MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 39939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_015850	TGG	2	6	143303	143308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780881
2003	NC_015850	TGG	2	6	143393	143398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780881
2004	NC_015850	TCT	2	6	143510	143515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780882
2005	NC_015850	ATT	2	6	143519	143524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340780882
2006	NC_015850	GTC	2	6	143620	143625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780882
2007	NC_015850	AAG	2	6	143813	143818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780882
2008	NC_015850	GAT	2	6	144100	144105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780882
2009	NC_015850	TGG	2	6	144192	144197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780882
2010	NC_015850	CAA	2	6	144306	144311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780882
2011	NC_015850	GGT	2	6	144373	144378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780882
2012	NC_015850	GGC	2	6	144403	144408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780882
2013	NC_015850	CGA	2	6	144505	144510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780882
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2017	NC_015850	TCG	2	6	144804	144809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780882
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2021	NC_015850	GAC	2	6	144974	144979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780882
2022	NC_015850	GCT	2	6	145133	145138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780882
2023	NC_015850	TGG	2	6	145155	145160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780882
2024	NC_015850	TGA	2	6	145218	145223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780882
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2238	NC_015850	GAG	2	6	168230	168235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780910
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2240	NC_015850	TGG	2	6	168372	168377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780910
2241	NC_015850	TGC	2	6	168521	168526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780911
2242	NC_015850	GCA	2	6	168644	168649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780911
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2474	NC_015850	TGG	2	6	189743	189748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780930
2475	NC_015850	CAT	2	6	189764	189769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780930
2476	NC_015850	CGC	2	6	189923	189928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780930
2477	NC_015850	ATC	2	6	190379	190384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780931
2478	NC_015850	TCC	2	6	190455	190460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780931
2479	NC_015850	CCA	2	6	190555	190560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780931
2480	NC_015850	GTC	2	6	190814	190819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780932
2481	NC_015850	TGC	2	6	190887	190892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780932
2482	NC_015850	TGG	2	6	190920	190925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780932
2483	NC_015850	TGG	2	6	190932	190937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780932
2484	NC_015850	TGG	2	6	190941	190946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780932
2485	NC_015850	CAC	2	6	190978	190983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780932
2486	NC_015850	TGT	2	6	190995	191000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780932
2487	NC_015850	GTC	2	6	191003	191008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780932
2488	NC_015850	GCT	3	9	191185	191193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780932
2489	NC_015850	CGC	2	6	191290	191295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780932
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2491	NC_015850	CTG	2	6	191312	191317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780932
2492	NC_015850	TGG	2	6	191319	191324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780932
2493	NC_015850	CCT	2	6	191590	191595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780933
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2495	NC_015850	CGG	2	6	191734	191739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780933
2496	NC_015850	GAC	2	6	191805	191810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780933
2497	NC_015850	TGA	2	6	191865	191870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780933
2498	NC_015850	GTC	2	6	191951	191956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780933
2499	NC_015850	GCC	2	6	192022	192027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780933
2500	NC_015850	GCG	2	6	192062	192067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780933

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