MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 32908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015574	TTC	2	6	235605	235610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986443
3002	NC_015574	TGT	2	6	235746	235751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986443
3003	NC_015574	ATT	2	6	235754	235759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986443
3004	NC_015574	CAC	2	6	235824	235829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986443
3005	NC_015574	TTC	2	6	235830	235835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986443
3006	NC_015574	ACC	2	6	235946	235951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_015574	CCT	2	6	236125	236130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986444
3008	NC_015574	TTA	2	6	236252	236257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986444
3009	NC_015574	CTT	2	6	236414	236419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986444
3010	NC_015574	TTA	2	6	236546	236551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986444
3011	NC_015574	TCT	2	6	236656	236661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986444
3012	NC_015574	ATT	2	6	236692	236697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986444
3013	NC_015574	TGT	2	6	236729	236734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986444
3014	NC_015574	ATG	2	6	236765	236770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986444
3015	NC_015574	ACC	2	6	236832	236837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_015574	ATA	2	6	236846	236851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_015574	TTA	2	6	236859	236864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015574	TAA	2	6	236955	236960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015574	TTA	2	6	236967	236972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_015574	AAC	2	6	236990	236995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_015574	ATT	2	6	237031	237036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_015574	TTC	2	6	237086	237091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986445
3023	NC_015574	TGC	2	6	237157	237162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986445
3024	NC_015574	CAG	2	6	237168	237173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986445
3025	NC_015574	ATT	2	6	237233	237238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986445
3026	NC_015574	GAA	2	6	237298	237303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986445
3027	NC_015574	CTC	2	6	237507	237512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986445
3028	NC_015574	GCA	2	6	237566	237571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986445
3029	NC_015574	GAA	2	6	237685	237690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986445
3030	NC_015574	CCT	2	6	237698	237703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986445
3031	NC_015574	CAT	2	6	237867	237872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986446
3032	NC_015574	ACA	3	9	237907	237915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986446
3033	NC_015574	CTA	2	6	237965	237970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986446
3034	NC_015574	CCA	2	6	238075	238080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986446
3035	NC_015574	ACC	2	6	238186	238191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986446
3036	NC_015574	CTT	2	6	238199	238204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986446
3037	NC_015574	TGT	2	6	238241	238246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986446
3038	NC_015574	TTC	2	6	238341	238346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986446
3039	NC_015574	AAC	2	6	238401	238406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986446
3040	NC_015574	TGA	2	6	238562	238567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986446
3041	NC_015574	CTG	2	6	238601	238606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986446
3042	NC_015574	AAC	2	6	238647	238652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986446
3043	NC_015574	TAT	2	6	238823	238828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_015574	TGT	2	6	238942	238947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015574	GAA	2	6	239030	239035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986447
3046	NC_015574	TGC	2	6	239119	239124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986447
3047	NC_015574	TGG	2	6	239154	239159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986447
3048	NC_015574	GCA	2	6	239306	239311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986447
3049	NC_015574	TAT	2	6	239467	239472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986447
3050	NC_015574	CAA	2	6	239499	239504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986447
3051	NC_015574	TTA	2	6	239700	239705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986447
3052	NC_015574	TTA	2	6	239848	239853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_015574	GCT	2	6	240002	240007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986448
3054	NC_015574	ACC	2	6	240040	240045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986448
3055	NC_015574	TAT	2	6	240049	240054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986448
3056	NC_015574	TGC	2	6	240061	240066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986448
3057	NC_015574	GCA	2	6	240071	240076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986448
3058	NC_015574	GCT	2	6	240134	240139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986448
3059	NC_015574	CTT	2	6	240144	240149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986448
3060	NC_015574	TAC	2	6	240214	240219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986448
3061	NC_015574	TGT	2	6	240237	240242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986448
3062	NC_015574	CGT	2	6	240363	240368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986448
3063	NC_015574	GTT	2	6	240723	240728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986449
3064	NC_015574	ATG	2	6	240765	240770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986449
3065	NC_015574	GTA	2	6	240911	240916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986449
3066	NC_015574	GGT	2	6	240959	240964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986449
3067	NC_015574	GGC	2	6	240977	240982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986449
3068	NC_015574	TTG	2	6	241062	241067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986449
3069	NC_015574	ATT	2	6	241155	241160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_015574	ATT	2	6	241255	241260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986450
3071	NC_015574	AAG	2	6	241326	241331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986450
3072	NC_015574	TCT	2	6	241436	241441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986450
3073	NC_015574	TAG	2	6	241535	241540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986450
3074	NC_015574	TGA	2	6	241541	241546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986450
3075	NC_015574	TTG	3	9	241571	241579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986450
3076	NC_015574	GTG	2	6	241649	241654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986450
3077	NC_015574	ATT	2	6	241783	241788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986450
3078	NC_015574	ACC	2	6	241839	241844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986450
3079	NC_015574	ATT	2	6	241873	241878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986450
3080	NC_015574	TGA	2	6	241912	241917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986450
3081	NC_015574	TTA	2	6	241961	241966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986450
3082	NC_015574	TCC	2	6	241980	241985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986450
3083	NC_015574	CAA	2	6	242226	242231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986451
3084	NC_015574	ATC	2	6	242260	242265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986451
3085	NC_015574	TAT	2	6	242353	242358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986451
3086	NC_015574	TCT	2	6	242403	242408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986451
3087	NC_015574	CTT	2	6	242519	242524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986451
3088	NC_015574	CTA	2	6	242652	242657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986451
3089	NC_015574	TTA	2	6	242682	242687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_015574	AAT	2	6	242702	242707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_015574	ATT	2	6	242744	242749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_015574	ATT	2	6	242799	242804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_015574	CCA	2	6	242829	242834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_015574	AAT	2	6	242892	242897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_015574	CTA	2	6	243052	243057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986452
3096	NC_015574	GCA	2	6	243060	243065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986452
3097	NC_015574	CAA	2	6	243073	243078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986452
3098	NC_015574	GTC	2	6	243089	243094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986452
3099	NC_015574	CTT	2	6	243118	243123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986452
3100	NC_015574	TCC	2	6	243161	243166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986452
3101	NC_015574	CAA	2	6	243169	243174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986452
3102	NC_015574	TGT	2	6	243181	243186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986452
3103	NC_015574	GCA	2	6	243267	243272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986452
3104	NC_015574	TTG	2	6	243312	243317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986452
3105	NC_015574	GCT	2	6	243339	243344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986452
3106	NC_015574	TGA	2	6	243368	243373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986452
3107	NC_015574	CGA	2	6	243454	243459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986452
3108	NC_015574	TGC	2	6	243608	243613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986452
3109	NC_015574	CAC	2	6	243716	243721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986452
3110	NC_015574	TTC	2	6	243853	243858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986452
3111	NC_015574	CTT	2	6	243874	243879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986452
3112	NC_015574	TCT	2	6	243906	243911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986452
3113	NC_015574	ACT	2	6	243924	243929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986452
3114	NC_015574	CTT	3	9	244048	244056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986452
3115	NC_015574	TCC	2	6	244087	244092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986453
3116	NC_015574	AAC	2	6	244216	244221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986453
3117	NC_015574	GGT	2	6	244290	244295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986453
3118	NC_015574	ATA	2	6	244410	244415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986453
3119	NC_015574	CAG	2	6	244494	244499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986453
3120	NC_015574	TAT	2	6	244581	244586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986453
3121	NC_015574	GTT	2	6	244602	244607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986453
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3126	NC_015574	ACA	2	6	244834	244839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3130	NC_015574	TTC	2	6	245268	245273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3133	NC_015574	ACT	2	6	245389	245394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3240	NC_015574	GGC	2	6	253901	253906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986463
3241	NC_015574	TGA	3	9	253925	253933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986463
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3485	NC_015574	CAA	2	6	273471	273476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986478
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