MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 48211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021081	AAG	2	6	286837	286842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881920
4502	NC_021081	TAA	2	6	286862	286867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881920
4503	NC_021081	TGG	2	6	286877	286882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881920
4504	NC_021081	CGA	2	6	286901	286906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881920
4505	NC_021081	CGT	2	6	287132	287137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881920
4506	NC_021081	TGC	2	6	287144	287149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881920
4507	NC_021081	GTA	2	6	287163	287168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881920
4508	NC_021081	GCC	2	6	287193	287198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881920
4509	NC_021081	ACC	3	9	287217	287225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881920
4510	NC_021081	CCG	2	6	287230	287235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881920
4511	NC_021081	GCC	2	6	287244	287249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881920
4512	NC_021081	TCG	2	6	287434	287439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_021081	TTA	2	6	287573	287578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_021081	GAA	2	6	287595	287600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_021081	GAG	2	6	287657	287662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_021081	CTG	3	9	287899	287907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881921
4517	NC_021081	TTG	2	6	287911	287916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881921
4518	NC_021081	GCT	2	6	287929	287934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881921
4519	NC_021081	TTG	2	6	287978	287983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881921
4520	NC_021081	TGG	2	6	288030	288035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881921
4521	NC_021081	TGC	2	6	288056	288061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881921
4522	NC_021081	GGT	2	6	288081	288086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881921
4523	NC_021081	TTG	2	6	288109	288114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881921
4524	NC_021081	CTG	2	6	288172	288177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881921
4525	NC_021081	GGT	2	6	288252	288257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881921
4526	NC_021081	GCC	2	6	288313	288318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881921
4527	NC_021081	TTG	2	6	288355	288360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881921
4528	NC_021081	TGC	2	6	288497	288502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881921
4529	NC_021081	TGA	2	6	288548	288553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881921
4530	NC_021081	TGG	2	6	288554	288559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881921
4531	NC_021081	GGC	2	6	288602	288607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881921
4532	NC_021081	GGT	2	6	288696	288701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881921
4533	NC_021081	GGC	2	6	288789	288794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881921
4534	NC_021081	CGG	2	6	288883	288888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881922
4535	NC_021081	CCT	2	6	288944	288949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881922
4536	NC_021081	GTA	2	6	288957	288962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881922
4537	NC_021081	CGG	2	6	288974	288979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881922
4538	NC_021081	TGG	2	6	289067	289072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881922
4539	NC_021081	TTC	2	6	289219	289224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881923
4540	NC_021081	CGG	2	6	289257	289262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881923
4541	NC_021081	AGC	3	9	289406	289414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881923
4542	NC_021081	GGC	2	6	289473	289478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881923
4543	NC_021081	TCG	2	6	289610	289615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881923
4544	NC_021081	TTC	2	6	289678	289683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881923
4545	NC_021081	GTA	2	6	289702	289707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881923
4546	NC_021081	GCT	2	6	289769	289774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881923
4547	NC_021081	GGC	2	6	289777	289782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881923
4548	NC_021081	CGC	2	6	289833	289838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881923
4549	NC_021081	ATG	2	6	289847	289852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881923
4550	NC_021081	CCA	2	6	289854	289859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881923
4551	NC_021081	GGC	2	6	289885	289890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881923
4552	NC_021081	AGC	2	6	289895	289900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881923
4553	NC_021081	TGG	2	6	289982	289987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881923
4554	NC_021081	CAG	2	6	289996	290001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881923
4555	NC_021081	TGC	2	6	290003	290008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881923
4556	NC_021081	GCC	2	6	290035	290040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881923
4557	NC_021081	GCA	2	6	290077	290082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881924
4558	NC_021081	TGG	2	6	290383	290388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881924
4559	NC_021081	GTC	2	6	290402	290407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881924
4560	NC_021081	CGG	2	6	290461	290466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881924
4561	NC_021081	CCT	2	6	290494	290499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881924
4562	NC_021081	GAT	2	6	290564	290569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881924
4563	NC_021081	GGT	2	6	290590	290595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881924
4564	NC_021081	CTT	2	6	290632	290637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881924
4565	NC_021081	CCT	2	6	290661	290666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_021081	CCT	2	6	290741	290746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881925
4567	NC_021081	GTA	2	6	290796	290801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881925
4568	NC_021081	CCA	2	6	290816	290821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881925
4569	NC_021081	ACC	3	9	290854	290862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881925
4570	NC_021081	CCG	2	6	290921	290926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881925
4571	NC_021081	CAC	2	6	290931	290936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881925
4572	NC_021081	ACC	2	6	291085	291090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881925
4573	NC_021081	GCG	2	6	291213	291218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881925
4574	NC_021081	GCC	2	6	291295	291300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881925
4575	NC_021081	GCA	2	6	291314	291319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881925
4576	NC_021081	CCT	2	6	291323	291328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881925
4577	NC_021081	CCT	2	6	291365	291370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881925
4578	NC_021081	GCG	2	6	291390	291395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881925
4579	NC_021081	CTC	2	6	291564	291569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881925
4580	NC_021081	GAG	2	6	291720	291725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_021081	GGC	2	6	291777	291782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881926
4582	NC_021081	CGG	2	6	291832	291837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881926
4583	NC_021081	GCT	2	6	291846	291851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881926
4584	NC_021081	AGA	3	9	291873	291881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881926
4585	NC_021081	GGT	2	6	291912	291917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881926
4586	NC_021081	GTG	3	9	292123	292131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881926
4587	NC_021081	GGC	2	6	292205	292210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881926
4588	NC_021081	CTG	2	6	292255	292260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881926
4589	NC_021081	CTA	2	6	292505	292510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881927
4590	NC_021081	CTG	2	6	292518	292523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881927
4591	NC_021081	GAC	2	6	292581	292586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881927
4592	NC_021081	GTG	2	6	292628	292633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881927
4593	NC_021081	GGA	2	6	292790	292795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881927
4594	NC_021081	TGA	2	6	292837	292842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881927
4595	NC_021081	CCG	2	6	292969	292974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881927
4596	NC_021081	AGG	2	6	293065	293070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881927
4597	NC_021081	CCG	2	6	293072	293077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881927
4598	NC_021081	GCA	2	6	293409	293414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881928
4599	NC_021081	ACT	2	6	293466	293471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881928
4600	NC_021081	GCC	2	6	293532	293537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881928
4601	NC_021081	GAT	2	6	293649	293654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881929
4602	NC_021081	GTG	2	6	293870	293875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881930
4603	NC_021081	CGG	2	6	293901	293906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881930
4604	NC_021081	GCG	2	6	293947	293952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881930
4605	NC_021081	GGT	2	6	294046	294051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881930
4606	NC_021081	GGA	2	6	294052	294057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881930
4607	NC_021081	CCG	3	9	294162	294170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881930
4608	NC_021081	CCG	2	6	294208	294213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881930
4609	NC_021081	AAG	2	6	294252	294257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881930
4610	NC_021081	GCC	3	9	294439	294447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881930
4611	NC_021081	GTC	2	6	294460	294465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881930
4612	NC_021081	GGT	2	6	294676	294681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881930
4613	NC_021081	TGC	2	6	294714	294719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881930
4614	NC_021081	CCG	2	6	294720	294725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881930
4615	NC_021081	TGC	2	6	294780	294785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881930
4616	NC_021081	CCT	2	6	294853	294858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881930
4617	NC_021081	TAC	2	6	295010	295015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881930
4618	NC_021081	CGC	2	6	295109	295114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881930
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4620	NC_021081	CGG	2	6	295303	295308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881930
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4981	NC_021081	CGG	2	6	319282	319287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881956
4982	NC_021081	TGG	2	6	319345	319350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881956
4983	NC_021081	GCC	2	6	319361	319366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881956
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4989	NC_021081	GCT	2	6	319879	319884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881956
4990	NC_021081	GAT	2	6	319961	319966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881956
4991	NC_021081	ATC	2	6	319983	319988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881956
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4993	NC_021081	GAT	2	6	320120	320125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881956
4994	NC_021081	GCC	3	9	320189	320197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881956
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4996	NC_021081	GGC	2	6	320480	320485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881956
4997	NC_021081	TTG	2	6	320617	320622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_021081	GAT	2	6	320636	320641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881957
4999	NC_021081	CCG	2	6	320870	320875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881957
5000	NC_021081	GGT	2	6	320885	320890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881957

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