	TGC	2	6	251675	251680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881894
3984	NC_021081	ACA	2	6	251746	251751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881894
3985	NC_021081	TGT	2	6	251926	251931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3986	NC_021081	CAG	2	6	251946	251951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881895
3987	NC_021081	CTG	2	6	252003	252008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881895
3988	NC_021081	CAG	2	6	252132	252137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881895
3989	NC_021081	GCC	2	6	252138	252143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881895
3990	NC_021081	GGC	2	6	252293	252298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881895
3991	NC_021081	CAC	2	6	252360	252365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881895
3992	NC_021081	ACC	2	6	252445	252450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881895
3993	NC_021081	AGC	2	6	252487	252492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881895
3994	NC_021081	GTG	2	6	252537	252542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881895
3995	NC_021081	CTG	2	6	252615	252620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881895
3996	NC_021081	GCA	2	6	252626	252631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881895
3997	NC_021081	GTG	2	6	252661	252666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881895
3998	NC_021081	TCA	2	6	252728	252733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881895
3999	NC_021081	GTG	2	6	252747	252752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881895
4000	NC_021081	GTA	2	6	252768	252773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881895

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