MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 48211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021081	GCT	2	6	320906	320911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881957
5002	NC_021081	AAG	2	6	321027	321032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881957
5003	NC_021081	CGA	2	6	321044	321049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881957
5004	NC_021081	TGG	2	6	321094	321099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881957
5005	NC_021081	CGA	2	6	321122	321127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881957
5006	NC_021081	TGG	2	6	321211	321216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881957
5007	NC_021081	TGG	2	6	321235	321240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881957
5008	NC_021081	GTG	3	9	321258	321266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881957
5009	NC_021081	GTA	2	6	321360	321365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021081	AGC	2	6	321404	321409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_021081	TGG	2	6	321429	321434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021081	GAT	2	6	321504	321509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881958
5013	NC_021081	AAG	2	6	321574	321579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881958
5014	NC_021081	AAC	2	6	321607	321612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881958
5015	NC_021081	GTG	2	6	321625	321630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881958
5016	NC_021081	GGA	2	6	321714	321719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881958
5017	NC_021081	GCC	2	6	321934	321939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881958
5018	NC_021081	CTT	2	6	321966	321971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881958
5019	NC_021081	CGT	2	6	322018	322023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881958
5020	NC_021081	CTG	2	6	322064	322069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_021081	ACC	3	9	322132	322140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881959
5022	NC_021081	GGA	2	6	322266	322271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881959
5023	NC_021081	CGG	2	6	322310	322315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881959
5024	NC_021081	TGG	3	9	322364	322372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881959
5025	NC_021081	GCT	2	6	322389	322394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881959
5026	NC_021081	GCA	2	6	322410	322415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881959
5027	NC_021081	GCC	2	6	322467	322472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881959
5028	NC_021081	GAG	2	6	322633	322638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881959
5029	NC_021081	TGG	2	6	322646	322651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881959
5030	NC_021081	GGT	2	6	322714	322719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021081	CCT	2	6	322888	322893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881960
5032	NC_021081	GCT	2	6	322972	322977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881960
5033	NC_021081	CTG	2	6	323027	323032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881960
5034	NC_021081	TTG	2	6	323142	323147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881960
5035	NC_021081	CGC	2	6	323164	323169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881960
5036	NC_021081	CGG	2	6	323176	323181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881960
5037	NC_021081	TGT	2	6	323182	323187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881960
5038	NC_021081	TCG	2	6	323292	323297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881960
5039	NC_021081	CAG	3	9	323393	323401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881960
5040	NC_021081	GGT	2	6	323497	323502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881960
5041	NC_021081	GGA	2	6	323526	323531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881960
5042	NC_021081	GCT	2	6	323567	323572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881960
5043	NC_021081	CAC	2	6	323603	323608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881960
5044	NC_021081	GGT	2	6	323612	323617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881960
5045	NC_021081	AGC	2	6	323619	323624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881960
5046	NC_021081	TGC	2	6	323664	323669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881960
5047	NC_021081	AAT	2	6	323672	323677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881960
5048	NC_021081	CAG	3	9	323684	323692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881960
5049	NC_021081	GTG	2	6	323951	323956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881961
5050	NC_021081	TCG	2	6	324041	324046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881961
5051	NC_021081	GCG	2	6	324062	324067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881961
5052	NC_021081	CAG	2	6	324151	324156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881961
5053	NC_021081	TGC	2	6	324257	324262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881961
5054	NC_021081	GCC	2	6	324267	324272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881961
5055	NC_021081	CAG	2	6	324352	324357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881961
5056	NC_021081	GCG	2	6	324379	324384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881961
5057	NC_021081	TGC	2	6	324413	324418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881961
5058	NC_021081	CGG	2	6	324425	324430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881961
5059	NC_021081	GGC	2	6	324748	324753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881961
5060	NC_021081	GCA	3	9	324879	324887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881961
5061	NC_021081	TTG	2	6	324911	324916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881961
5062	NC_021081	GCA	2	6	325053	325058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881961
5063	NC_021081	TGG	2	6	325248	325253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881962
5064	NC_021081	GTG	2	6	325314	325319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881962
5065	NC_021081	GCG	3	9	325320	325328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881962
5066	NC_021081	GGC	2	6	325508	325513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881962
5067	NC_021081	AGC	2	6	325528	325533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881962
5068	NC_021081	GCA	2	6	325589	325594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881962
5069	NC_021081	CAA	2	6	325604	325609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881962
5070	NC_021081	CTG	2	6	325635	325640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881962
5071	NC_021081	CAC	2	6	325645	325650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881962
5072	NC_021081	CGG	2	6	325681	325686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881962
5073	NC_021081	GCA	2	6	325763	325768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881962
5074	NC_021081	ACC	2	6	325782	325787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881962
5075	NC_021081	CCG	2	6	325832	325837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881962
5076	NC_021081	TGG	2	6	325961	325966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881963
5077	NC_021081	TCA	2	6	326042	326047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881963
5078	NC_021081	GGC	2	6	326073	326078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881963
5079	NC_021081	ATC	2	6	326110	326115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881963
5080	NC_021081	GCC	2	6	326223	326228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881963
5081	NC_021081	CAG	2	6	326350	326355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881963
5082	NC_021081	GCT	2	6	326442	326447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_021081	TGC	2	6	326514	326519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_021081	AGC	2	6	326560	326565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_021081	AGG	2	6	326653	326658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021081	CTT	2	6	326680	326685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881964
5087	NC_021081	GAA	2	6	326686	326691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881964
5088	NC_021081	GCG	2	6	326711	326716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881964
5089	NC_021081	CGG	2	6	326880	326885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881964
5090	NC_021081	TAC	2	6	326963	326968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881964
5091	NC_021081	GCC	2	6	327083	327088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881964
5092	NC_021081	TCA	2	6	327099	327104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881964
5093	NC_021081	GGC	2	6	327137	327142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881964
5094	NC_021081	GGC	2	6	327253	327258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881964
5095	NC_021081	GGC	2	6	327349	327354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881964
5096	NC_021081	CTA	3	9	327361	327369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881964
5097	NC_021081	TGG	2	6	327377	327382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881964
5098	NC_021081	GGC	2	6	327463	327468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881964
5099	NC_021081	TGC	2	6	327579	327584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881964
5100	NC_021081	GGC	2	6	327586	327591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881964
5101	NC_021081	GAA	2	6	327617	327622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881964
5102	NC_021081	GCC	2	6	327626	327631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881964
5103	NC_021081	ACC	2	6	327638	327643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881964
5104	NC_021081	GAA	2	6	327667	327672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881964
5105	NC_021081	CGA	2	6	327679	327684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881964
5106	NC_021081	CGC	2	6	327689	327694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881964
5107	NC_021081	GAT	2	6	327722	327727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881964
5108	NC_021081	CGT	2	6	327775	327780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_021081	CAA	2	6	327832	327837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_021081	GTT	2	6	327862	327867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021081	TGG	2	6	327961	327966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881965
5112	NC_021081	GAT	2	6	327971	327976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881965
5113	NC_021081	TCT	2	6	328088	328093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881965
5114	NC_021081	GAC	2	6	328158	328163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881965
5115	NC_021081	GTG	2	6	328206	328211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881965
5116	NC_021081	TGC	2	6	328222	328227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881965
5117	NC_021081	TGG	2	6	328249	328254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881965
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5119	NC_021081	CTG	2	6	328344	328349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881965
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