MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 32908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015574	TTA	2	6	311687	311692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_015574	TTA	2	6	311791	311796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015574	AAC	2	6	311918	311923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986515
4004	NC_015574	ATT	2	6	311943	311948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986515
4005	NC_015574	TAT	2	6	312007	312012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986515
4006	NC_015574	CGG	2	6	312031	312036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986515
4007	NC_015574	AAG	2	6	312162	312167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986515
4008	NC_015574	ATC	2	6	312337	312342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986515
4009	NC_015574	TAT	2	6	312374	312379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986515
4010	NC_015574	ACA	2	6	312435	312440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986515
4011	NC_015574	AGA	2	6	312555	312560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_015574	GTT	2	6	312575	312580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_015574	CAA	2	6	312595	312600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_015574	ACA	2	6	312604	312609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_015574	TGG	2	6	312801	312806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986516
4016	NC_015574	TCT	2	6	312811	312816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986516
4017	NC_015574	GAA	2	6	312870	312875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986516
4018	NC_015574	CTT	2	6	312922	312927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986516
4019	NC_015574	TTC	2	6	312933	312938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986516
4020	NC_015574	CCT	2	6	312990	312995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986516
4021	NC_015574	TCA	2	6	313039	313044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986516
4022	NC_015574	CAT	2	6	313091	313096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_015574	ACC	2	6	313208	313213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_015574	ATT	2	6	313221	313226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_015574	TAT	3	9	313238	313246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015574	TAC	2	6	313333	313338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_015574	CGA	2	6	313512	313517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_015574	GAA	2	6	313678	313683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986517
4029	NC_015574	TAT	2	6	313689	313694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986517
4030	NC_015574	TAT	2	6	313699	313704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986517
4031	NC_015574	ATT	2	6	313769	313774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986517
4032	NC_015574	TCC	2	6	313826	313831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986517
4033	NC_015574	CCT	2	6	313850	313855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986517
4034	NC_015574	AAT	2	6	314072	314077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986517
4035	NC_015574	CAA	2	6	314119	314124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986517
4036	NC_015574	ATT	2	6	314345	314350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_015574	AAT	2	6	314405	314410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_015574	TAA	2	6	314528	314533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_015574	AGA	2	6	314591	314596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_015574	TTA	2	6	314624	314629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015574	GTT	2	6	314688	314693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_015574	TCT	2	6	314888	314893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986518
4043	NC_015574	GGT	2	6	315127	315132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986518
4044	NC_015574	CAT	2	6	315177	315182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986518
4045	NC_015574	TAT	2	6	315451	315456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_015574	ATT	2	6	315503	315508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_015574	ATT	2	6	315534	315539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_015574	GAT	2	6	315743	315748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_015574	AAC	2	6	315794	315799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_015574	ATT	2	6	315811	315816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015574	GTT	2	6	315853	315858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_015574	CTG	2	6	315934	315939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986519
4053	NC_015574	TCT	2	6	315966	315971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986519
4054	NC_015574	ATA	2	6	316166	316171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986519
4055	NC_015574	CGT	2	6	316203	316208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986519
4056	NC_015574	TTC	2	6	316234	316239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986519
4057	NC_015574	CAT	2	6	316404	316409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986519
4058	NC_015574	CTG	2	6	316500	316505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986519
4059	NC_015574	TCT	2	6	316511	316516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986519
4060	NC_015574	CTG	2	6	316591	316596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986519
4061	NC_015574	GTA	2	6	316630	316635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986519
4062	NC_015574	GTA	2	6	316771	316776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986519
4063	NC_015574	CAT	2	6	316785	316790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986519
4064	NC_015574	TAT	2	6	316861	316866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986519
4065	NC_015574	TTG	2	6	316917	316922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986519
4066	NC_015574	GGC	2	6	317003	317008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986520
4067	NC_015574	CTT	2	6	317062	317067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986520
4068	NC_015574	ATT	2	6	317343	317348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986520
4069	NC_015574	ACC	2	6	317370	317375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986520
4070	NC_015574	TAT	2	6	317411	317416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986520
4071	NC_015574	CTC	2	6	317425	317430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986520
4072	NC_015574	TGG	2	6	317452	317457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986520
4073	NC_015574	CAA	2	6	317464	317469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986520
4074	NC_015574	TTC	2	6	317591	317596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986520
4075	NC_015574	TTA	2	6	317619	317624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986520
4076	NC_015574	TCA	2	6	317745	317750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986520
4077	NC_015574	TTC	2	6	317884	317889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986520
4078	NC_015574	CTG	2	6	318143	318148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986520
4079	NC_015574	CAG	2	6	318319	318324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986520
4080	NC_015574	TCT	2	6	318407	318412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986520
4081	NC_015574	CCT	3	9	318482	318490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_015574	TAA	2	6	318582	318587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_015574	ATA	2	6	318593	318598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_015574	TCT	2	6	318625	318630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986521
4085	NC_015574	ATC	2	6	318721	318726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986521
4086	NC_015574	CTT	2	6	318734	318739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986521
4087	NC_015574	TAT	2	6	318852	318857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986521
4088	NC_015574	TAT	2	6	318915	318920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986521
4089	NC_015574	ATC	2	6	318933	318938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986521
4090	NC_015574	GTG	2	6	319040	319045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986521
4091	NC_015574	TCT	2	6	319108	319113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986521
4092	NC_015574	TGT	2	6	319200	319205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_015574	ATA	2	6	319210	319215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015574	CAT	2	6	319412	319417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986522
4095	NC_015574	CTA	2	6	319490	319495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986522
4096	NC_015574	CTT	2	6	319559	319564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986522
4097	NC_015574	ATT	2	6	319593	319598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986522
4098	NC_015574	TGA	2	6	319682	319687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986522
4099	NC_015574	TTG	2	6	319696	319701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986522
4100	NC_015574	ATA	2	6	319737	319742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986522
4101	NC_015574	GAT	2	6	319762	319767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986522
4102	NC_015574	CTT	2	6	319832	319837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986522
4103	NC_015574	ACA	2	6	319973	319978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986522
4104	NC_015574	ATC	3	9	319989	319997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986522
4105	NC_015574	CTC	2	6	320027	320032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_015574	TAT	2	6	320080	320085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_015574	TAA	2	6	320168	320173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_015574	TAA	2	6	320197	320202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_015574	TCG	2	6	320293	320298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986523
4110	NC_015574	ACT	2	6	320443	320448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986523
4111	NC_015574	CTC	2	6	320528	320533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_015574	CTT	2	6	320534	320539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_015574	ATT	2	6	320544	320549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_015574	TTG	2	6	320662	320667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_015574	TAT	2	6	320722	320727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_015574	TTA	2	6	320749	320754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_015574	TTG	2	6	320765	320770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_015574	ATA	2	6	320882	320887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_015574	ACA	2	6	320916	320921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_015574	TAA	2	6	320947	320952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_015574	AGA	2	6	321136	321141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986524
4122	NC_015574	CAG	2	6	321172	321177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986524
4123	NC_015574	GTT	2	6	321359	321364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986524
4124	NC_015574	AAT	2	6	321398	321403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986524
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4132	NC_015574	TAA	2	6	322374	322379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_015574	GGT	2	6	322396	322401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4239	NC_015574	TAT	2	6	331086	331091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_015574	GTA	2	6	331432	331437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986533
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4246	NC_015574	TTG	2	6	331778	331783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986533
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