MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 48211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021081	GCA	2	6	252887	252892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881895
4002	NC_021081	GCA	2	6	252896	252901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881895
4003	NC_021081	GGC	2	6	252903	252908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881895
4004	NC_021081	GCA	2	6	252944	252949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881895
4005	NC_021081	CGG	2	6	252953	252958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881895
4006	NC_021081	GCG	2	6	252981	252986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881895
4007	NC_021081	GTC	3	9	252990	252998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881895
4008	NC_021081	CCA	2	6	253037	253042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881895
4009	NC_021081	CCG	2	6	253057	253062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881895
4010	NC_021081	TCT	2	6	253085	253090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881895
4011	NC_021081	GTA	2	6	253128	253133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881895
4012	NC_021081	TGG	2	6	253166	253171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881895
4013	NC_021081	CAA	2	6	253262	253267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881895
4014	NC_021081	CTG	2	6	253416	253421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881896
4015	NC_021081	TCG	2	6	253477	253482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881896
4016	NC_021081	AGC	2	6	253483	253488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881896
4017	NC_021081	CAC	2	6	253551	253556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881896
4018	NC_021081	TGC	2	6	253771	253776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_021081	CAC	3	9	253800	253808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881897
4020	NC_021081	TCG	2	6	253852	253857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881897
4021	NC_021081	GGC	2	6	253899	253904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881897
4022	NC_021081	CAG	2	6	253938	253943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881897
4023	NC_021081	ACC	2	6	254005	254010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881897
4024	NC_021081	GGC	2	6	254013	254018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881897
4025	NC_021081	GGC	2	6	254049	254054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881897
4026	NC_021081	TGC	2	6	254101	254106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881897
4027	NC_021081	GGC	2	6	254109	254114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881897
4028	NC_021081	GGA	2	6	254265	254270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881897
4029	NC_021081	GTG	2	6	254284	254289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881897
4030	NC_021081	CCG	2	6	254318	254323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881897
4031	NC_021081	CAG	2	6	254502	254507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_021081	CAC	3	9	254561	254569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881898
4033	NC_021081	AAT	2	6	254645	254650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881898
4034	NC_021081	GCC	2	6	254786	254791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881898
4035	NC_021081	GCC	2	6	254889	254894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881898
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4037	NC_021081	CGT	2	6	255127	255132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881898
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4039	NC_021081	CCA	2	6	255247	255252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881898
4040	NC_021081	GTC	2	6	255263	255268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881898
4041	NC_021081	GCA	2	6	255274	255279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881898
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4043	NC_021081	CGG	2	6	255463	255468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881898
4044	NC_021081	CTC	2	6	255494	255499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881898
4045	NC_021081	CAG	2	6	255524	255529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881898
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4047	NC_021081	GTT	2	6	255647	255652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881898
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4049	NC_021081	ATC	2	6	255756	255761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881898
4050	NC_021081	CCT	2	6	255792	255797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_021081	GCA	2	6	255896	255901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881899
4052	NC_021081	CCG	2	6	255950	255955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881899
4053	NC_021081	ACC	3	9	255969	255977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881899
4054	NC_021081	TGG	2	6	256052	256057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881899
4055	NC_021081	CTG	2	6	256087	256092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881899
4056	NC_021081	CTG	2	6	256132	256137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881899
4057	NC_021081	ACA	2	6	256338	256343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881899
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4059	NC_021081	GGA	2	6	256440	256445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881899
4060	NC_021081	GCT	2	6	256465	256470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881899
4061	NC_021081	CCG	2	6	256472	256477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881899
4062	NC_021081	CGG	2	6	256495	256500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881899
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4064	NC_021081	GGC	2	6	256649	256654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881899
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4090	NC_021081	CTG	2	6	258398	258403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881900
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4120	NC_021081	CTG	2	6	260028	260033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881901
4121	NC_021081	GAT	2	6	260070	260075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881901
4122	NC_021081	TGA	2	6	260228	260233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881901
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4140	NC_021081	CTG	2	6	261991	261996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881902
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4181	NC_021081	TCC	2	6	265290	265295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4182	NC_021081	CGG	3	9	265391	265399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881905
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4232	NC_021081	ACC	2	6	268263	268268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881908
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4476	NC_021081	AAT	2	6	285454	285459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881919
4477	NC_021081	CGG	2	6	285552	285557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881919
4478	NC_021081	CTG	2	6	285688	285693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881919
4479	NC_021081	CAT	2	6	285705	285710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881919
4480	NC_021081	GTG	2	6	285719	285724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881919
4481	NC_021081	TGA	2	6	285738	285743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881919
4482	NC_021081	CTA	2	6	285816	285821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881919
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4491	NC_021081	TGT	2	6	286391	286396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881920
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