MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 32908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015574	GCA	2	6	194442	194447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986409
2502	NC_015574	AAT	2	6	194630	194635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986409
2503	NC_015574	GTG	2	6	194655	194660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986409
2504	NC_015574	TTC	2	6	194789	194794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986409
2505	NC_015574	ATC	2	6	194825	194830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_015574	TTA	2	6	194854	194859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_015574	ATT	2	6	194860	194865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_015574	ATA	2	6	195062	195067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_015574	GCA	2	6	195194	195199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986410
2510	NC_015574	ATC	2	6	195297	195302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986410
2511	NC_015574	CCA	2	6	195358	195363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986410
2512	NC_015574	GAA	2	6	195777	195782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986410
2513	NC_015574	TCT	2	6	195809	195814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986410
2514	NC_015574	AGC	2	6	195821	195826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986410
2515	NC_015574	ATG	2	6	195880	195885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986410
2516	NC_015574	TTG	2	6	195931	195936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986410
2517	NC_015574	AGA	2	6	196024	196029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986410
2518	NC_015574	AAG	2	6	196039	196044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986410
2519	NC_015574	GCA	3	9	196128	196136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986410
2520	NC_015574	GCT	2	6	196233	196238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986410
2521	NC_015574	AGC	2	6	196241	196246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986410
2522	NC_015574	GAG	2	6	196389	196394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986410
2523	NC_015574	TTA	2	6	196513	196518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_015574	CTT	2	6	196610	196615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_015574	GCA	2	6	196747	196752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986411
2526	NC_015574	GAA	2	6	196835	196840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986411
2527	NC_015574	AGA	2	6	196906	196911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986411
2528	NC_015574	TTG	2	6	196950	196955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986411
2529	NC_015574	GTG	2	6	197018	197023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986412
2530	NC_015574	GAT	2	6	197038	197043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986412
2531	NC_015574	TGA	2	6	197358	197363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986412
2532	NC_015574	CAA	2	6	197395	197400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986412
2533	NC_015574	GAA	2	6	197473	197478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986412
2534	NC_015574	CTG	2	6	197542	197547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_015574	TAT	2	6	197611	197616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_015574	TAA	2	6	197788	197793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_015574	ACT	2	6	197853	197858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_015574	TGG	2	6	197930	197935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986413
2539	NC_015574	GAT	2	6	197974	197979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986413
2540	NC_015574	GAA	2	6	198042	198047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986413
2541	NC_015574	ATA	2	6	198190	198195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986413
2542	NC_015574	TTA	2	6	198278	198283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986413
2543	NC_015574	ATC	2	6	198399	198404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986413
2544	NC_015574	ATT	2	6	198429	198434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986413
2545	NC_015574	AAT	2	6	198451	198456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986413
2546	NC_015574	GAG	2	6	198481	198486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986413
2547	NC_015574	TTC	2	6	198589	198594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986413
2548	NC_015574	TAA	2	6	198769	198774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986413
2549	NC_015574	ATT	2	6	198847	198852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_015574	TAA	2	6	198885	198890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_015574	TTA	2	6	198937	198942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_015574	ATA	2	6	198989	198994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_015574	ATA	2	6	199003	199008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_015574	TTA	2	6	199116	199121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986414
2555	NC_015574	AAT	2	6	199192	199197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986414
2556	NC_015574	TGA	2	6	199266	199271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986414
2557	NC_015574	GAT	2	6	199308	199313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986414
2558	NC_015574	CAT	2	6	199427	199432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986414
2559	NC_015574	ATA	2	6	199606	199611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986414
2560	NC_015574	AGA	2	6	199651	199656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986414
2561	NC_015574	GAA	2	6	199660	199665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986414
2562	NC_015574	GGT	2	6	199751	199756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986414
2563	NC_015574	ATG	2	6	199943	199948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986414
2564	NC_015574	GAA	2	6	200017	200022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986414
2565	NC_015574	ACA	2	6	200057	200062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986414
2566	NC_015574	ATT	2	6	200302	200307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986414
2567	NC_015574	ATA	2	6	200387	200392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986414
2568	NC_015574	GAG	2	6	200611	200616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986414
2569	NC_015574	TGT	2	6	200624	200629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986414
2570	NC_015574	TAA	2	6	200712	200717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986414
2571	NC_015574	ATG	2	6	200768	200773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986414
2572	NC_015574	AAT	2	6	200799	200804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986414
2573	NC_015574	TGA	2	6	200862	200867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986414
2574	NC_015574	GAC	2	6	201022	201027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986414
2575	NC_015574	AAT	2	6	201169	201174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986414
2576	NC_015574	TCT	2	6	201337	201342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_015574	ATT	2	6	201366	201371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_015574	ATT	3	9	201376	201384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_015574	TAA	2	6	201394	201399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_015574	ACA	2	6	201436	201441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_015574	AAT	2	6	201575	201580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_015574	TAT	2	6	201758	201763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986415
2583	NC_015574	GAA	2	6	201928	201933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986415
2584	NC_015574	GAA	2	6	201954	201959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986415
2585	NC_015574	CTT	2	6	201978	201983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986415
2586	NC_015574	TGA	2	6	202019	202024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986415
2587	NC_015574	CTC	2	6	202077	202082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986415
2588	NC_015574	AGC	2	6	202090	202095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986415
2589	NC_015574	TAA	2	6	202150	202155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986415
2590	NC_015574	AAG	2	6	202191	202196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986415
2591	NC_015574	AGA	2	6	202268	202273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986415
2592	NC_015574	TTG	2	6	202384	202389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986415
2593	NC_015574	GAA	2	6	202404	202409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986415
2594	NC_015574	AGA	2	6	202502	202507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986415
2595	NC_015574	ATG	2	6	202537	202542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986415
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2597	NC_015574	TTG	2	6	202672	202677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986415
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2599	NC_015574	AGG	2	6	202743	202748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986415
2600	NC_015574	TAC	2	6	202812	202817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986415
2601	NC_015574	GAG	2	6	202845	202850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986415
2602	NC_015574	ACA	2	6	202920	202925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986415
2603	NC_015574	GAA	2	6	202929	202934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986415
2604	NC_015574	TTG	2	6	203086	203091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986415
2605	NC_015574	GAG	2	6	203111	203116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986415
2606	NC_015574	GCA	2	6	203187	203192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986415
2607	NC_015574	GAT	2	6	203202	203207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986415
2608	NC_015574	GAA	2	6	203252	203257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986415
2609	NC_015574	AAT	2	6	203288	203293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986415
2610	NC_015574	TGT	2	6	203363	203368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986415
2611	NC_015574	AGA	2	6	203381	203386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986415
2612	NC_015574	TGA	2	6	203396	203401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986415
2613	NC_015574	AAG	2	6	203437	203442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986415
2614	NC_015574	TAC	2	6	203479	203484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_015574	TTA	2	6	203564	203569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_015574	GTT	2	6	203790	203795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_015574	TAT	2	6	203845	203850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_015574	ATA	2	6	203869	203874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_015574	CGA	2	6	204064	204069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986416
2620	NC_015574	GTT	2	6	204089	204094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986416
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2622	NC_015574	AGC	2	6	204237	204242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986416
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2984	NC_015574	TAT	2	6	234529	234534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986443
2985	NC_015574	ATT	3	9	234593	234601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986443
2986	NC_015574	TGA	2	6	234612	234617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986443
2987	NC_015574	GCT	2	6	234652	234657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986443
2988	NC_015574	TCG	2	6	234701	234706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986443
2989	NC_015574	TGG	2	6	234827	234832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986443
2990	NC_015574	GTT	2	6	234968	234973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986443
2991	NC_015574	ACT	2	6	235052	235057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986443
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