MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 32908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015574	TAT	2	6	41	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015574	GGA	2	6	101	106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015574	AAT	2	6	119	124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986243
4	NC_015574	CTG	2	6	166	171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986243
5	NC_015574	CAG	2	6	181	186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986243
6	NC_015574	CCA	2	6	193	198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986243
7	NC_015574	AGA	2	6	204	209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986243
8	NC_015574	CAA	2	6	244	249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986243
9	NC_015574	AGA	2	6	265	270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986243
10	NC_015574	GCT	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986243
11	NC_015574	AAC	2	6	746	751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986243
12	NC_015574	GAG	2	6	816	821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986243
13	NC_015574	ATC	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986243
14	NC_015574	GGA	2	6	881	886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986243
15	NC_015574	GCA	2	6	980	985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986244
16	NC_015574	GAA	2	6	992	997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986244
17	NC_015574	GAA	2	6	1019	1024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986244
18	NC_015574	ATG	2	6	1137	1142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986244
19	NC_015574	TGA	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986244
20	NC_015574	AAT	2	6	1560	1565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015574	ACA	3	9	1670	1678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986245
22	NC_015574	GCA	2	6	1796	1801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986245
23	NC_015574	GCA	2	6	1838	1843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986245
24	NC_015574	TCA	2	6	1859	1864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986245
25	NC_015574	CAT	3	9	1878	1886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986245
26	NC_015574	TCA	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986245
27	NC_015574	ATG	2	6	2186	2191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986245
28	NC_015574	TGG	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986245
29	NC_015574	TCA	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986245
30	NC_015574	CCA	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986245
31	NC_015574	ATG	2	6	2410	2415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986245
32	NC_015574	TTG	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986245
33	NC_015574	TTC	2	6	2485	2490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986245
34	NC_015574	TTG	2	6	2561	2566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986245
35	NC_015574	CTT	2	6	2716	2721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986245
36	NC_015574	GTT	2	6	2753	2758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015574	ATA	3	9	2837	2845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015574	AAT	2	6	2878	2883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015574	GAT	2	6	2937	2942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986246
40	NC_015574	CAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986246
41	NC_015574	ACA	2	6	3002	3007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986246
42	NC_015574	TGG	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986246
43	NC_015574	TAA	2	6	3207	3212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986246
44	NC_015574	ACA	3	9	3371	3379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986246
45	NC_015574	CAT	2	6	3402	3407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986246
46	NC_015574	AAG	2	6	3428	3433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986246
47	NC_015574	GTA	2	6	3492	3497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015574	GCT	2	6	3574	3579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986247
49	NC_015574	AGC	2	6	3583	3588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986247
50	NC_015574	TTC	2	6	3591	3596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986247
51	NC_015574	ACT	2	6	3674	3679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986247
52	NC_015574	AAT	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986247
53	NC_015574	ATT	2	6	4275	4280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986247
54	NC_015574	TAT	2	6	4305	4310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986247
55	NC_015574	CTG	2	6	4318	4323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986247
56	NC_015574	GAT	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986247
57	NC_015574	AAG	2	6	4771	4776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986247
58	NC_015574	GAA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986247
59	NC_015574	GGA	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986247
60	NC_015574	AAG	2	6	5041	5046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986247
61	NC_015574	AGA	2	6	5178	5183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986247
62	NC_015574	AAC	2	6	5197	5202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986247
63	NC_015574	ATT	2	6	5216	5221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986247
64	NC_015574	GCC	2	6	5287	5292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333986247
65	NC_015574	GGA	2	6	5302	5307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986247
66	NC_015574	GGA	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986247
67	NC_015574	CTT	2	6	5374	5379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015574	TTA	2	6	5466	5471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015574	CAA	2	6	5502	5507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015574	TAC	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015574	AGT	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986248
72	NC_015574	AAC	2	6	5580	5585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986248
73	NC_015574	AAT	2	6	5598	5603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986248
74	NC_015574	AAT	2	6	5617	5622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986248
75	NC_015574	TGC	2	6	5919	5924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986248
76	NC_015574	AAG	2	6	6023	6028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986248
77	NC_015574	TCC	2	6	6140	6145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986248
78	NC_015574	TAC	2	6	6316	6321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986248
79	NC_015574	CAA	2	6	6348	6353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986248
80	NC_015574	GGA	2	6	6424	6429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986248
81	NC_015574	ACA	2	6	6653	6658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986248
82	NC_015574	GCA	2	6	6850	6855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986248
83	NC_015574	GCA	2	6	6889	6894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986248
84	NC_015574	ATT	2	6	6939	6944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015574	AAT	2	6	7073	7078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986249
86	NC_015574	ATC	2	6	7098	7103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986249
87	NC_015574	AGC	2	6	7325	7330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986249
88	NC_015574	CAT	2	6	7409	7414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986249
89	NC_015574	GGA	2	6	7485	7490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986249
90	NC_015574	TGA	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986249
91	NC_015574	TGG	2	6	7586	7591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986249
92	NC_015574	GCT	2	6	7782	7787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986249
93	NC_015574	GCA	2	6	7856	7861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986249
94	NC_015574	GGT	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986249
95	NC_015574	TGT	2	6	7994	7999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986249
96	NC_015574	AAC	2	6	8010	8015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986249
97	NC_015574	AAG	2	6	8058	8063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986249
98	NC_015574	ATT	2	6	8129	8134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015574	ATT	2	6	8308	8313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015574	ATG	2	6	8323	8328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015574	TTA	2	6	8356	8361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986250
102	NC_015574	TGA	2	6	8405	8410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986250
103	NC_015574	AGA	2	6	8471	8476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986250
104	NC_015574	GAA	2	6	8481	8486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986250
105	NC_015574	GCT	2	6	8514	8519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986250
106	NC_015574	TCA	2	6	8530	8535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986250
107	NC_015574	GCT	2	6	8547	8552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986250
108	NC_015574	ATT	2	6	8576	8581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986250
109	NC_015574	AAT	2	6	8603	8608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986250
110	NC_015574	AAG	2	6	8702	8707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986250
111	NC_015574	CAT	2	6	8734	8739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986250
112	NC_015574	GCA	2	6	8766	8771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986250
113	NC_015574	AGC	3	9	8816	8824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986250
114	NC_015574	AGC	3	9	8882	8890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986250
115	NC_015574	GCA	2	6	8928	8933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986250
116	NC_015574	CGC	2	6	9056	9061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333986250
117	NC_015574	AAC	2	6	9140	9145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986250
118	NC_015574	TCC	2	6	9173	9178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015574	GCT	2	6	9194	9199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015574	ATG	2	6	9470	9475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015574	AGC	2	6	9567	9572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986251
122	NC_015574	GGA	2	6	9757	9762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986251
123	NC_015574	AGA	2	6	9843	9848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986251
124	NC_015574	ATT	2	6	9849	9854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986251
125	NC_015574	TGG	2	6	9890	9895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986251
126	NC_015574	GAA	2	6	9965	9970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986251
127	NC_015574	ATA	2	6	10015	10020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986251
128	NC_015574	AAC	2	6	10303	10308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986251
129	NC_015574	GGT	2	6	10315	10320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986251
130	NC_015574	GAA	2	6	10429	10434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986251
131	NC_015574	AAC	2	6	10912	10917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986252
132	NC_015574	AAT	2	6	11035	11040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986252
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140	NC_015574	TTG	2	6	11590	11595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015574	TAT	2	6	11736	11741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_015574	GTA	2	6	20004	20009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986260
260	NC_015574	GTA	2	6	20070	20075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986260
261	NC_015574	CTT	2	6	20258	20263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986260
262	NC_015574	CTG	2	6	20300	20305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986260
263	NC_015574	TGT	2	6	20309	20314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986260
264	NC_015574	CTT	2	6	20439	20444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_015574	TAA	2	6	20551	20556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_015574	TCT	2	6	20641	20646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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299	NC_015574	TAA	2	6	22798	22803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_015574	TGG	2	6	40083	40088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986279
500	NC_015574	GGA	2	6	40229	40234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986279

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