MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 39939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015850	ATT	2	6	298238	298243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340781024
4002	NC_015850	TCG	2	6	298275	298280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781024
4003	NC_015850	CGG	2	6	298312	298317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781024
4004	NC_015850	GCC	2	6	298349	298354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781024
4005	NC_015850	CCT	2	6	298552	298557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781024
4006	NC_015850	GCC	2	6	298580	298585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781024
4007	NC_015850	CTC	2	6	298619	298624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781024
4008	NC_015850	GCG	2	6	298628	298633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781024
4009	NC_015850	GAC	2	6	298798	298803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781025
4010	NC_015850	CCT	3	9	298869	298877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781025
4011	NC_015850	TCG	2	6	298925	298930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781025
4012	NC_015850	CGC	2	6	298984	298989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781025
4013	NC_015850	GGC	2	6	299053	299058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781025
4014	NC_015850	TCC	2	6	299102	299107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781025
4015	NC_015850	CGA	2	6	299160	299165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781025
4016	NC_015850	ACG	2	6	299304	299309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781025
4017	NC_015850	CGG	2	6	299319	299324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781025
4018	NC_015850	AGG	2	6	299423	299428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781025
4019	NC_015850	TGA	2	6	299572	299577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781026
4020	NC_015850	CAG	2	6	299717	299722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781026
4021	NC_015850	GTG	2	6	299793	299798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781026
4022	NC_015850	CGA	2	6	299824	299829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781026
4023	NC_015850	CGG	2	6	299947	299952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781026
4024	NC_015850	GAG	2	6	299957	299962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781026
4025	NC_015850	GCC	2	6	299984	299989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781026
4026	NC_015850	GCC	2	6	300075	300080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781026
4027	NC_015850	TGC	2	6	300127	300132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781026
4028	NC_015850	CGC	2	6	300169	300174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781026
4029	NC_015850	GAC	2	6	300218	300223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781026
4030	NC_015850	CGG	2	6	300279	300284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781026
4031	NC_015850	CCA	2	6	300346	300351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781026
4032	NC_015850	GTA	2	6	300364	300369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781026
4033	NC_015850	CAC	2	6	300371	300376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781026
4034	NC_015850	CCA	2	6	300379	300384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781026
4035	NC_015850	CTG	2	6	300386	300391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781026
4036	NC_015850	CGG	2	6	300520	300525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781026
4037	NC_015850	CCT	2	6	300598	300603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781026
4038	NC_015850	CCG	2	6	300756	300761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781026
4039	NC_015850	GGC	2	6	300767	300772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781026
4040	NC_015850	GGC	2	6	300801	300806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781026
4041	NC_015850	ACC	3	9	300831	300839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781026
4042	NC_015850	TGG	2	6	300844	300849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781026
4043	NC_015850	GCC	2	6	300872	300877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781026
4044	NC_015850	AGG	2	6	300963	300968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781026
4045	NC_015850	ACC	2	6	300969	300974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781026
4046	NC_015850	CAG	2	6	301025	301030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781026
4047	NC_015850	CCA	2	6	301120	301125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781026
4048	NC_015850	TGG	2	6	301177	301182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781026
4049	NC_015850	GCA	2	6	301213	301218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781026
4050	NC_015850	GAA	2	6	301223	301228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781026
4051	NC_015850	GAT	2	6	301235	301240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781026
4052	NC_015850	GTG	2	6	301260	301265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781026
4053	NC_015850	AGG	2	6	301305	301310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781026
4054	NC_015850	GAT	2	6	301313	301318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781026
4055	NC_015850	GCG	2	6	301431	301436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781027
4056	NC_015850	GCA	2	6	301581	301586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781027
4057	NC_015850	CGG	2	6	301640	301645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781027
4058	NC_015850	TCG	2	6	301646	301651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781027
4059	NC_015850	GGC	2	6	301704	301709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781027
4060	NC_015850	CAG	2	6	301732	301737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781027
4061	NC_015850	GTC	2	6	301768	301773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781027
4062	NC_015850	CGA	2	6	301856	301861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781027
4063	NC_015850	CGG	2	6	301977	301982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781027
4064	NC_015850	CAG	2	6	302065	302070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781027
4065	NC_015850	CCT	2	6	302079	302084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781027
4066	NC_015850	CCT	2	6	302097	302102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781028
4067	NC_015850	GCG	2	6	302115	302120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781028
4068	NC_015850	CCG	2	6	302189	302194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781028
4069	NC_015850	GCC	2	6	302239	302244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781028
4070	NC_015850	GGT	2	6	302255	302260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781028
4071	NC_015850	CGG	2	6	302302	302307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781028
4072	NC_015850	CGG	2	6	302386	302391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781028
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4082	NC_015850	CAG	2	6	302773	302778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781028
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4091	NC_015850	GGC	2	6	303219	303224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781028
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4101	NC_015850	GAC	2	6	303688	303693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781028
4102	NC_015850	CGC	2	6	303704	303709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781028
4103	NC_015850	CGG	2	6	303710	303715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781028
4104	NC_015850	CAG	2	6	303730	303735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781028
4105	NC_015850	CCA	3	9	303745	303753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781028
4106	NC_015850	GCG	2	6	303760	303765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781028
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4112	NC_015850	CGG	2	6	304131	304136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781028
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4239	NC_015850	TCG	2	6	312105	312110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781033
4240	NC_015850	AGC	2	6	312114	312119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781033
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4357	NC_015850	GCA	2	6	320873	320878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781042
4358	NC_015850	CAC	2	6	320883	320888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781042
4359	NC_015850	CAC	2	6	320916	320921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781042
4360	NC_015850	CCA	2	6	320993	320998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781042
4361	NC_015850	GCA	2	6	321032	321037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781042
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4372	NC_015850	TGA	2	6	322091	322096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781044
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