MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 32908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_015574	GAA	2	6	392106	392111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986587
5003	NC_015574	TTG	2	6	392137	392142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986587
5004	NC_015574	TGA	2	6	392168	392173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986587
5005	NC_015574	TGG	2	6	392200	392205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986587
5006	NC_015574	TCT	2	6	392292	392297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986587
5007	NC_015574	TTG	2	6	392503	392508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986587
5008	NC_015574	GAA	2	6	392578	392583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986587
5009	NC_015574	TCC	2	6	392607	392612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986587
5010	NC_015574	GCA	2	6	392652	392657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986587
5011	NC_015574	TGA	2	6	392693	392698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986587
5012	NC_015574	AGT	2	6	392712	392717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986587
5013	NC_015574	GGT	2	6	392775	392780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986587
5014	NC_015574	TAT	2	6	392786	392791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986587
5015	NC_015574	GGA	2	6	393090	393095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986587
5016	NC_015574	CAT	2	6	393200	393205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986587
5017	NC_015574	CTG	2	6	393394	393399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986587
5018	NC_015574	TGG	2	6	393464	393469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986587
5019	NC_015574	ATG	2	6	393522	393527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986587
5020	NC_015574	TGT	2	6	393586	393591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986587
5021	NC_015574	TGG	2	6	393593	393598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986587
5022	NC_015574	AAG	2	6	393601	393606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986587
5023	NC_015574	AGA	2	6	393731	393736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986587
5024	NC_015574	CTT	2	6	393765	393770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986587
5025	NC_015574	GAG	2	6	393781	393786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986587
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5027	NC_015574	AAG	2	6	393943	393948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986587
5028	NC_015574	AGT	2	6	393992	393997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986587
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5030	NC_015574	CTT	2	6	394032	394037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_015574	ATA	2	6	394059	394064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_015574	TAA	2	6	394236	394241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_015574	ATA	2	6	394252	394257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_015574	ATT	2	6	394266	394271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_015574	GAA	2	6	394352	394357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_015574	TGA	2	6	394427	394432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986588
5037	NC_015574	ATC	2	6	394655	394660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986588
5038	NC_015574	AGG	2	6	394683	394688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986588
5039	NC_015574	AGA	2	6	394947	394952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986588
5040	NC_015574	AAG	2	6	394984	394989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_015574	TCA	2	6	395034	395039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986589
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5044	NC_015574	TAG	2	6	395148	395153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986589
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5047	NC_015574	ATT	2	6	395457	395462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_015574	ATG	2	6	395470	395475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_015574	TTC	2	6	395538	395543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_015574	TAT	2	6	395595	395600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_015574	ATA	2	6	395612	395617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_015574	ACT	2	6	395620	395625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_015574	TGC	2	6	395823	395828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986590
5054	NC_015574	AGG	2	6	395982	395987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986590
5055	NC_015574	TTC	2	6	396034	396039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_015574	TAA	2	6	396149	396154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_015574	TAA	2	6	396207	396212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_015574	TTG	2	6	396396	396401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986591
5059	NC_015574	ATC	2	6	396527	396532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986591
5060	NC_015574	TCA	2	6	396573	396578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986591
5061	NC_015574	TGT	2	6	396655	396660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986591
5062	NC_015574	CAA	2	6	396724	396729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986591
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5064	NC_015574	TTG	2	6	396786	396791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986591
5065	NC_015574	TTG	2	6	396813	396818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986591
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5070	NC_015574	TTC	2	6	397320	397325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986591
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5073	NC_015574	TTC	2	6	397448	397453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_015574	TTC	2	6	397488	397493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_015574	TTA	2	6	397517	397522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_015574	TAA	2	6	397557	397562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5107	NC_015574	TGA	2	6	399915	399920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986594
5108	NC_015574	GCA	2	6	399923	399928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986594
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5111	NC_015574	ATT	2	6	400208	400213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_015574	AAC	2	6	400538	400543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986595
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5486	NC_015574	ATG	2	6	427507	427512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986623
5487	NC_015574	ACA	2	6	427555	427560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986623
5488	NC_015574	AAG	2	6	427577	427582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986623
5489	NC_015574	AGA	2	6	427645	427650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986623
5490	NC_015574	TAG	2	6	427664	427669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986623
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5492	NC_015574	GAA	2	6	428008	428013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986623
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5494	NC_015574	ATA	2	6	428072	428077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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