MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 39939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015850	CAT	2	6	30772	30777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780773
502	NC_015850	GGT	2	6	30841	30846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780773
503	NC_015850	GTG	2	6	30854	30859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780773
504	NC_015850	CGC	2	6	30869	30874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780773
505	NC_015850	TCC	2	6	30876	30881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780773
506	NC_015850	ACC	2	6	31019	31024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780774
507	NC_015850	TCC	2	6	31141	31146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780774
508	NC_015850	GGC	2	6	31175	31180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780774
509	NC_015850	TCA	2	6	31184	31189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780774
510	NC_015850	CGC	2	6	31233	31238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780774
511	NC_015850	GGC	2	6	31248	31253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780774
512	NC_015850	CGA	2	6	31311	31316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780774
513	NC_015850	CGG	2	6	31325	31330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780774
514	NC_015850	GCG	2	6	31344	31349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780774
515	NC_015850	CGA	2	6	31389	31394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780774
516	NC_015850	GGC	2	6	31405	31410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780774
517	NC_015850	AGC	2	6	31466	31471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780774
518	NC_015850	CAA	2	6	31514	31519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780775
519	NC_015850	CAT	2	6	31603	31608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780775
520	NC_015850	CGG	2	6	31681	31686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780775
521	NC_015850	CGT	2	6	31771	31776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780775
522	NC_015850	GCT	2	6	31819	31824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780775
523	NC_015850	GTG	2	6	31832	31837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780775
524	NC_015850	GTG	2	6	31919	31924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780775
525	NC_015850	ATC	2	6	32012	32017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780775
526	NC_015850	CAT	2	6	32059	32064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780775
527	NC_015850	GGT	2	6	32134	32139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780775
528	NC_015850	ACC	2	6	32174	32179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780775
529	NC_015850	GTG	2	6	32180	32185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780775
530	NC_015850	ACG	2	6	32292	32297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780775
531	NC_015850	CTG	3	9	32336	32344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780775
532	NC_015850	CCG	2	6	32351	32356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780775
533	NC_015850	CAT	2	6	32497	32502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780775
534	NC_015850	ATC	2	6	32666	32671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780775
535	NC_015850	AAG	2	6	32672	32677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780775
536	NC_015850	GGC	2	6	32681	32686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780775
537	NC_015850	GGC	2	6	32722	32727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780775
538	NC_015850	CAG	2	6	32866	32871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780775
539	NC_015850	TCT	2	6	32956	32961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780775
540	NC_015850	GAA	2	6	32977	32982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780775
541	NC_015850	AGC	3	9	33003	33011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780775
542	NC_015850	CGG	2	6	33018	33023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780775
543	NC_015850	CTA	2	6	33049	33054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780775
544	NC_015850	TGG	2	6	33141	33146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780776
545	NC_015850	GCG	2	6	33160	33165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780776
546	NC_015850	GGA	2	6	33268	33273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780776
547	NC_015850	GTG	2	6	33302	33307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780776
548	NC_015850	GCG	2	6	33327	33332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780776
549	NC_015850	GTC	2	6	33359	33364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780776
550	NC_015850	GCA	2	6	33420	33425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780776
551	NC_015850	GCC	2	6	33444	33449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780776
552	NC_015850	TGG	2	6	33462	33467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780776
553	NC_015850	GTC	2	6	33563	33568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780776
554	NC_015850	TCG	2	6	33578	33583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780776
555	NC_015850	TCA	2	6	33588	33593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780776
556	NC_015850	AGC	2	6	33621	33626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780776
557	NC_015850	TGC	2	6	33627	33632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780776
558	NC_015850	TTG	2	6	33722	33727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780776
559	NC_015850	GGT	2	6	33745	33750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780776
560	NC_015850	ACA	2	6	33861	33866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780776
561	NC_015850	GGC	2	6	33877	33882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780776
562	NC_015850	GCG	3	9	33917	33925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780776
563	NC_015850	AGC	2	6	33976	33981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780777
564	NC_015850	GTC	2	6	34076	34081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780777
565	NC_015850	CAT	2	6	34240	34245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780777
566	NC_015850	GGC	2	6	34339	34344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780777
567	NC_015850	CGG	2	6	34426	34431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780777
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570	NC_015850	CGA	2	6	34675	34680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780777
571	NC_015850	ACA	2	6	34707	34712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780777
572	NC_015850	GGA	2	6	34798	34803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780777
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575	NC_015850	CAT	2	6	35098	35103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780777
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577	NC_015850	CTT	2	6	35191	35196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780777
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579	NC_015850	CGA	2	6	35329	35334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780777
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581	NC_015850	GCA	2	6	35418	35423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780778
582	NC_015850	GCC	2	6	35435	35440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780778
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589	NC_015850	CGG	2	6	35676	35681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780778
590	NC_015850	CAG	2	6	35696	35701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780778
591	NC_015850	GCA	2	6	35723	35728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780778
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593	NC_015850	CTG	2	6	36065	36070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780779
594	NC_015850	TGG	2	6	36182	36187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780779
595	NC_015850	GCC	4	12	36224	36235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780779
596	NC_015850	CTG	2	6	36287	36292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780779
597	NC_015850	TGA	2	6	36486	36491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780779
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599	NC_015850	CGT	2	6	36571	36576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780779
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601	NC_015850	GAC	2	6	36881	36886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780779
602	NC_015850	CGT	2	6	36979	36984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780779
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606	NC_015850	CAA	2	6	37141	37146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780779
607	NC_015850	GCA	2	6	37242	37247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780779
608	NC_015850	TCG	2	6	37379	37384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780780
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610	NC_015850	GCA	2	6	37565	37570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780780
611	NC_015850	CGG	2	6	37602	37607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780780
612	NC_015850	GTC	2	6	37609	37614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780780
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615	NC_015850	CGT	2	6	37656	37661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780780
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619	NC_015850	CTG	2	6	37909	37914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780780
620	NC_015850	GGT	2	6	38055	38060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780780
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622	NC_015850	GAG	2	6	38476	38481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780780
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998	NC_015850	CGC	2	6	65842	65847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780803
999	NC_015850	ATC	2	6	65877	65882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780803
1000	NC_015850	CCA	2	6	66097	66102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780803

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