MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 39939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015850	TGG	2	6	361152	361157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781086
5002	NC_015850	GCA	2	6	361177	361182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781086
5003	NC_015850	CCT	2	6	361312	361317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781086
5004	NC_015850	CGG	2	6	361369	361374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781086
5005	NC_015850	AGG	2	6	361410	361415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781086
5006	NC_015850	CGA	2	6	361549	361554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781086
5007	NC_015850	TCG	2	6	361683	361688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781086
5008	NC_015850	GCC	2	6	361722	361727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781086
5009	NC_015850	GGA	2	6	361768	361773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781086
5010	NC_015850	CCG	2	6	361882	361887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781086
5011	NC_015850	ACC	3	9	362090	362098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5012	NC_015850	TCA	3	9	362178	362186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781087
5013	NC_015850	CCA	2	6	362226	362231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5014	NC_015850	ACC	2	6	362276	362281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5015	NC_015850	AGG	2	6	362303	362308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781087
5016	NC_015850	CGC	2	6	362370	362375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781087
5017	NC_015850	CCA	2	6	362376	362381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5018	NC_015850	TGA	2	6	362397	362402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781087
5019	NC_015850	GTC	2	6	362435	362440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5020	NC_015850	AGC	2	6	362459	362464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5021	NC_015850	GAC	2	6	362476	362481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5022	NC_015850	GCC	2	6	362524	362529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781087
5023	NC_015850	CGG	2	6	362548	362553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
5024	NC_015850	TCG	2	6	362588	362593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5025	NC_015850	CCG	2	6	362634	362639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781087
5026	NC_015850	AGG	2	6	362795	362800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781087
5027	NC_015850	TGC	2	6	362956	362961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5028	NC_015850	CAC	2	6	363055	363060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5029	NC_015850	GGC	2	6	363163	363168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
5030	NC_015850	CGC	2	6	363186	363191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781087
5031	NC_015850	TCG	2	6	363263	363268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5032	NC_015850	TCC	2	6	363563	363568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781087
5033	NC_015850	GCA	2	6	363582	363587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5034	NC_015850	CAG	2	6	363703	363708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5035	NC_015850	TGC	2	6	363754	363759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5036	NC_015850	GGA	2	6	363777	363782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781087
5037	NC_015850	GGT	2	6	363846	363851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781087
5038	NC_015850	CCA	4	12	363864	363875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5039	NC_015850	CGG	2	6	363876	363881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
5040	NC_015850	CCA	2	6	363885	363890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5041	NC_015850	CCG	2	6	363914	363919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781087
5042	NC_015850	CCA	2	6	363999	364004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5043	NC_015850	AGT	2	6	364037	364042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781087
5044	NC_015850	CAC	3	9	364045	364053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5045	NC_015850	AGC	2	6	364070	364075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5046	NC_015850	CCA	2	6	364104	364109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5047	NC_015850	CGA	3	9	364227	364235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5048	NC_015850	TCC	2	6	364295	364300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781087
5049	NC_015850	CGA	2	6	364350	364355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5050	NC_015850	GTC	2	6	364369	364374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5051	NC_015850	CTC	2	6	364423	364428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781087
5052	NC_015850	CGT	2	6	364443	364448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5053	NC_015850	TTG	2	6	364454	364459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781087
5054	NC_015850	CCA	2	6	364550	364555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781087
5055	NC_015850	GAT	2	6	364603	364608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781087
5056	NC_015850	GCG	2	6	364631	364636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
5057	NC_015850	CGG	2	6	364716	364721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
5058	NC_015850	CTG	2	6	364759	364764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5059	NC_015850	CCT	2	6	364788	364793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781087
5060	NC_015850	CAG	2	6	364864	364869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5061	NC_015850	TCC	2	6	364907	364912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781087
5062	NC_015850	GAT	2	6	364936	364941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781087
5063	NC_015850	GCG	2	6	364950	364955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
5064	NC_015850	AGC	3	9	365024	365032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781087
5065	NC_015850	GGC	2	6	365059	365064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781087
5066	NC_015850	CGG	3	9	365105	365113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781088
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5068	NC_015850	CGA	2	6	365534	365539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781088
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5072	NC_015850	CGG	3	9	365705	365713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781088
5073	NC_015850	GGC	2	6	365717	365722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781088
5074	NC_015850	TGT	2	6	365725	365730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781088
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5079	NC_015850	GCT	2	6	365937	365942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781088
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5081	NC_015850	GCG	2	6	366088	366093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781088
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5084	NC_015850	TGG	2	6	366277	366282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781089
5085	NC_015850	GAC	2	6	366315	366320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781089
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5087	NC_015850	TGG	2	6	366453	366458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781089
5088	NC_015850	TGC	2	6	366474	366479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781089
5089	NC_015850	GGA	2	6	366562	366567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781089
5090	NC_015850	CAG	2	6	366604	366609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781089
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5101	NC_015850	CGA	2	6	367609	367614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781090
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5103	NC_015850	TGG	2	6	367639	367644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781090
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5355	NC_015850	CCT	2	6	382227	382232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781107
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5471	NC_015850	GCA	2	6	389284	389289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781118
5472	NC_015850	GCA	2	6	389314	389319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781118
5473	NC_015850	AGC	2	6	389337	389342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781118
5474	NC_015850	TGG	2	6	389409	389414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781118
5475	NC_015850	CGG	2	6	389415	389420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781118
5476	NC_015850	ACG	2	6	389510	389515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781118
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5479	NC_015850	GCA	2	6	390043	390048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781119
5480	NC_015850	TCC	2	6	390081	390086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781119
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5482	NC_015850	ATC	2	6	390183	390188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781119
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5484	NC_015850	CGA	2	6	390199	390204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781119
5485	NC_015850	TCA	2	6	390237	390242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781119
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5491	NC_015850	CTA	2	6	390687	390692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781120
5492	NC_015850	TGG	2	6	390722	390727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781120
5493	NC_015850	GCG	2	6	390772	390777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781120
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5497	NC_015850	TGC	2	6	390998	391003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781120
5498	NC_015850	TGC	2	6	391118	391123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781120
5499	NC_015850	ACC	2	6	391208	391213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781120
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