MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 48211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021081	CGG	2	6	93698	93703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881733
1502	NC_021081	CGG	2	6	93743	93748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881733
1503	NC_021081	GTT	2	6	93816	93821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881733
1504	NC_021081	CAG	2	6	93846	93851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881733
1505	NC_021081	CGG	2	6	93920	93925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881733
1506	NC_021081	ATG	2	6	93952	93957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881733
1507	NC_021081	GCG	2	6	93979	93984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881733
1508	NC_021081	AGC	2	6	93985	93990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881733
1509	NC_021081	TGT	2	6	94007	94012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881733
1510	NC_021081	CAC	2	6	94144	94149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881734
1511	NC_021081	GGT	2	6	94167	94172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881734
1512	NC_021081	AGC	2	6	94208	94213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881734
1513	NC_021081	CAG	2	6	94330	94335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881734
1514	NC_021081	CTC	2	6	94369	94374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881734
1515	NC_021081	GGC	2	6	94408	94413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881734
1516	NC_021081	GTT	2	6	94419	94424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881734
1517	NC_021081	CTC	2	6	94429	94434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881734
1518	NC_021081	TCT	2	6	94457	94462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881734
1519	NC_021081	ACC	2	6	94496	94501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881734
1520	NC_021081	GTT	2	6	94534	94539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881734
1521	NC_021081	GGC	2	6	94540	94545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881734
1522	NC_021081	CAC	4	12	94579	94590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881734
1523	NC_021081	GTT	2	6	94606	94611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881734
1524	NC_021081	CTT	2	6	94656	94661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881734
1525	NC_021081	ACG	2	6	94696	94701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881734
1526	NC_021081	ACC	2	6	94937	94942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881735
1527	NC_021081	GGC	2	6	94977	94982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881735
1528	NC_021081	GCG	2	6	95063	95068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881735
1529	NC_021081	GGA	2	6	95103	95108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881735
1530	NC_021081	CTG	2	6	95148	95153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881735
1531	NC_021081	GGT	2	6	95299	95304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881735
1532	NC_021081	AGC	2	6	95306	95311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881735
1533	NC_021081	TTC	2	6	95371	95376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881735
1534	NC_021081	AGG	2	6	95381	95386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881735
1535	NC_021081	TGG	2	6	95415	95420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881735
1536	NC_021081	CGG	2	6	95433	95438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881735
1537	NC_021081	TTG	2	6	95441	95446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881735
1538	NC_021081	AGA	2	6	95457	95462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881735
1539	NC_021081	CGA	2	6	95538	95543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881735
1540	NC_021081	GGC	2	6	95901	95906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_021081	GCT	2	6	95919	95924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881736
1542	NC_021081	TGG	2	6	95987	95992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881736
1543	NC_021081	CAA	2	6	96231	96236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_021081	GCT	2	6	96254	96259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_021081	CAT	2	6	96335	96340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881738
1546	NC_021081	CTC	2	6	96417	96422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881738
1547	NC_021081	GCT	2	6	96434	96439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881738
1548	NC_021081	ACC	2	6	96570	96575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881738
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1550	NC_021081	ACT	2	6	96690	96695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_021081	CGC	2	6	96778	96783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_021081	TGG	2	6	96927	96932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021081	TCT	2	6	97147	97152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_021081	AAT	2	6	97190	97195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021081	GGT	2	6	97273	97278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_021081	GGC	2	6	97303	97308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_021081	CGA	2	6	97315	97320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_021081	CCG	2	6	97363	97368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_021081	CGA	2	6	97418	97423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_021081	CAA	2	6	97453	97458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_021081	CTG	2	6	97481	97486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_021081	GCT	2	6	97498	97503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_021081	GCC	2	6	97578	97583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881739
1564	NC_021081	TGG	2	6	97705	97710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881739
1565	NC_021081	CTG	2	6	97713	97718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881739
1566	NC_021081	CTG	2	6	97787	97792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881740
1567	NC_021081	AGG	2	6	98113	98118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881741
1568	NC_021081	TGC	2	6	98270	98275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881742
1569	NC_021081	CAG	2	6	98279	98284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881742
1570	NC_021081	ATC	2	6	98308	98313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881742
1571	NC_021081	CCG	2	6	98315	98320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881742
1572	NC_021081	AGG	2	6	98363	98368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881742
1573	NC_021081	GCG	2	6	98394	98399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881742
1574	NC_021081	CAG	2	6	98400	98405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881742
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1576	NC_021081	GCA	2	6	98450	98455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881742
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1581	NC_021081	CTG	2	6	98860	98865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881744
1582	NC_021081	CCG	2	6	98905	98910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881744
1583	NC_021081	GCA	2	6	99234	99239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881745
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1585	NC_021081	TCC	2	6	99398	99403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881745
1586	NC_021081	CAG	2	6	99424	99429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881745
1587	NC_021081	GCC	2	6	99612	99617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881745
1588	NC_021081	ACC	2	6	99638	99643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881745
1589	NC_021081	CAA	2	6	99646	99651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881745
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1591	NC_021081	TGG	2	6	99977	99982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881746
1592	NC_021081	TGG	2	6	100004	100009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881746
1593	NC_021081	ATG	3	9	100165	100173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881746
1594	NC_021081	TGG	2	6	100205	100210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881746
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1601	NC_021081	CTG	2	6	100555	100560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881746
1602	NC_021081	CTG	2	6	100606	100611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881746
1603	NC_021081	TGG	2	6	100643	100648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881746
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1608	NC_021081	TGG	2	6	101033	101038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881746
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1610	NC_021081	TGG	2	6	101114	101119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881746
1611	NC_021081	TTG	2	6	101149	101154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881746
1612	NC_021081	CTG	2	6	101167	101172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881746
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1621	NC_021081	ACG	2	6	101569	101574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881747
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1623	NC_021081	GCC	2	6	101632	101637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881747
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1981	NC_021081	AGC	2	6	123250	123255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881768
1982	NC_021081	GCA	2	6	123327	123332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881768
1983	NC_021081	CGA	2	6	123385	123390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881768
1984	NC_021081	CTT	2	6	123457	123462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881768
1985	NC_021081	CGG	2	6	123564	123569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881768
1986	NC_021081	CCT	2	6	123589	123594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881768
1987	NC_021081	GAA	3	9	123698	123706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881768
1988	NC_021081	CGA	2	6	123718	123723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881768
1989	NC_021081	GAA	2	6	123836	123841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881768
1990	NC_021081	CAG	3	9	123850	123858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881768
1991	NC_021081	CTT	2	6	123898	123903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881768
1992	NC_021081	AGC	2	6	123988	123993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881768
1993	NC_021081	CGA	2	6	124030	124035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881768
1994	NC_021081	CTT	2	6	124039	124044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881768
1995	NC_021081	GCT	2	6	124174	124179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881768
1996	NC_021081	CCG	2	6	124303	124308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881768
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1999	NC_021081	AGG	2	6	124554	124559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881768
2000	NC_021081	AAG	2	6	124601	124606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881769

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