MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 39939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_015850	CGC	2	6	66178	66183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780803
1003	NC_015850	ATG	3	9	66195	66203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780803
1004	NC_015850	TCT	2	6	66252	66257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780803
1005	NC_015850	CAT	2	6	66263	66268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780803
1006	NC_015850	CAG	2	6	66275	66280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780803
1007	NC_015850	GCA	2	6	66373	66378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780803
1008	NC_015850	TGC	2	6	66382	66387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780803
1009	NC_015850	GTC	2	6	66398	66403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780803
1010	NC_015850	CCA	2	6	66406	66411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780803
1011	NC_015850	CTG	2	6	66505	66510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780804
1012	NC_015850	GCA	2	6	66567	66572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780804
1013	NC_015850	TGG	2	6	66615	66620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780804
1014	NC_015850	CGG	2	6	66621	66626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780804
1015	NC_015850	TCT	2	6	66696	66701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780804
1016	NC_015850	GCC	2	6	66707	66712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780804
1017	NC_015850	GGT	2	6	66907	66912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780804
1018	NC_015850	CGG	2	6	66933	66938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780804
1019	NC_015850	AGC	2	6	66952	66957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780804
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1021	NC_015850	GGC	2	6	66970	66975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780804
1022	NC_015850	CAG	2	6	66987	66992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780804
1023	NC_015850	GGT	2	6	67220	67225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780805
1024	NC_015850	CCT	2	6	67227	67232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780805
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1027	NC_015850	GCC	2	6	67362	67367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780805
1028	NC_015850	CGG	2	6	67463	67468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780805
1029	NC_015850	GCT	2	6	67495	67500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780805
1030	NC_015850	CTA	2	6	67758	67763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780805
1031	NC_015850	GCC	2	6	67897	67902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780805
1032	NC_015850	GGC	2	6	67926	67931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780805
1033	NC_015850	GGC	3	9	67968	67976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780805
1034	NC_015850	CGC	2	6	68033	68038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780805
1035	NC_015850	GGC	2	6	68055	68060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780805
1036	NC_015850	GCC	2	6	68077	68082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780805
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1042	NC_015850	CCA	2	6	68492	68497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780805
1043	NC_015850	TGC	2	6	68507	68512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780805
1044	NC_015850	CAT	2	6	68636	68641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780806
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1052	NC_015850	TCA	2	6	69229	69234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780806
1053	NC_015850	GCC	2	6	69288	69293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780806
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1058	NC_015850	CGG	2	6	69643	69648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780806
1059	NC_015850	GTG	2	6	69730	69735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780806
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1062	NC_015850	AGT	2	6	69959	69964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780807
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1089	NC_015850	ATG	2	6	71711	71716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780807
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1093	NC_015850	CAG	2	6	72047	72052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780807
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1099	NC_015850	GCG	2	6	72318	72323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780807
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1101	NC_015850	ATC	2	6	72500	72505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780807
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1489	NC_015850	CCA	2	6	94942	94947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780832
1490	NC_015850	CAC	2	6	94963	94968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780832
1491	NC_015850	GGC	3	9	95046	95054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780832
1492	NC_015850	TGG	2	6	95127	95132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780832
1493	NC_015850	GGA	2	6	95163	95168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780832
1494	NC_015850	CTG	2	6	95252	95257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780833
1495	NC_015850	CCT	2	6	95309	95314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780833
1496	NC_015850	CTC	2	6	95334	95339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780833
1497	NC_015850	CTG	2	6	95343	95348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780833
1498	NC_015850	TCG	2	6	95425	95430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780833
1499	NC_015850	AGA	2	6	95497	95502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780833
1500	NC_015850	CAT	2	6	95600	95605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780833

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