MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 39939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015850	TGG	2	6	330481	330486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781054
4502	NC_015850	CTG	2	6	330570	330575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781054
4503	NC_015850	GCC	2	6	330582	330587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781054
4504	NC_015850	GGC	2	6	330650	330655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781054
4505	NC_015850	GCC	2	6	330663	330668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781054
4506	NC_015850	TGC	2	6	330739	330744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781054
4507	NC_015850	GCC	2	6	330771	330776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781054
4508	NC_015850	GGT	2	6	330807	330812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781054
4509	NC_015850	CAT	2	6	330920	330925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781055
4510	NC_015850	CGC	2	6	330994	330999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781055
4511	NC_015850	GAG	2	6	331128	331133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781055
4512	NC_015850	GAT	2	6	331142	331147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781055
4513	NC_015850	CGG	3	9	331174	331182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781055
4514	NC_015850	CGC	2	6	331193	331198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781055
4515	NC_015850	ATG	2	6	331269	331274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781055
4516	NC_015850	AGG	2	6	331333	331338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781055
4517	NC_015850	AGA	2	6	331399	331404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781055
4518	NC_015850	CCG	2	6	331405	331410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781055
4519	NC_015850	ATC	2	6	331419	331424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781055
4520	NC_015850	GGT	2	6	331593	331598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781055
4521	NC_015850	GTG	2	6	331740	331745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781055
4522	NC_015850	GCG	2	6	331753	331758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781055
4523	NC_015850	GCC	2	6	331767	331772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781055
4524	NC_015850	GCA	2	6	331814	331819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781055
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4526	NC_015850	GTC	2	6	331866	331871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781055
4527	NC_015850	GCC	2	6	331875	331880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781055
4528	NC_015850	GGT	2	6	331910	331915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781055
4529	NC_015850	GGC	2	6	331968	331973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781055
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4532	NC_015850	CTG	2	6	332174	332179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781056
4533	NC_015850	CTG	2	6	332210	332215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781056
4534	NC_015850	CCG	2	6	332220	332225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781056
4535	NC_015850	TGC	2	6	332301	332306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781056
4536	NC_015850	GCA	2	6	332482	332487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781056
4537	NC_015850	GAT	2	6	332545	332550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781056
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4539	NC_015850	CCG	2	6	332572	332577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781056
4540	NC_015850	ACT	2	6	332607	332612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781056
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4544	NC_015850	GCT	2	6	332904	332909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781056
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4551	NC_015850	GCG	3	9	333175	333183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781057
4552	NC_015850	GCA	2	6	333207	333212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781057
4553	NC_015850	TCG	2	6	333227	333232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781057
4554	NC_015850	CTC	2	6	333268	333273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781057
4555	NC_015850	TGG	2	6	333362	333367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781057
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4560	NC_015850	AGC	2	6	333559	333564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781057
4561	NC_015850	GGC	2	6	333591	333596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781057
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4563	NC_015850	TGG	2	6	333671	333676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781057
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4570	NC_015850	GCG	2	6	334003	334008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781057
4571	NC_015850	TCG	2	6	334097	334102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781057
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4974	NC_015850	GCT	2	6	359476	359481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781085
4975	NC_015850	TGG	2	6	359499	359504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781085
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